贾纯琰
- 作品数：9 被引量：8H指数：2
- 供职机构：内蒙古农业大学职业技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学生物学建筑科学更多>>
- 外源褪黑素诱导下Hippo信号通路调控山羊绒生长mRNA和lncRNA的生物信息学分析被引量：2
- 2023年
- 为分析绒山羊皮肤中受Hippo信号通路调控的绒生长候选基因集,本研究选取6只罕山白绒山羊随机分为对照组和褪黑素处理组,每组设3个重复。以自然年为试验周期,每月采集皮肤样本进行RNA测序,使用Bowtie、TopHat、Cufflinks、Cuffmerge、Cuffdiff、Cuffcompare、CPAT和CPC软件分析DE-mRNA和DE-lncRNA,联合PCA分析它们对次级毛囊生长周期的应答,利用WGCNA挖掘调控山羊绒生长的基因模块,GSEA分析候选基因集的生物学功能。结果表明:1)筛选得到组间DE-mRNA 2024个和DE-lncRNA 329个,它们应答了绒山羊皮肤次级毛囊的生长周期。2)获得有生物学意义的对照组7个和试验组9个基因模块。3)深入分析富集到平衡哺乳动物皮肤生长分化、毛囊形态发生的Hippo信号通路基因模块,揭示了外源褪黑素诱导下调控山羊绒生长候选基因集191个mRNA和49个lncRNA的共表达调控网络关系。4)发现候选基因集与皮肤发育生物学过程(|NES|>1且FDR<25%)、Hippo信号通路(|NES|>1且FDR<25%)、Wnt信号通路(|NES|>1且FDR<25%)和细胞周期(|NES|>1且FDR<25%)显著关联。综上,确定了调控山羊绒生长的关键通路Hippo信号通路,在组学水平从基因集角度解析了调控山羊绒生长的mRNA和lncRNA的共表达调控关系,为进一步研究外源褪黑素促山羊绒生长的机制提供参考。
- 贾纯琰贾纯琰付绍印丽春
- 关键词：绒山羊皮肤褪黑素
- 褪黑素在哺乳动物皮肤中的生物学功能及对山羊绒生长的调控作用被引量：1
- 2022年
- 褪黑素(melatonin, MT)可促进山羊绒的生长,提高山羊绒的产量,增加养羊业的经济效益。本文阐述了哺乳动物皮肤中褪黑素的生物合成、代谢和功能,对褪黑素调控山羊绒生长的国内外研究进展进行了综述,对未来研究方向进行了展望,以期为绒山羊研究人员深入探索褪黑素促山羊绒生长的机理提供参考。
- 贾纯琰贾纯琰付绍印丽春
- 关键词：褪黑素皮肤绒山羊
- 长链非编码RNA的调控机制及其在家畜中的预测方法被引量：4
- 2017年
- 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200个核苷酸,不参与蛋白编码的功能性RNA分子,直接以RNA形式在表观遗传水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平调控基因的表达,在家畜体内的各种生物学过程中起重要作用。作者对长链非编码RNA的来源、分类和结构特征、实现生物学功能的4种分子调控机制(信号分子、诱饵分子、引导分子、支架分子)、调控基因表达的5个层面及采用高通量RNA测序技术分析测序数据和预测家畜lncRNA的方法进行了综述,为合理地研究家畜的lncRNA提供基础。家畜lncRNA预测方法主要包括深度测序、转录组重建、新转录本预测、lncRNA识别4个部分,在lncRNA识别阶段,作者所在研究团队前期采用将蛋白质编码潜能评估工具CPAT(coding potential assessment tool)和在线的序列编码能力预测工具CPC(coding potential calculator)结合取交集的方法,较好地从预测得到的大量的候选转录本中快速排除具蛋白编码能力的转录本,预测获得68 604条内蒙古绒山羊的皮肤组织lncRNA,丰富了NONCODE数据库中羊lncRNA转录本的基础数据。
- 贾纯琰季小阳白雪戴豪扬王建蒙张文广
- 关键词：长链非编码RNA
- 一种马匹用可调高喂水装置
- 本实用新型公开了一种马匹用可调高喂水装置，包括立柱、喂水槽、太阳能板、紫外消毒灯、电热板；所述立柱的底面设有预埋件；所述立柱为U型钢结构，所述立柱的两侧面等距设有通孔，且通孔位置一一对应；所述立柱的顶面设有支撑架，所述支...
