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陆菁: 作品数：17 被引量：67H指数：5; 供职机构：上海市疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家科技重大专项World Health Organization比尔和梅琳达·盖茨基金更多>>; 相关领域：医药卫生环境科学与工程更多>>

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上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态被引量：3: 2020年; 目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11,Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株,其中2012—2019年环境污水共分离到136株,其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快,有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链,即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年,环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型,从2016年开始,优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus,HEV)的循环状况,对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。; 李云逸陆菁杨玉颖费洁张莉萍李智胡家瑜李崇山; 关键词：基因特征

2015-2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征被引量：7: 2019年; 目的分析2015-2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)的分布特征,探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(AFP)病例监测中柯萨奇病毒B组5型(Cox B5)分离株之间的关系和变迁规律。方法选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点,每月采集监测点的污水进行浓缩富集,取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞(RD)和人喉癌上皮细胞(Hep-2)进行病毒分离。通过反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)获得VP1区序列并进行分析。结果 2015-2018年共采集污水样本84份,共分离242株NPEV,包含19个基因型,Cox B5为比例较高的基因型,占18.18%(44/242)。2015-2018年,环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链,即C3、C4和D3基因亚型。C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型,而D3基因亚型是2016-2018年新出现的传播链。结论 2015-2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO11、Cox B5、Cox B3和ECHO6。Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象。我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统,环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法。; 李云逸陆菁杨玉颖费洁张莉萍李智胡家瑜李崇山; 关键词：非脊髓灰质炎肠道病毒环境污水

上海市2007年脊髓灰质炎口服三价糖丸疫苗效价监测被引量：3: 2009年; [目的]了解上海市各区县免疫预防部门和提供免疫预防接种服务的医疗单位的脊髓灰质炎口服三价糖丸疫苗(脊灰疫苗)的有效性,为科学、系统地补充和更新冷链设备提供可靠的依据。[方法]采集上海市19个区和1个县疾控中心及距离各疾控中心近、中、远的疫苗服用点和本中心的脊灰疫苗共80份,用脊灰疫苗效价测定的方法对脊灰疫苗的效价进行测定。[结果]上海市所有疫苗采集点的脊灰疫苗效价全都合格。[结论]检测的脊灰疫苗质量较好,上海市免疫预防接种服务的医疗单位的冷链系统运转良好。; 刘敏勇丁晓光陆菁李崇山; 关键词：免疫预防冷链脊灰疫苗

上海市2007年维持无脊髓灰质炎证实工作进展: 2009年; 杨建萍胡家瑜李秀珠刘敏勇陆菁李崇山陶黎纳沈洁; 关键词：无脊髓灰质炎状态常规免疫查漏补种免疫策略基础免疫

一起水痘爆发的病毒分离鉴定及血清学分析被引量：5: 2009年; 目的对上海市闸北区2007年一起水痘爆发进行病原学鉴定和血清学分析。方法对采集的双份血清用酶联免疫吸附试验进行水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster Virus,VZV)IgM和IgG抗体检测,采用疫苗生产用的VZV敏感细胞--人胚肺成纤维细胞(MRC-5),对采集的疱疹液进行病毒分离以及标准血清中和鉴定,并通过特异性的引物对病毒分离株进行聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增。结果采集到的5例病人的双份血清中,急性期血清IgM阳性2份,IgG阳性1份,灰区2份;恢复期血清IgG均为阳性,其中4份标本IgG抗体滴度≥4倍升高。从采集的5份疱疹液标本中均分离到致细胞病变的病毒,经VZV标准血清中和鉴定,证实为VZV。PCR扩增产物电泳结果显示,在目的条带处均有单一的特异性条带。结论该次爆发是由VZV引起的,水痘减毒活疫苗(Varicella Virus Attenuated Live Vaccine,VarV)的作用已被证实,但该次水痘爆发中,47.4%的患者在出生后3年内曾接种过国产或者进口VarV,应深入研究VarV的免疫策略。; 陆菁李崇山胡家瑜汤素文毛乃颖丁晓光刘敏勇檀晓娟徐敏钢许文波; 关键词：水痘-带状疱疹病毒免疫策略

