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蒋巧燕
作品数:
3
被引量:2
H指数:1
供职机构:
青海大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
汤锋
青海大学
冯琳
青海大学
格日力
青海大学
李润乐
青海大学
陈星宇
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环介导等温核酸扩增技术应用于多房/细粒棘球蚴的分型检测方法及检测试剂盒
本发明涉及一种环介导等温核酸扩增技术(LAMP)应用于多房/细粒棘球蚴的分型检测方法及检测试剂盒,包括设计用于区分多房/细粒棘球蚴的LAMP引物、LAMP扩增条件的选择和LAMP扩增产物的检测,本发明方法可有针对性的分型...
汤锋
李润乐
格日力
蒋巧燕
冯琳
文献传递
基于环介导等温核酸扩增技术分型检测多房/细粒棘球蚴方法的建立
被引量:2
2019年
目的本研究拟建立用于分型检测多房棘球蚴与细粒棘球蚴的分子生物学方法。方法采用生物信息学软件Primerexplorer针对多房棘球蚴(Echinococcusmultilocularis,E.m.)和细粒棘球蚴(Echinococcusgranulosus,E.g.)线粒体基因组ND2基因,设计用于区分多房棘球蚴和细粒棘球蚴DNA样本的LAMP引物,并行筛选、验证后进一步对扩增温度、Mg^2+扩增浓度、dNTP Mix扩增浓度进行考察以优化其反应体系。结果通过生物信息学方法Primerexplorer,针对多房/细粒棘球蚴线粒体基因ND2的差异序列位点设计、获得了两对可用于多房/细粒棘球蚴分型检测的引物ND2A(E.m.)、ND2A(E.g.);ND2B(E.m.)、ND2B(E.g.)。进一步通过LAMP反应扩增后经琼脂糖电泳及可视化探针筛选发现ND2A(E.m.)、ND2A(E.g.)引物可以成功区分多房棘球蚴和细粒棘球蚴线粒体DNA序列,而ND2B(E.m.)、ND2B(E.g.)引物无法区分。进而通过优化反应条件发现,ND2A(E.m.)、ND2A(E.g.)的最适反应温度分别为64℃和61℃;ND2A(E.m.)、ND2A(E.g.)的最适Mg^2+反应浓度分别为1.5×10^-4mM和1.7×10^-4mM;ND2A(E.m.)、ND2A(E.g.)的最适dNTP Mix反应浓度为3.5×10^-5mM和3.4×10^-5mM。结论通过设计、验证、筛选获得了用于区分多房/细粒棘球蚴线粒体DNA的LAMP引物,并通过优化反应条件成功建立了一种基于LAMP技术用于多房/细粒棘球蚴分型检测的分子生物学方法。
蒋巧燕
张颖
胡缤文
汤锋
汤锋
关键词:
多房棘球蚴
细粒棘球蚴
基于MGB探针分型检测多房棘球蚴及细粒棘球蚴的实时定量PCR方法及检测试剂盒
本发明公开了一种基于MGB探针分型检测多房棘球蚴及细粒棘球蚴的实时定量PCR方法及检测试剂盒,包括设计引物、设计MGB探针和PCR扩增条件的选择,检测试剂盒内含有PCR引物对的外引物对序列及MGB分型检测探针序列。本发明...
汤锋
格日力
樊海宁
李润乐
刘川川
廖瑜
冯琳
蒋巧燕
陈星宇
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