田丹丹
- 作品数：5 被引量：47H指数：2
- 供职机构：广西农业科学院更多>>
- 发文基金：国际科技合作与交流专项项目国家高技术研究发展计划广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 1株甲基杆菌Methylobacterium sp.WGM16的鉴定及降解甲醇的最佳培养条件被引量：10
- 2011年
- 从水稻根部土壤中筛选到1株粉红色、需氧的兼性甲基营养型菌株WGM16,该菌为革兰阴性杆菌。根据菌株16S rRNA基因序列比对分析及结合菌株常规形态特征、生理生化性状的鉴定,将该菌初步鉴定为Methylobacterium sp.PCR扩增到菌株WGM16编码甲醇脱氢酶α-亚基的mxaF基因,表明菌株WGM16中存在甲基营养代谢途径。在培养温度为32℃、以1%的甲醇作为碳源、pH值为8.0的培养条件下,其甲醇降解率可达75%。
- 田丹丹宋修鹏蒋承健古恒森李俊芳武波
- 甲基营养菌Methylobacterium sp.MB200中部分一碳代谢相关基因的定位及mtdA和mtdB基因的克隆研究被引量：2
- 2011年
- 以甲基营养细菌Methylobacterium sp.MB200为出发菌株,首先利用质粒转座子(pTnMod-RKm’)构建了目的菌株MB200的部分突变体库,获得能够在双抗性MMII板上生长的突变体共11552株,然后在双抗性MMI板上复筛获得不能够利用甲醇的突变体333株(初步认为是一碳代谢途径被破坏的突变株),为一碳代谢相关基因的克隆研究奠定了基础。随后利用TAIL-PCR技术快速准确地从突变体库中定位了部分与一碳代谢相关的基因,并根据pTnMod-RKm’具有复制起始位点能够快速克隆插入位点侧翼序列的特性克隆到mtdA和mtdB基因的全序列并进行了初步分析。
- 宋修鹏武波申佩弘蒋承建田丹丹唐咸来
- 关键词：甲基营养菌突变体库
- 甲基营养菌Methylobacterium sp.MB200中与L-丝氨酸耐受性相关基因的克隆与分析被引量：1
- 2011年
- 甲基营养菌MB200,能利用非C-C键低碳化合物生长并合成L-丝氨酸,对L-丝氨酸耐受浓度低,提高其在静息细胞反应系统中对L-丝氨酸的耐受能力可更好的提高L-丝氨酸的产量。利用质粒转座子pTnMod-RKm'构建了甲基营养菌MB200的突变体库,往培养基中添加20 mg/mLL-丝氨酸对突变体库中的突变体进行平板筛选,共筛选到177株耐受L-丝氨酸的突变体,以10mg/mL的浓度梯度复筛,发现某些突变体能最高耐受40 mg/mL L-丝氨酸。分别提取突变体总DNA,用BamHI酶随机酶切后连接到克隆载体pMD18-T上,导入到大肠杆菌感受态细胞DH5α中,利用双抗性在(转座子抗性与T载体上的抗性)平板上挑取转化子,并提取质粒,酶切验证后进一步测序。共克隆到了17个基因,为提高甲基营养菌对L-丝氨酸的耐受能力提供了可研究的基因资源。
- 周侃唐咸来蒋承建宋修鹏李俊芳田丹丹申佩弘
- 关键词：METHYLOBACTERIUM突变体L-丝氨酸耐受性
- 甲基营养型菌株WGP35的筛选、鉴定及突变sdaA基因对其产L-丝氨酸的影响
- 甲基营养菌在自然界中的分布非常的广泛，它们具有独特的一碳代谢途径，能够将自然界中取之不尽的一碳化合物如甲醇、甲醛等转变为菌体自身所需的营养物质，同时又会产生多种有益的代谢副产物L-丝氨酸、维生素B12、聚β羟基丁酸盐等。...
- 田丹丹
- 关键词：甲基营养菌L-丝氨酸
- 甘蔗苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)的克隆和表达分析被引量：32
- 2013年
- 【目的】克隆甘蔗的苯丙氨酸解氨酶基因(PAL),分析其序列特征及其在不同组织和5种胁迫条件下的表达情况,为此基因在甘蔗抗逆育种中的应用提供理论支撑。【方法】利用串联飞行时间质谱仪对差异表达蛋白质进行质谱鉴定分析,通过RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种新台糖22号(ROC22)中克隆PAL,以生物信息学方法对其序列进行预测分析,利用real-time PCR分析PAL在不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。【结果】克隆获得甘蔗PAL,命名为ScPAL,GenBank登录号为KC172559。该cDNA全长2 590 bp,含有1个2 115 bp的完整开放阅读框(ORF),编码704个氨基酸。序列分析表明,其包含典型的PAL酶活性中心序列(GTITASGDLVPLSYIA),与其它植物的PAL蛋白有很高的相似性。系统进化树分析显示,甘蔗ScPAL与高粱的PAL蛋白亲缘关系较近。real-time PCR分析表明PAL为组成型表达,在根中的表达量最高,是叶中表达量的66倍。其在低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、NaCl和H2O2四种外源胁迫下均诱导表达,但表达模式不同。【结论】从甘蔗品种ROC22中克隆获得苯丙氨酸解氨酶基因(ScPAL),是典型的PAL家族成员,推测其参与了甘蔗抗黑穗病过程,且在甘蔗抗寒、抗旱和抗盐胁迫过程也起到某种作用。
- 宋修鹏黄杏莫凤连田丹丹杨丽涛李杨瑞陈保善
- 关键词：甘蔗苯丙氨酸解氨酶基因克隆
