王璇
- 作品数:33 被引量:164H指数:6
- 供职机构:南京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:南京市医学科技发展项目江苏省农业科技自主创新基金江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 2014~2017年南京地区胃肠炎暴发中诺如病毒分子流行病学特征被引量:20
- 2018年
- 了解2014~2017年南京地区诺如病毒胃肠炎暴发流行特征、变化规律和流行株特征,为疫情控制、疫苗研发提供科学依据。收集2014年9月至2017年8月南京地区12个区疾控上送85起疑似诺如病毒急性胃肠炎暴发样本,应用荧光定量PCR和一步法RT-PCR检测诺如病毒基因序列,测序后利用分子生物学软件对序列进行分析。其中66起诺如病毒检测阳性,暴发集中于幼儿园和小学,冬春季节高发。诺如病毒优势株在连续的几个流行季持续变化,由GII.4/Sydney 2012转变为新型GII.P17-GII.17,再到GII.P16-GII.2。其中GII.P16-GII.2与全球2016~2017年参考株同源性达98.4%~99.5%。2014~2017年南京地区诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行强度呈上升趋势。引起暴发的诺如病毒以GII为主,含多种基因型,并存在重组株,优势基因型在连续的几个流行季持续改变。诺如病毒近几年不断变异,从而逃脱人群免疫,可能是其流行趋势上升的原因之一。
- 王璇王璇雍玮杜雪飞张钟何敏乔梦凯石利民靳淼靳淼
- 关键词:诺如病毒急性胃肠炎暴发基因型别
- 水中诺如病毒的两种富集方法的效果比较被引量:5
- 2021年
- 目的利用MCE-PEG(混合硝酸纤维素膜富集和聚乙二醇)沉淀法和超滤法富集水中诺如病毒,评估超滤法对水中诺如病毒的富集效果。方法向1 L纯净水中加入一定量的诺如病毒进行稀释后,分别利用MCE-PEG沉淀法和超滤法对诺如病毒进行富集,最后用实时荧光定量PCR技术检测并计算诺如病毒的回收率。结果MCE-PEG法对稀释度超过一万倍的水样中的诺如病毒几乎无富集作用,超滤法富集对一万倍稀释度的水样的病毒平均回收率为34.72%,对十万倍稀释度的水样病毒平均回收率为6.21%。结论超滤法比MCE-PEG沉淀法富集病毒的效果更好。
- 金萍石利民张韶华江晓王璇王炜
- 关键词:诺如病毒实时荧光定量PCR超滤法
- 2014~2015年南京地区新型GⅡ.17诺如病毒分子检测
- 王璇杜雪飞雍玮石利民乔梦凯郭宝福谢国祥丁洁
- 南京市2012年-2013年肠道病毒71型分离株VP1基因特性分析被引量:3
- 2015年
- 目的了解南京地区肠道病毒71型流行株的遗传学背景。方法采集2012年-2013年手足口病患者咽拭子样本,经特异性逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)鉴定EV71病毒核酸阳性者进行细胞接种分离病毒。选取阳性分离株扩增其VP1完整编码区全长基因并进行序列测定,利用生物信息学软件对序列加以分析,构建序列遗传亲缘关系树。结果共分离得到14株EV71毒株,经VP1全长基因测序分析发现,所分离病毒VP1区核苷酸与EV71病毒A型代表株同源性为79.6%~81.3%,与B型代表株的同源性为81.7%~84.7%,而与C型代表株的同源性明显较高,为86.0%~95.2%,其中与C4代表株(AY895144)的同源性最高,为93.8%~95.2%。进化树分析发现本地流行株与上海、安徽等地区流行株的亲缘较近,而与台湾地区流行株亲缘较远。相应的氨基酸位点分析也表明符合C基因型的氨基酸模式。结论南京地区2012年-2013年肠道病毒71型的流行株主要为C4亚型,与上海和安徽地区流行株亲缘较近,可能具有同一来源。
- 乔梦凯雍玮石利民王璇王燕丁洁
