冯发深
- 作品数：16 被引量：30H指数：4
- 供职机构：中山大学更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学化学工程农业科学更多>>
- Endophilin B1基因及蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 目的:利用生物信息学方法分析人Endophilin B1基因以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:通过GenBank搜索Endophilin B1基因及蛋白序列,采用生物信息学方法分析该基因在不同物种中的差异,分析该蛋白的亚细胞定位,二级结构,功能域以及抗原表位。结果:该基因编码一个长度为365个氨基酸的蛋白,具有两个BAR和SH3两个功能域。Endophilin B1蛋白理论分子量为40796.3,理论等电点为5.78。二级结构中α螺旋(H)占56.44%,β折叠(E)占5.48%,无规卷曲占38.08%。Endophilin B1蛋白含有4个可能的N连接糖基化位点,5个潜在的酪蛋白激酶II磷酸化位点,7个豆蔻酰基化位点,3个PKC磷酸化位点以及2个酪氨酸激酶磷酸化位点。并进一步利用DNAstar软件分析了了该蛋白的抗原表位。结论:利用生物信息学预测出的结构和功能信息,能为Endophin B1蛋白的相关研究提供一定的信息基础。
- 王铸何霞冯发深关琳琳徐霖张定梅汪杨罗燕芬曹开源
- 关键词：B1BARDOMAINDOMAIN
- 小鼠FasL基因真核表达载体的构建及在HEK293细胞中的表达
- 2012年
- 目的构建含有小鼠Fas Ligand(FasL)基因的重组真核表达载体,并检测FasL蛋白在其稳定转染的HEK293细胞中的表达情况,为构建表达小鼠Fas L的树突状细胞(DC)模型,深入研究DC联合T细胞防治移植物抗宿主病(GVHD)的新方法奠定基础。方法从小鼠脾脏中提取RNA并逆转录为cDNA,以该cDNA为模板扩增FasL基因,插入pcDNA3.1(+)载体中构建pcDNA3.1(+)-FasL重组质粒,利用脂质体将其转染HEK293细胞,用G418筛选稳定表达细胞系,Western blot确定重组蛋白的表达。结果通过酶切及测序证实FasL序列正确插入表达载体pcDNA3.1(+),Western blot检测证实转染重组质粒的细胞能正确表达FasL蛋白,G418筛选后能够得到稳定表达FasL的抗性细胞株即FasL-HEK293。结论重组质粒pcDNA3.1(+)-FasL和稳定表达FasL的HEK 293细胞成功构建,为后续FasL-DC细胞的研究打下了坚实基础。
- 何霞汪杨何善阳王铸冯发深关琳琳罗燕芬潘金成曹开源徐霖
- 关键词：FASLIGAND基因转染HEK293细胞
- 广州地区流感病毒和人博卡病毒感染的流行病学调查被引量：8
- 2012年
- 【目的】调查2010-2011年广州地区发热呼吸道感染病人的流感病毒(IFV)和人博卡病毒(HBoV)的流行状况和流行特点。【方法】采集2010-2011年广州市5家哨点医院共3 460例符合条件的有发热伴呼吸道感染症状患者的咽拭子标本,同时进行相关临床信息的收集和分析,采用普通和巢式PCR方法检测IFV和HBoV的核苷酸,分析IFV和HBoV的流行情况和时间、人群分布特点,对IFV和HBoV均为阳性的样本进一步进行副流感病毒等5种常见呼吸道感染病毒的检测,以了解多重感染的状况。【结果】3 460例病例中,IFV和HBoV的阳性检出率分别为21.13%和1.68%;731例IFV阳性标本中,甲、乙、丙型流感病毒(FluA、B、C)的比例为558∶172∶1,其中481例(66.75%)诊断为上呼吸道感染。58例HBoV阳性病例中44例诊断为下呼吸道感染(75.86%)。