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郑斌

作品数：1 被引量：7H指数：1
供职机构：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所更多>>
发文基金：广东省自然科学基金国家公益性行业科研专项更多>>
相关领域：农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇转录
  • 1篇转录组
  • 1篇芒果

机构

  • 1篇中国热带农业...

作者

  • 1篇武红霞
  • 1篇王松标
  • 1篇许文天
  • 1篇马小卫
  • 1篇姚全胜
  • 1篇罗纯
  • 1篇郑斌

传媒

  • 1篇热带作物学报

年份

  • 1篇2017
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基于转录组的芒果MYB家族基因的鉴定及分析被引量：7
2017年
MYB家族作为植物中较大的转录因子家族之一,参与调控植物的多种生理活动。本研究基于芒果果实转录组测序结果,鉴定出71个MYB家族蛋白,其中包含1个4R-MYB蛋白、3个R1R2R3-MYB蛋白、60个R2R3-MYB蛋白和7个MYB相关蛋白。进化树及基序分析表明:除个别蛋白外,相同类型的MYB蛋白均聚在一起,且相近分支的MYB蛋白具有相同或相似的基序。60个全长MYB家族蛋白中,大部分为不稳定蛋白,且均为不含跨膜结构和信号肽的亲水性蛋白,亚细胞定位分析均定位于细胞核。进化树分析发现芒果R2R3-MYB蛋白与拟南芥有较高的保守性。R2R3-MYB蛋白保守域分析发现,R2和R3结构域均有多个氨基酸保守不变。GO分析发现芒果R2R3-MYB蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的15个亚类。
郑斌武红霞王松标马小卫许文天罗纯姚全胜
关键词：芒果生物信息学
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