- 关键词:肠道病毒71型手足口病基因型
- 用模式抗原OVA研究CTA1-DD/IgG佐剂的免疫调节作用
- 2014年
- 目的:进一步研究新型佐剂CTA1-DD/IgG的免疫调节作用。方法:小鼠经鼻内免疫抗原(鸡卵清白蛋白OVA)联合佐剂CTA1-DD或CTA1-DD/IgG复合物,用ELISA检测血清中OVA特异性IgG抗体生成和IgG抗体亚类,用酶联免疫斑点试验检测脾脏抗体分泌细胞。结果:CTA1-DD/IgG佐剂在小鼠中诱导血清特异性IgG抗体及脾脏特异性抗体分泌细胞的能力均高于CTA1-DD佐剂;CTA1-DD/IgG或CTA1-DD作为佐剂联合OVA免疫后IgG1、IgG2a、IgG2b抗体皆提高,且IgG2a/IgG1>1。结论:CTA1-DD/IgG佐剂的免疫调节作用强于CTA1-DD,且能产生混合IgG抗体亚型,促进平衡的免疫应答。
- 许文炯王燕王璇乔梦凯董敏何敏石利民董潇潇恽时锋丁洁
- 关键词:佐剂免疫调节
- 南京市外环境禽流感病毒监测分析被引量:5
- 2015年
- 目的 了解南京市外环境中禽流感病毒的分布情况.方法 检测2013年6月-2014年12月全市外环境监测点的样本620份,分析本市外环境监测结果的特征.结果 城乡活禽交易市场的甲型流感病毒核酸阳性率最高,2013年未检出H7阳性样本,阳性样本多为H9亚型,部分为H5亚型.2014年在检出H5、H7和H9阳性的基础上,还出现了两种以上不同亚型禽流感病毒混合感染的情况.不同类型的标本中,禽鸟类粪便、案板表面擦拭标本和清洗污水这三类标本禽流感病毒检出率高.外环境样本中H7亚型阳性检出时间与病例发生时间在一定程度上较为符合.结论 南京市活禽市场为人感染禽流感的高风险场所,存在多种禽流感病毒亚型感染同一禽类宿主的情况,应加强对外环境的监测,及时发现病毒分布的改变和变异的发生,为早期发现和预防禽流感疫情提供依据.
- 雍玮王璇乔梦凯石利民何敏王燕丁洁
- 关键词:禽流感病毒流行病学
- 南京市诺如病毒GⅡ.4/Sydney变异株感染疫情的病原学研究被引量:5
- 2014年
- 目的对一起南京高校诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确认其病原体,并对其基因进行分型研究。方法用荧光定量PCR法对采集的50份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,对阳性标本采用诺如病毒的开放读码框架2(ORF2)基因N/S区域(N-terminus/shell region)进行RT-PCR扩增、测序,结合诺如病毒Ⅱ型各基因型参考株序列进行序列比对和进化树分析。结果荧光定量PCR检测的50份疫情样本中,诺如病毒Ⅱ型核酸阳性12份,其中5份病毒用RT-PCR扩增出条带,其N/S区域序列与2012年全球流行的新型诺如病毒GⅡ.4/Sydney变异株同源性高达97.7%~98.8%。结论序列测定结果证实这是南京首次由GⅡ.4/Sydney诺如病毒变异株引起的暴发疫情,在日常监测样中也发现该型病毒散发感染,提示该型病毒将是本市今后防控监测的重点。
- 王璇石利民张洪英郭宝福谢国祥丁洁
- 关键词:诺如病毒基因型
- 一株人感染高致病性禽流感(H5N1)病毒基因组分子特征分析被引量:4
- 2019年
- 【背景】H5N1禽流感病毒可以感染人类导致重症呼吸道感染,致死率高。【目的】研究我中心确认的一例人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015的可能起源及基因组分子特征。【方法】对病人痰液样本中的H5N1病毒进行全基因组测序,使用CLC Genomics Workbench 9.0对序列进行拼接,使用BLAST和MEGA 5.22软件进行同源性比对和各片段分子特征分析。【结果】该株禽流感病毒属于H5亚型的2.3.2.1c家系,其8个片段均与江浙地区禽类中分离的病毒高度同源,未发现有明显的重配。