IFV和HBoV病毒的检出均与年龄关联,检出率最高的年龄组分别为15～34岁和0.5～1岁。IFV和HBoV的发病高峰分别为7～8月和5～6月。5例检出HBoV与IFV的混合感染,混合感染率为0.64%,其中1例为IFV、HBoV和人冠状病毒(HCoV)的三重感染,HBoV阳性的成人患者的混合感染率为50%。【结论】2010-2011年甲型流感病毒仍是广州地区发热呼吸道症候群的主要病原之一,青壮年检测率较高,夏季为流行高峰;人博卡病毒为全年散发,5-6月发病率较高,婴幼儿中发病率较高,成人病例中人博卡病毒与流感病毒的混合感染率较高。
- 何霞冯发深王铸徐霖张定梅关琳琳郑芸周荣曹开源
- 关键词：呼吸道感染流感病毒人博卡病毒流行病学调查
- 外膜孔蛋白OprD和青霉素结合蛋白在铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药中的作用被引量：4
- 2011年
- 铜绿假单胞菌是人体的一种条件致病菌,目前在我国医院获得性感染中占有非常重要的地位,并且随着抗菌药物的广泛应用,其对亚胺培南的耐药率逐年上升,这给临床抗感染治疗带来了很大的困难.目前认为铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药机制主要有如下几个方面：β-内酰胺酶的水解作用、细菌外膜孔蛋白的通透性降低、作用靶位（如青霉素结合蛋白）的改变、主动外排系统高表达、生物膜的产生等[¨].本实验室前期对广州市收集的亚胺培南耐药的铜绿假单胞菌产金属β-内酰胺酶的情况进行了研究,在此基础上,本研究对这些菌株进行了OprD和青霉素结合蛋白（penicillinbinding proteins,PBPs）这两方面的检测,以全面了解广州地区铜绿假单胞菌分离株对亚胺培南的耐药机制.
- 姜余琴蒋岗常彦敏许沙沙徐霖冯发深何霞王铸曹开源
- 关键词：铜绿假单胞菌产青霉素结合蛋白亚胺培南耐药外膜孔蛋白临床抗感染治疗
- Bif-1对前列腺癌LNCap细胞生物学行为的影响被引量：1
- 2012年
- 目的研究Bif-1基因的过表达对前列腺癌细胞凋亡、增殖以及迁移过程的影响。方法构建Bif-1基因全克隆并转染LNCap细胞,上调细胞中Bif-1基因的表达水平,通过流式细胞术检测细胞转染前后的细胞凋亡情况;通过MTT法检测细胞的增殖能力变化;通过划痕试验检测细胞迁移能力的变化。结果转染Bif-1基因后,Real-time PCR检测发现LNCap细胞中Bif-1基因mRNA水平△△CT高于对照组10倍以上;Western blotting条带光密度值提高2倍以上。实验组细胞凋亡比例升高至31.90%,细胞增殖能力减弱。实验组和对照组中LNCap细胞划痕愈合速度基本相同,差异无统计意义(P>0.05)。结论 Bif-1基因在LNCap细胞中的过表达促进了细胞凋亡,抑制细胞的增殖能力,而对前列腺癌细胞的迁移能力无显著影响。基因有可能作为一个潜在的前列腺癌治疗靶点。
- 王铸何霞冯发深关琳琳汪杨罗燕芬黄斌徐霖曹开源
- 关键词：前列腺癌细胞凋亡
- 离心造粒法制备微晶纤维素空白丸芯的工艺及成型过程的研究
- 目的:考察用离心造粒法制备微晶纤维素（MCC）空白丸芯工艺的主要影响因素,优化制备工艺并考察丸芯成型及干燥过程的机制。方法:采用单因素实验确定主要影响因素,通过正交设计筛选优化制备工艺。考察丸芯制备工程中时间、丸芯含水量...
- 肖羽君冯发深韩珂何子昕吴传斌
- 关键词：离心造粒法微晶纤维素
- 文献传递
- 人冠状病毒OC43、229E、NL63、HKU1和SARS一管多重荧光PCR检测方法及其引物、探针和试剂盒
- 本发明提供了一种人冠状病毒五种型别的一管多重荧光PCR检测方法，该方法采用了序列如SEQ ID NO：1-10所示的引物，还采用了序列如SEQ ID NO：11-15所示的探针。本发明还提供了包含上述引物和探针的人冠状病...
