张国儒 作品数:5 被引量:41 H指数:3 供职机构: 石河子大学农学院园艺系 更多>> 发文基金: 国家级星火计划 兵团科技支疆项目 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
加工番茄耐盐突变体转录组测序结果分析及验证 遗传变异是生物进化的基础,自然环境下,植物自身发生的遗传变异率很低,通过理化因素诱导基因突变能进一步扩宽种质资源,增加植物遗传多样性.EMS(甲基磺酸乙酯)作为化学诱变剂在研究中应用广泛,诱变效果较明显、作用稳定.其诱变... 张国儒 庞胜群 郭晓珊 单淑玲关键词:加工番茄 EMS 转录组测序 RT-QPCR 加工番茄耐盐突变体耐盐相关基因的转录组分析 被引量:11 2018年 为筛选鉴定番茄叶片响应盐胁迫应答基因,本研究通过甲基磺酸乙酯(methyl ethyl sulfonate, EMS)诱变处理加工番茄‘JW9’获得的16株耐盐突变植株。经单独收种后,利用(RNA sequencing, RNA-Sep)技术对获得的耐盐突变体加工番茄幼苗叶片进行转录组测序分析。提取样品总RNA进行转录组cDNA文库制备后进行Illumina HiSeq/MiSeq测序。对转录组测序结果进行分析共获得了102 Gb大约810 974 186个高质量的Clean阅读序列,Cufflinks软件重构转录本后得到38 190个已知转录本,1 647个未知转录本。在测序样本中共筛选出4 367个基因在样品间显著差异表达,其中上调表达基因2 606个,下调表达基因1 761个。经qRT-PCR检测表明,10个随机选择的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)表达量变化与转录组测序结果一致。通过GO和KEGG通路富集分析,从具有耐盐功能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶和ATPase酶合成相关的基因中,找到5个显著差异表达基因Solyc08g066270.1和Solyc03g083420.2以及Solyc10g018530.1、Solyc09g082890.1和Solyc02g014190.2可能为耐盐相关基因。本研究从耐盐突变体与原始亲本的差异表达基因中筛选出耐盐候选基因,为进一步鉴定和克隆出番茄的耐盐基因培育耐盐品种番茄提供理论参考。 张国儒 庞胜群 郭晓珊 单淑玲关键词:加工番茄 RNA-SEQ 耐盐基因 QRT-PCR 加工番茄小孢子细胞学发育时期与花器形态相关性研究 被引量:4 2018年 【目的】在单倍体育种中,分析加工番茄花器官形态,鉴定小孢子发育时期,为花药离体培养外植体的选择提供理论依据。【方法】以加工番茄(杂交组合C1、C2和C3)为材料,研究小孢子不同发育时期的花器形态与细胞学形态。【结果】加工番茄小孢子发育时期与花器官形态密切相关,同一品种不同小孢子发育时期花器官形态不同;C1花蕾长度在小孢子单核靠边期大于其它2个杂交组合;相同小孢子发育时期不同杂交组合花器形态基本相同。【结论】加工番茄杂交组合C2和C3花蕾长度为5.00~5.99 mm,C1花蕾长度为6.00~6.99 mm时小孢子发育时期为单核靠边期。单核靠边期细胞学特征为细胞呈正圆形,细胞核靠近细胞壁和显现萌发孔。花器形态为花蕾膨大、微微张开、萼片黄绿色,花药颜色为黄绿色易剥离。 单淑玲 庞胜群 郭晓珊 张国儒关键词:加工番茄 小孢子发育时期 细胞学特征 花器形态 加工番茄耐盐突变体转录组测序结果分析及验证 遗传变异是生物进化的基础,自然环境下,植物自身发生的遗传变异率很低,通过理化因素诱导基因突变能进一步扩宽种质资源,增加植物遗传多样性。EMS(甲基磺酸乙酯)作为化学诱变剂在研究中应用广泛,诱变效果较明显、作用稳定。其诱变... 张国儒 庞胜群 郭晓珊 单淑玲关键词:加工番茄 EMS 转录组测序 RT-QPCR 文献传递 隶属函数法评价不同加工番茄品种耐盐性 被引量:26 2017年 【目的】评价不同加工番茄品种的耐盐性,为生产上合理选用耐盐性较好的品种提供参考依据。【方法】以7个加工番茄品种,用100 mM NaCl盐溶液进行胁迫处理。测定盐胁迫后叶片的脯氨酸、丙二醛、可溶性糖、可溶性蛋白、SOD、POD、CAT酶活性等生理指标。【结果】各生理指标测定得出品种耐盐性各不相同,其中脯氨酸含量,可溶性糖含量以及抗氧化酶促系统中SOD酶活性,POD酶活性,CAT酶活性,可溶性蛋白含量与植物耐盐性呈正相关关系,丙二醛含量的积累与植物耐盐性呈负相关关系。最后使用隶属函数法评价7个品种的耐盐性。【结论】7个加工番茄耐盐性能力由强到弱依次为:农番3号、IVF6172、石红9号、屯河17号、IVF3155、PT501Q、JW001。 许立志 庞胜群 刁明 张国儒 李琦 牛宁关键词:加工番茄 耐盐性 生理指标 隶属函数