袁文成
- 作品数：6 被引量：45H指数：4
- 供职机构：苏州大学更多>>
- 发文基金：江苏省水产三项工程项目苏州市科技支撑计划项目农业部渔业种质资源保护项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组EST-SSR位点的信息分析及其多态性检测被引量：15
- 2015年
- 本研究采用高通量测序技术进行了翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组学研究,并扩增分析了EST-SSR分子标记的多态性,以期保护翘嘴鳜种质资源及良种选育,发掘其功能性SSR分子标记。结果表明,在翘嘴鳜转录组测序得到的51245条unigenes中共检测出14094个EST-SSR位点,分布于35285条Unigenes中,出现频率为27.51%。翘嘴鳜转录组EST-SSR位点的序列总长度达到195086bp,EST-SSR位点长度分布从10—25个碱基不等,平均长度13bp;翘嘴鳜转录组EST-SSR位点共有90种重复基元;其中,二核苷酸和三核苷酸重复单元是主导类型,分别占总SSR的30.62%和14.23%,且GT/AC、AAG/CCT分别占总SSR的32.12%和6.36%。随机选取100对经济性状相关EST-SSR引物的扩增产物中有24.7%表现为多态性,可作为功能性SSR分子标记开发。
- 袁文成黄鹤忠李文龙路瑶张茂友王荣泉
- 关键词：翘嘴鳜转录组多态性
- 基于转录组测序的翘嘴鳜微卫星标记的开发及MCH class Ⅰ基因的克隆表达
- 翘嘴鳜（Siniperca chuatsi）隶属于鲈形目（Perciformes）、鳜亚科（Sinipercinae）、鳜属（Siniperca）,俗称桂鱼、桂花鱼、胖鳜、季花鱼等,是淡水底栖的肉食性鱼类。它具有体型大、...
- 袁文成
- 关键词：翘嘴鳜EST-SSRS
- 文献传递
- 东太湖不同水域浮游生物周年变化及鲢、鳙食性的研究被引量：12
- 2013年
- 2012年2-11月对东太湖不同水域浮游生物组成、数量、水质情况及水生植物密度进行了调查,并对9月份太湖鲢、鳙的食性进行了研究。结果表明：浮游动物和浮游植物多样性指数均为保护区＞余山＞老鼠山＞漫山岛。水体浮游生物数量和综合营养状态指数均为漫山岛＞老鼠山＞余山＞保护区。浮游植物总数量与蓝藻总数量、浮游动物总数量、富营养化因子呈正相关,与水生植物密度呈负相关。9月份太湖鲢、鳙的肠内含物中浮游植物和浮游动物分别占食物数量的89.1%、70.6%和10.9%、29.4%,其中蓝藻分别占74.5%、56%,枝角类和轮虫分别占3.7%、13.4%和1.5%、11.5%；鲢、鳙对蓝藻的选择性指数分别为1.42和1.07,对轮虫和原生动物的选择性指数分别为0.13、1.27和1.30、0.40。本研究结果对揭示影响太湖浮游生物周年变化的环境因素以及通过鲢、鳙控制蓝藻具有一定的理论价值和指导意义。
- 李倩倩黄鹤忠张群英王小林朱茂晓沈振华袁文成陆建明
- 关键词：东太湖浮游生物多样性食性
- 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)EST-SSR标记与生长性状相关性及4个选育群体遗传结构研究被引量：11
- 2018年
- 采用翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组高通量测序并筛选得到的13对多态性EST-SSR引物,对60尾翘嘴鳜的体长、体高、体厚及体重4种生长性状进行标记-性状相关性研究,并对4个翘嘴鳜选育群体各30尾个体进行遗传结构分析。结果显示,与其生长性状显著相关的微卫星分子标记有5个,包括:分别与体厚和体长极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的标记C10127,AA型为体长、体厚的优势基因型,而AC型为劣势基因型;与体重显著相关(P<0.05)的标记C19016,AA型为体重的优势基因型,AB型为体长的劣势基因型;与体厚显著相关(P<0.05)的标记C14847,BB型为体厚的优势基因型;分别与体长、体高和体重、体厚极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的标记C12350,BC型为体长、体厚、体高和体重性状的优势基因型;分别与体厚、体重和体高极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的C18691标记,BB型为体厚、体重和体高性状的优势基因型。4个翘嘴鳜群体遗传多样性高低依次为太湖选育群体>长江口选育群体>洪泽湖选育群体>鄱阳湖选育群体,其平均的等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为2.2115、1.9405、0.55513、0.5925和0.3775,属于中度多态水平。
- 袁文成叶金明黄鹤忠肖攀路瑶路瑶朱传坤
- 关键词：翘嘴鳜EST-SSR标记生长性状
- 基于转录组测序的翘嘴鳜微卫星标记的开发及MHC classI基因的克隆表达
- 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)隶属于鲈形目(Perciformes)、鳜亚科(Sinipercinae)、鳜属(Siniperca)，俗称桂鱼、桂花鱼、胖鳜、季花鱼等，是淡水底栖的肉食性鱼类。它具有体型大、...
- 袁文成
- 关键词：翘嘴鳜转录组测序EST-SSR标记
- 文献传递
- 中华鳖(Pelodiscus sinensis)EST-SSR标记与生长性状相关性分析被引量：5
- 2013年
- 采用中华鳖转录组测序方法开发了一系列EST-SSR引物,对60只中华鳖(Pelodiscus sinensis)的遗传多样性和标记-性状相关性进行研究,结果表明,15对EST-SSR引物扩增结果达到了高度多态水平,平均的有效等位基因数、期望杂合度和多态性信息含量分别为2.7633、0.5961和0.539177。C8387位点分别与体长、体重、背甲长和裙边宽显著相关(P<0.05)和极显著相关(P<0.01),CC型、AB型分别为4种性状的优势、劣势基因型;C211位点分别与体重、背甲长和裙边宽呈极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05),其中等位基因C与体重呈负相关,CC型是裙边宽、背甲长性状的劣势基因型,而BB型和AB型分别是裙边宽和体重的优势基因型;C5670位点与体重和背甲长分别呈极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05),其中BB型和AA型分别是体重和背甲长的优势、劣势基因型;C1312和C13038位点均与体重、背甲长极显著相关(P<0.01),且C1312上的BC型、C13038上的BB型分别是中华鳖体重、背甲长性状的优势基因型。
- 张群英黄鹤忠袁文成李文龙雍福和徐雪英张平
- 关键词：中华鳖EST-SSR标记生长性状
