邓杨
- 作品数：10 被引量：15H指数：2
- 供职机构：四川大学华西医院更多>>
- 发文基金：四川省国际科技合作与交流研究计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术航空宇航科学技术化学工程更多>>
- 数字病理中计算机辅助诊断研究展望被引量：10
- 2017年
- 随着数字病理切片扫描仪的出现,病理切片图像信息能够通过全玻片数字扫描(Whole slide imaging,WSI)技术实现全数字化。WSI首先可以通过计算机网络开展病理远程会诊,但更重要的是可以和计算机强大的计算能力结合开展计算机辅助诊断(computer-aided diagnosis,CAD)。病理图像的全数字化起步较晚,数字病理图像CAD目前在全球范围内还只处于实验室研究阶段,但已是数字病理发展的方向和目标。随着与人工智能、大数据与云技术的结合,数字病理CAD研发将迎来快速发展期。本文将着重讨论CAD在未来数字病理临床应用中的发展阶段和研究方向。
- 邓杨包骥
- 关键词：计算机辅助诊断
- 利用人工智能技术开发乳腺浸润性导管癌病理图像ki-67自动计数软件
- 背景和目的：全玻片数字扫描技术(Whole slide imaging,WSI)的出现,使组织病理图像信息与人工智能技术结合成为可能。乳腺浸润性导管癌(IDC)的免疫组化切片中的ki-67计数一直是使用人工估值的方法,不...
- 包骥邓杨张璋景秋洋杨李波周燕燕步宏
- 关键词：人工智能KI-67WSI
- 紫外光固化胶在病理切片快速封片中的应用
- 2021年
- 目的为了解决传统的中性树脂封片固化时间长,空间占用率高,不适合数字切片扫描等问题,探究紫外光固化胶的制备,保证切片制备质量同时提高封片效率。方法选择环保安全的预聚物、活性稀释剂和光引发剂制备干燥速度快,透光率高,适用范围广,性质稳定的紫外光固化胶替代传统封片剂。结果制备出的紫外光固化胶(UV42胶)封片后在紫外光照下15 s可完全固化,透光率达88.4%~89.7%(在波长400~600 nm范围内),广泛适用于冷冻和石蜡切片的常规染色处理封片。使用UV42胶封片的病理切片,放置3年后性质依然稳定,且耐黄变性能良好。结论 UV42胶满足快速病理切片封片的需求。
- 张炳琪周燕燕邓杨罗添友李丽陈菲包春娟姜勇马朗包骥步宏
- 关键词：病理切片活性稀释剂环保安全透光率
- 深度学习辅助甲状腺乳头状癌细针穿刺涂片细胞学诊断的初步研究
- 背景和目的：穿刺细胞学是一种常用的肿瘤诊断技术,它具有方法简单,容易掌握,患者痛苦小,易接受,不用开刀费用低等优点,深受广大患者喜欢。细针穿刺对甲状腺乳头状癌有重要的诊断意义：涂片中癌细胞丰富,呈团簇样,细胞界限欠清楚,...
- 包骥姜勇孙怀强邓杨周燕燕步宏
- 关键词：WSI人工智能甲状腺乳头状癌细胞学
- 乳腺癌Ki-67人工智能自动诊断系统的真实世界应用测试被引量：1
- 2021年
- 目的研究人工智能(AI)用于辅助临床乳腺浸润性导管癌(IDC)Ki-67评分的不同方法并比较其结果。方法收集100例真实临床IDC诊断病例,包括HE、免疫组化Ki-67染色的切片和诊断结果。将病理切片扫描成全片数字化图像(whole slide image,WSI),并使用AI对其进行评分。AI评分方式分为两种,一种为AI纯自动计数,使用Ki-67自动诊断的评分系统对WSI进行全片计数;第二种是AI半自动计数,需要人工选择区域计数,然后用智能显微镜进行自动计数。病理医生的诊断结果作为纯人工计数的结果。将全人工(病理诊断结果)、AI半自动、AI全自动此3种计数所得的Ki-67分数进行两两比较,分别按差异高低进行归类,差异高低分为3档:相差≤10%、相差>10%~<30%和相差≥30%,并且使用组内相关系数(intra-class correlation coefficient,ICC)对其进行相关性的评价。结果全自动AI计数1例Ki-67的时间为5~8 min,而半自动AI方法为2~3 min,全人工计数则需要1~3 min。两种AI计数方法相比较,Ki-67分数的相差全部在10%以内(占比100%),ICC指数高达0.992。全人工计数和AI半自动相比,相差≤10%的有60例(占比60%),相差>10%~<30%的例数为37例(占比37%),而≥30%的只有3例(占比3%),ICC指数为0.724;全人工计数和AI全自动相比,相差≤10%的有78例(占78%),相差>10%~<30%的例数为17例(占比17%),而≥30%的有5例(占比5%),ICC指数为0.720。ICC数值示,两种AI方法之间差异不大、可重复性很好,AI和人工计数之间的可重复性可接受。结论AI全自动方法的优势在于更节省人力,病理医生只需在最后核对诊断结果。而半自动的方法更符合临床病理医生的诊断习惯,整体耗时较AI全自动方法少。此外,AI方法虽然可重复性较高,但不能完全取代病理医生,而应作为有力的辅助工具看待。
