路瑶
- 作品数：1 被引量：15H指数：1
- 供职机构：苏州大学生命科学学院水产研究所更多>>
- 发文基金：江苏省水产三项工程项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组EST-SSR位点的信息分析及其多态性检测被引量：15
- 2015年
- 本研究采用高通量测序技术进行了翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组学研究,并扩增分析了EST-SSR分子标记的多态性,以期保护翘嘴鳜种质资源及良种选育,发掘其功能性SSR分子标记。结果表明,在翘嘴鳜转录组测序得到的51245条unigenes中共检测出14094个EST-SSR位点,分布于35285条Unigenes中,出现频率为27.51%。翘嘴鳜转录组EST-SSR位点的序列总长度达到195086bp,EST-SSR位点长度分布从10—25个碱基不等,平均长度13bp;翘嘴鳜转录组EST-SSR位点共有90种重复基元;其中,二核苷酸和三核苷酸重复单元是主导类型,分别占总SSR的30.62%和14.23%,且GT/AC、AAG/CCT分别占总SSR的32.12%和6.36%。随机选取100对经济性状相关EST-SSR引物的扩增产物中有24.7%表现为多态性,可作为功能性SSR分子标记开发。
- 袁文成黄鹤忠李文龙路瑶张茂友王荣泉
- 关键词：翘嘴鳜转录组多态性
