吴仲鑫
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系更多>>
- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 肠出血性大肠埃希菌O157:H7毒力基因eae的克隆、表达及生物信息学研究
- 肠出血性大肠埃希菌(EnterohemorrhagicEscherichiacoil,EHEC)O157:H7是一种重要的肠道病原菌。EHEC亦称为VERO毒素大肠埃希菌(verotoxigenicE.coli,VTEC...
- 吴仲鑫
- 关键词:肠出血性大肠埃希菌毒力基因基因克隆生物信息学
- 文献传递
- 大肠杆菌O157:H7 IntC300 B细胞抗原表位的综合预测被引量:1
- 2008年
- 目的预测肠出血型大肠杆菌O157∶H7 IntiminC端300氨基酸片段(IntC300)的B细胞抗原表位。方法采用计算机软件和网络服务器分析IntC300的亲水性、β-转角、柔韧性、表面可及性和抗原指数,判断其B细胞抗原表位。结果B细胞抗原表位可能在20-36、76-88、189-198、262-279和284-296残基或其附近。结论对EHEC O157∶H7 IntC300 B细胞抗原表位的综合预测,为研究诊断性单克隆抗体及多肽疫苗提供了理论工具。
- 周勇吴仲鑫彭丽娟万成松
- 关键词:抗原表位
- 肠出血性大肠杆菌O157∶H7的紧密黏附素基因eae的测序及生物信息学分析被引量:3
- 2008年
- 目的克隆编码肠出血型大肠杆菌O157∶H7的紧密黏附素eae基因,并对其进行测序及生物信息学分析,为研究EHEC与宿主细胞相互作用奠定基础。方法利用PCR技术扩增eae基因,经过纯化,将其定向插入克隆载体PMD19-Tsimplevector并进行测序,应用生物信息学软件分析其生物学特性。结果用PCR方法扩增eae基因,大小为2802bp,编码934个氨基酸,用DNAstar5.0软件分析紧密黏附素(Intimin)蛋白的生物活性,在202~210、510~520、716~735个氨基酸残基的肽链上,显示该蛋白具有良好的亲水性,在175~220、300~315、550~610、710~780、825~880个氨基酸残基的肽链上具有良好的柔韧性,在220~300、615~710个氨基酸残基的肽链上,显示该蛋白具有良好的抗原性。结论本研究用PCR法扩增出了O157∶H7的eae基因,成功构建了肠出血性大肠杆菌O157∶H7紧密黏附素eae基因的重组质粒,并分析了黏附素蛋白的亲水性、柔韧性、抗原性,为进一步研究大肠杆菌O157∶H7黏附素的致病机制奠定了基础,为下一步表达出Intimin蛋白,进一步研究该蛋白与宿主细胞的粘附、免疫原性、抗原抗体反应提供了理论依据。
- 吴仲鑫周勇贡树基彭丽娟仲华万成松
- 关键词:大肠杆菌O157:H7克隆生物信息学分析