杂交探针技术结合熔解曲线快速鉴别水痘-带状疱疹病毒野毒株/疫苗株被引量：1: 2013年; 目的利用杂交探针结合熔解曲线分析技术，建立一种快速、可靠的适用于鉴别水痘一带状疱疹病毒（Varicella—zosterVirus，VZV）野毒株与疫苗株的方法。方法采集临床诊断为水痘患者的水疱液并进行病毒分离，抽提阳性分离物和部分阳性水疱液的基因组脱氧核糖核酸（DeoxyribonucleicAcid，DNA）。以荧光素Cy5．5标记检测探针5端，相应的锚定探针在3端用FAM羧基荧光索标记，再从研究对象基因组DNA中用聚合酶链反应（PolymeraseChainReac—tion，PCR）特异引物扩增ORF62基因中301碱基对（basepair，bp）片段，将其与特异探针杂交后，引发荧光共振能量转移，通过罗氏LightCycler实时PCR仪描绘扩增的目标DNA片段的熔解曲线，根据熔解温度（MeltingTemperature，Tm）峰值对待测标本进行鉴别。最后，用限制性片段长度多态性（RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLP）方法验证杂交探针结合熔解曲线鉴别野毒株／疫苗株的准确性。结果VZVOka疫苗株的扩增产物与检测探针的Tm为52．47℃，而水痘原始临床标本／临床分离株与检测探针的Tm在57．33℃～60．50℃。通过检测DNA扩增产物与VzVORF62探针Tm的差异可以明确鉴别VZV野毒株和疫苗株。利用杂交探针技术结合熔解曲线的方法对水痘原始临床标本及分离株进行野毒株／疫苗株的鉴别结果与传统的RFLP方法进行鉴别的结果完全一致。结论杂交探针技术结合熔解曲线操作简便省时，不易交叉污染；获得的病毒野毒株／疫苗株特征性强，适用于VZV野毒株／疫苗株在临床和流行病学调查中的快速鉴别诊断。; 王静刘景壹杨玉颖应颖吴强松陆菁李崇山孙晓冬; 关键词：水痘-带状疱疹病毒荧光共振能量转移熔解曲线聚合酶链反应-限制性片段长度多态性

2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布被引量：4: 2017年; 目的分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒（HEV）的时间分布特点及其基因分型。方法于2013—2014年，选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点，每月24—28日采集污水标本1份，每份1 L，共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩，再用牛肉汤洗脱，取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离，共分离HEV 249株，其中非脊髓灰质炎病毒（NPEV）185株，脊髓灰质炎病毒（PV）64株（均为疫苗相关株）。通过RT-PCR鉴定基因型，采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析，使用MEGA 5.0软件，通过邻位法构建系统发生树，分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型，包括：柯萨奇B组病毒（CVB）2、3、5基因型，埃可病毒（ECHO）1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型，柯萨奇A组病毒（CVA）4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型，分别占33.5%（56株）和24.9%（43株）。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份，其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中，优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链，而与国外毒株有较大的差异；ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链，而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型，在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6，其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行，CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。; 李云逸陆菁王秀芝杨玉颖费洁张莉萍李智李崇山左勇; 关键词：肠道病毒属柯萨奇病毒感染环境监测

2005年上海市维持无脊髓灰质炎证实工作进展与评价: 2007年; 杨建萍胡家瑜李秀珠刘敏勇陆菁陶黎纳王于超沈洁; 关键词：无脊髓灰质炎状态急性弛缓性麻痹无脊灰状态感染病例病例监测

2008-2012年上海市急性弛缓性麻痹监测中非脊髓灰质炎肠道病毒的基因型分布被引量：1: 2014年; 人类肠道病毒（human enterovirus，HEV）可以引起多种临床病症，如急性弛缓性麻痹（acute of laccidparalysis，AFP）、无菌性脑膜炎（asepticmenigitis，AM）、脑炎（encephalitis）、心肌炎（myocarditis）、急性出血性结膜炎、手足口病（handfootandmouthdisease，HFMD）及发热等类似感冒症状的综合病症。; 李云逸陆菁杨玉颖丁晓光刘敏勇李崇山孙晓冬; 关键词：急性弛缓性麻痹监测非脊髓灰质炎肠道病毒基因型分布急性出血性结膜炎无菌性脑膜炎临床病症

应用4种方法检测狂犬病毒抗原的结果分析: 2009年; [目的]分析上海市咬人犬的狂犬病毒检测方法,为狂犬伤及多人的公共突发性事件的处理和狂犬病监测提供检测依据。[方法]采集2003至2005年9月疑似狂犬脑标本230份,用ELISA法、直接免疫荧光法(dFA)、小鼠感染法(MIT)和巢式聚合酶链反应(巢式PCR)检测标本。[结果]4种方法结果一致:狂犬病毒阳性率21.3%(49/230)。阳性率以2004年为高(22.2%)。时间分布以春夏季为多。地区分布依次为嘉定、宝山和青浦等地。[结论]dFA、巢式-PCR和ELISA的两两组合可作为快速诊断的方法和狂犬病应急事件处理和预防控制的依据。; 沈蕊华胡家瑜陆菁吕新军陶晓燕唐青; 关键词：狂犬病狂犬病毒疾病控制

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