- 曹开源黎孟枫徐霖吴珏珩张定梅许沙沙常彦敏郑芸何霞冯发深王铸关琳琳
- 2010年广州市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析被引量：4
- 2011年
- 目的比较2010年广州市分离到的甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因和2009年中国大陆甲型H1N1流感病毒HA基因的变异情况,为甲型H1N1流感的监测和防控提供理论依据。方法收集2010年广州市有发热和呼吸道症状病人的咽拭子标本,用H1N1流感特异性引物进行PCR检测,扩增分离到的H1N1病毒HA片段,测序后与2009年的H1N1毒株进行比对和分析,并用生物信息学方法对抗原位点和糖基化位点进行分析。结果共收集到426份标本,甲型流感阳性211份,其中H1N1流感4株,与2009年分离的甲型H1N1流感相比,有12个氨基酸碱基位点发生了有意义突变,其中6个位点位于抗原位点上;4株毒株HA基因145位氨基酸都发生了变异;其中2株毒株在第180位氨基酸位点的抗原位点发生了变异。进化分析表明4株毒株与2009年中国大陆分离的8株毒株进化关系较远。结论 2010年广州市甲型H1N1毒株与2009年相比发生了较大变异。HA基因145位和180位氨基酸位点变异对H1N1毒株抗原变异有重要意义。本文分离的A/Guangdong/ZS03/2010(H1N1)和A/Guangdong/ZS01/2010(H1N1)毒株可能已经发生了抗原性漂移。
- 许沙沙常彦敏徐霖冯发深何霞王铸张定梅黎孟枫曹开源
- 关键词：甲型H1N1流感血凝素抗原决定簇
- 2009年肠道病毒71型广州分离株的全基因组序列分析被引量：2
- 2011年
- 目的分析2009年肠道病毒71型广州分离株GZHY09的全基因组序列,并与GenBank中的序列进行分析比对。结论从GenBank上选不同地区的EV71全基因组序列,设计相互重叠的覆盖病毒整个基因组序列的12对引物,采用RT-PCR扩增出12个基因片段,通过测序获得全基因组序列,并参考国内外各EV71基因型的分离毒株,用MEGA4软件进行进化树分析,用DNAStar软件中的MegAlign进行同源性分析。结果 12个重叠基因片段序列拼接获得EV71全基因组序列,共7404个核苷酸,同源性分析结果表明在VP1区,GZHY09株与中国大陆的Anhui08、Zhejiang08、Shenzhen08的核苷酸序列同源性比较高,其中以Anhui08最高(97.7%)。结论 GZHY09属EV71病毒的C4亚型,与近年我国大陆地区流行的EV71株在进化上属于同一基因型,与Anhui08、Zhejiang08、Shenzhen08具有高度的同源性。
- 常彦敏许沙沙徐霖冯发深何霞王铸张定梅黎孟枫曹开源
- 关键词：肠道病毒71型全基因组系统进化分析
- 2010年广州市甲型H1N1流感病毒分离株NA基因变异分析被引量：6
- 2014年
- 目的比较2010年从广州市分离到的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因与2009年中国大陆甲型H1N1流感病毒NA基因的变异情况,为甲型H1N1流感的监测和防控提供参考资料。方法收集2010年广州市有发热和呼吸道症状患者的咽拭子标本,用甲型H1N1流感病毒特异性引物进行聚合酶链反应(PCR)检测,扩增分离到的甲型H1N1流感病毒NA基因片段,测序后与2009年的H1N1毒株进行比对和进化分析,并用生物信息学方法对耐药位点和糖基化位点进行分析。结果共收集1 194份咽拭子标本,检测到甲型流感病毒阳性327份,其中H1N1流感病毒6株,与2009年分离的甲型H1N1流感病毒相比,有16个位点发生了有义突变,3个位点和NA活性相关,其中222位氨基酸的变异位于NA活性位点上。结论成功扩增了2010年广州市6株甲型H1N1流感病毒株NA基因并测序,未发现H275Y耐药位点的变异。3毒株在NA活性位点222位、228位和425位等氨基酸位点处发生了变异,需继续加强监测。
- 许沙沙常彦敏徐霖冯发深何霞王铸张定梅曹开源
- 关键词：甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶
