天津医科大学基础医学院天津市医学表观遗传学重点实验室
- 作品数:4 被引量:2H指数:1
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- 相关领域:医药卫生理学生物学更多>>
- 基于适配子识别和DNA模板技术研究适配子-蛋白相互作用
- 适配体常被用做识别生物标志物的分子探针,此前,已发展了一种基于适配体的"fishing"方法来识别疾病细胞的生物标志物.然而,由于适配体和靶分子间弱的非共价作用,这一方法的应用受到限制.光亲和标记技术...
- 毕文静柏雪田姗姗翟贵金张锴
- 关键词:核酸适配体组蛋白
- 基于适配子识别和DNA模板技术研究适配子-蛋白相互作用
- <正>核酸适配体常被用做识别生物标志物的分子探针,此前,已发展了一种基于适配体的'fishing'方法来识别疾病细胞的生物标志物。然而,由于适配体和靶分子间弱的非共价作用,这一方法的应用受到限制。光亲和标记技术由于可以将...
- 毕文静柏雪田姗姗翟贵金张锴
- 关键词:核酸适配体光交联
- 文献传递
- 组蛋白变体H2A.Z的转录调控功能与动态作用机制
- 2024年
- H2A.Z是组蛋白H2A常见的组蛋白变体。近年来,人们通过多学科手段探究了H2A.Z对于基因转录的激活或抑制作用。本文在概述组蛋白变体和H2A.Z发展史的基础上,重点阐述了H2A.Z不同亚型、不同翻译后修饰和基因组分布在转录调控过程中的作用,明确了其生物学意义和在肿瘤发生发展、神经系统分化发育过程中的病理生理学意义,并总结了H2A.Z在染色质沉积或者移除的动态调控机制方面的研究进展,以期为深入了解组蛋白变体的多样性,并为寻找相关疾病诊疗的新靶点提供参考。
- 孙朝冉吴旭东
- 关键词:表观遗传调控核小体基因转录
- 石蜡包埋组织中组蛋白的提取分离和翻译后修饰的定量分析被引量:2
- 2021年
- 组蛋白翻译后修饰(HPTMs)参与基因转录调控,其异常与肿瘤等重大疾病的发生发展密切相关。石蜡包埋组织是当前疾病研究的重要样本资源,对肿瘤机制和标志物研究具有重要意义。目前基于质谱的蛋白质组学技术已成为HPTMs分析的有力工具,而针对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样品的HPTMs分析还十分有限。该研究发展了一种基于高效液相色谱-串联质谱的FFPE组织样本HPTMs分离分析新方法。通过研究并优化组蛋白的提取策略,建立了FFPE组织样本脱蜡水化处理、蛋白质提取与聚丙烯酰胺凝胶电泳分离相结合的组蛋白提取和分离方法。通过研究FFPE切片数量、组蛋白化学衍生化方法等对组蛋白鉴定的影响,确定了组蛋白处理的具体步骤。通过HPLC分离结合非依赖性采集模式的质谱分析,鉴定了组蛋白修饰的类型、位点和丰度。最后,将优化的实验方法应用于FFPE临床样本的HPTMs分析,鉴定了2例人乳腺浸润性癌和癌旁正常组织的HPTMs图谱,均获得了100种以上的不同组蛋白修饰形式的多肽。定量分析了他们的差异性水平,通过主成分降维分析,发现浸润性癌和癌旁正常组织之间组蛋白修饰丰度存在明显的差异,且差异性具有一定的规律,特别是涉及转录调控的组蛋白修饰与乳腺癌的预后和治疗靶点具有相关性,进而探讨了乳腺癌中异常HPTMs的生物学意义。该研究对临床石蜡样本中组蛋白修饰的分离分析以及肿瘤表观遗传标志物的检测进行了有益的探索。
- 田姗姗刘冉冉钱晓龙郭晓静张锴
- 关键词:高效液相色谱-串联质谱石蜡包埋乳腺癌