陈改莉
- 作品数：1 被引量：0H指数：0
- 供职机构：新乡医学院生命科学技术学院更多>>
- 发文基金：河南省高校科技创新团队支持计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 脊椎动物Delta-Protocadherin亚家族的系统进化分析
- 2017年
- 为了研究脊椎动物δ-Pcdh亚家族的进化,本研究以11种脊椎动物的11个Pcdh基因为研究对象,进行了序列比对和系统发育关系重建,并利用PAML对δ2-Pcdh亚家族进行选择压力分析,同时对正选择位点进行了定位。研究发现,δ-Pcdh可以分为δ1-Pcdh(Pcdh1,Pcdh7,Pcdh9,Pcdh11和Pcdh20)和δ2-Pcdh(Pcdh8,Pcdh10,Pcdh12,Pcdh17,Pcdh18和Pcdh19)两个亚家族。其中,δ1-Pcdh亚家族中Pcdh20位于系统树的基部,Pcdh1与Pcdh7和Pcdh9与Pcdh11分别构成姐妹群;δ2-Pcdh亚家族分为两个分支,一支由Pcdh8、Pcdh12和Pcdh18构成,另一支由Pcdh10、Pcdh17和Pcdh19构成,其第一个分支的3个基因均检测到了不同程度的正选择。随后,分析了正选择位点所在的结构域,探讨了正选择位点与蛋白质功能的关系。该研究为深入了解脊椎动物δ-Pcdh亚家族的进化提供了重要参考。
- 管丽红韩亚伟朱少义周亚茹陈改莉林俊堂
- 关键词：正选择脊椎动物