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- 关键词：乳腺浸润性导管癌KI-67人工智能自动计数
- UV光学胶代替传统中性快干胶完成病理切片快速封片
- 目的：病理制片过程中常规封片干燥需要的时间长，我们希望找到一种快速封片干燥的方法，能迅速对切片进行封片干燥，使其可以尽快的用于全片数字化扫描、更便于储存、提高工作效率。
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- 关键词：病理切片封片
- 可信病理人工智能:从理论到实践被引量：1
- 2022年
- 人工智能正在融入病理学研究的各个领域,但在临床实践中却遇到了诸多挑战,包括因医疗数据隐私保护而形成“数据孤岛”,不利于人工智能模型的训练;现有人工智能模型缺乏可解释性,导致使用者无法理解而难以形成人机互动;人工智能模型对多模态数据利用不足,致使其预测效能难以进一步提升等。为解决上述难题,我们建议在现有病理人工智能研究中引入可信人工智能技术:(1)数据安全共享,在坚持数据保护的基础上打破数据孤岛,使用联邦学习的方法、仅调用数据训练的结果而不上传数据本身,在不影响数据安全的情况下大大增加可用于训练的数据量;(2)赋予人工智能可解释性,使用图神经网络技术模拟病理医生学习病理诊断的过程,使得模型本身具有可解释性;(3)多模态信息融合,使用知识图谱技术对更为多样和全面的数据来源进行整合并深入挖掘分析,获得更准确的模型。相信通过此三方面的工作,可信病理人工智能技术可使病理人工智能达到可控可靠和明确责任,从而促进病理人工智能的发展和临床应用。
- 周燕燕邓杨包骥步宏
- 关键词：病理可解释性多模态信息融合
- 一种用于病理切片封固剂快速干燥的方法被引量：1
- 2017年
- 封固也叫封片，是制做常规组织切片标准步骤的最后一道工序，封片的过程是将染色好的切片用封固剂封固起来，即把盖玻片与载玻片用封固剂粘合在一起。切片完全干燥的衡量标准是在用两手指较用力搓时，盖玻片与载玻片间不应有滑动。此后可将切片竖立，前后叠放，相互不会粘连。目前国内病理实验室多采用常温自然干燥法，需将切片单层平放7～14天，封固剂才能完全干透，这种做法比较费时，
- 包骥李丽陈菲邓杨步宏
- 关键词：病理切片真空加热紫外线
- 基于无监督学习的数字病理切片自动分割方法被引量：2
- 2021年
- 目的使用无监督的方式进行图像分割,作为人工标记的一种替代。方法选取了共100张HE染色和巴氏染色切片的全片数字化图像(whole slide image,WSI)数据作为研究和测试的对象,其中乳腺切片70张,肺切片20张,甲状腺切片10张。为了保证数据的多样性,乳腺的切片包含了正常组织、炎症、肿瘤,肺切片取材主要为下叶新生物(包含了炎症和肿瘤),甲状腺为细针穿刺的细胞(均为良性)。每张图像的最大总倍率(原始倍率)均为400倍,文件格式为ndpi。对每张WSI进行人工的标注,每张WSI的标注区域都大于10个视野,标注后的信息将用于有效性的验证。使用基于超像素与全卷积神经网络的算法构建无监督图像分割技术,对没有标记的WSI的任意感兴趣区域(regions of interest,ROI)进行图像分割。与区域邻接图合并的方法进行比较,以欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并结果比判定两种方法的分割效果,并比较两种方法的效率。在执行效率的比较中,测试过程包含了超像素的预处理的时间,去掉了加载深度学习引擎的时间。结果对WSI任意ROI区域按纹理和颜色对图像实现了无监督的自动分割,乳腺切片、肺切片和甲状腺切片测试的结果差异小,多次测试的结果稳定,但该方法在对炎症和肿瘤的区分中表现一般。其欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并结果分别为19.10%、82.06%和45.06%。区域邻接图合并的方法的欠分割错误差率、边缘召回率和平均交并的结果分别为21.52%、78.39%和44.81%。在GPU模式下整个过程平均耗时为0.27 s,在CPU模式下平均耗时为1.30 s,由于区域邻接图合并的方法没有实现GPU模式,在CPU模式下平均耗时为10.5 s。结论本方法通过简单的人机交互操作得到理想的像素级标注结果,可以有效降低数字病理切片数据标注的成本,比区域邻接图合并的方法在处理图像纹理的方面表现得�
- 秦航宇邓杨周燕燕刘洪红李丽周琪琪梅娟步宏包骥
- 关键词：卷积神经网络
- 建设全面数字化病理科研实验室的经验
- 近年来随着本院国家级、省级科研项目数量不断增加，病理科研实验室承担的病理技术服务任务也越来越重。因此需要建设一个全流程的数字化、网络化、可质控的工作平台，并且通过它来规范病理制片流程，采集数字化图像，使计算机辅助软件帮助...
- 包骥邓杨李丽陈菲周燕燕牛钰清何姝步宏
- 关键词：WSI人工智能病理技术