分子特征显示,该病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)蛋白裂解位点为PQRERRRR/G,受体结合位点呈现禽类受体特点,但出现D94N、S133A和T188I氨基酸置换增强了病毒对人类受体的亲和性。神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白颈部在49-68位缺失20个氨基酸,非结构蛋白1 (Non-structure protein,NS1)存在P42S置换和80-84位氨基酸的缺失。其他蛋白中也存在多个增强病毒致病力和对人类细胞亲和力的氨基酸突变。对耐药位点分析发现存在对奥司他韦的耐药突变H274Y,病毒对金刚烷胺仍旧敏感。【结论】人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015属于2.3.2.1c家系,禽类来源,关键位点较保守,但仍出现了多个氨基酸的进化与变异使其更利于感染人类。H5N1禽流感病毒进化活跃,持续动态监测不能放松。
- 雍玮乔梦凯石利民王璇何敏丁洁
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型
- 2014—2016年南京市甲型H3N2流感病毒HA基因的进化分析
- 2020年
- 目的对南京地区2014—2016年流行的甲型H3N2型流感病毒血凝素(hemagglutintin,HA)基因进行测序和分析,掌握HA基因的位点突变和遗传进化特征。方法于2014—2016年流感监测样本H3N2型流感病毒阳性标本中,根据时间段随机选取27株,MDCK细胞进行病毒分离和纯化,吸取病毒培养液提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应(reverse transcritase polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增病毒HA基因全长并测序,掌握HA序列特征,对其遗传进化特点、重要功能位点进行详细分析。结果27株H3N2型流感毒株HA基因核苷酸长度为1701 bp,编码566个氨基酸;与同年WHO推荐疫苗株序列同源性高达97.9-99.5%。进化分析表明,2014-2016年南京流行株在进化树上分属两个分支,实现了从3C.3a到3C.2a基因型的转变,目前以3C.2a基因型流行为主;不同年份的南京分离株多个抗原表位上的氨基酸发生了变异。结论2014—2016年南京地区H3N2亚型流感病毒流行株与疫苗株同源性高,疫苗可以产生良好的保护作用;HA基因抗原位点变异快,分子遗传进化活跃,有必要对病毒HA基因的分子特征进行持续监测,为下一个流感病毒流行季H3N2型的防控做好准备。
- 何敏石利民乔梦凯王璇雍玮杜雪飞
- 关键词:HA基因遗传进化抗原表位
- 2014年南京市流感病毒监测结果分析被引量:8
- 2015年
- 目的 掌握南京市流感流行病学特征,分析流行株变化规律。方法 利用国家流感监测系统获取病例个案信息,以实时定量RT-PCR法对流感样病例(ILI)样品进行流感核酸检测分析以确定病毒型别;采用描述性流行病学方法对疫情和病原学监测结果进行分析。结果 2014年南京市哨点监测医院报告ILI 45 372例。共检测ILI样品3 459份,检出流感病毒核酸阳性544份,阳性率为15.73%。季节性H3型为优势毒株(占51.29%)。流行高峰为1-2月及7-9月;不同性别及各年龄组流感核酸阳性率差异均有统计学意义(P值均〈0.05);5-14岁儿童核酸阳性率最高(33.33%)。结论 南京市流感流行具有明显的季节性,不同亚型毒株交替流行。应继续加强流感病毒监测工作。
- 雍玮乔梦凯王璇李伟何敏石利民曾理
- 关键词:流感流行病学分析流感病毒阳性率