- 赵宇飞王怀栋付和平杜晨光曹晓娟郭永清陈玉洁贾纯琰赵姝娴
- 文献传递
- 高职院校畜牧兽医专业新时代“课程思政”改革方法与路径被引量：1
- 2023年
- [目的]探索并实践高职院校畜牧兽医专业融合课程思政的方法与路径。[方法]以总书记对高校思想政治教育做出的重要指示为指导,立足高职院校畜牧兽医专业人才培养方案,从研究对象、研究目标和研究思路3方面探索与实践。[结果]创新了教学理念、教学方法、课程考核方式和教学评价体系。[结论]提升了教师开展课程思政建设的能力,培养了学农知农爱农强农兴农的人才。
- 贾纯琰李国俊丁国和陈玉洁
- 关键词：高职畜牧兽医
- 生物信息资源在家畜育种教学中的实践与探索
- 生物信息学是一门新兴的交叉学科,生物信息学实验在生物信息学教学中占有重要地位。总结了生物信息学实验教学中的使用和检索方法 ,并将其在生物信息学实验教学中进行了应用,取得了良好的教学效果,为培养创新应用型人才奠定了基础。伴...
- 贾纯琰
- 文献传递
- 调控山羊绒生长mRNA和lncRNA基因簇及关键信号通路的生物信息学分析
- 2023年
- 【目的】分析绒山羊皮肤中受外源褪黑素诱导的调控山羊绒生长mRNA和lncRNA基因簇及关键信号通路,为从基因簇角度解析外源褪黑素促山羊绒生长的分子机制提供参考。【方法】选取6只罕山白绒山羊,随机分为对照组和埋植组(褪黑素处理),每组3个重复。以自然年为试验周期,每月采集皮肤样本进行RNA测序,使用Bowtie、TopHat、Cufflinks、Cuffmerge、Cuffdiff、Cuffcompare、CPAT和CPC软件分析差异表达mRNA(differentially expressed mRNA,DE-mRNA)和差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DE-lncRNA),利用Mfuzz程序包挖掘调控山羊绒生长的基因簇,利用GSVA和GGally程序包分析调控山羊绒生长的信号通路。【结果】筛选得到组间DE-mRNAs 2024个和DE-lncRNAs 329个,获得对照组和褪黑素处理组各8组不同动力学模式的基因簇。对照组基因簇通过Hippo信号通路、对白细胞介素-1的应答、角蛋白纤维、中间纤维、黑色素生成、细胞周期、FoxO信号通路、Wnt信号通路、Hh信号通路和p53信号通路等参与调控山羊绒生长;褪黑素处理组基因簇通过中间纤维、PI3K-Akt信号通路、聚合细胞骨架纤维、TGF-beta信号通路、生长因子活性、Wnt信号通路、Hippo信号通路、ECM与受体相互作用、p53信号通路和间隙连接等参与调控山羊绒生长。DE-mRNA和DE-lncRNA的相关性研究结果显示,外源褪黑素诱导下55个mRNAs和10个lncRNAs协调互作(PCC>0.960),调控山羊绒生长的共表达网络关系。基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)可视化了FoxO、p53、PI3K-Akt、Wnt、Hh、Hippo和TGF-beta信号通路在绒山羊皮肤次级毛囊发育不同时期调控山羊绒生长的动态矩阵。外源褪黑素诱导下p53信号通路与FoxO信号通路呈极显著正相关(r=0.843,P<0.01);Hh信号通路与Hippo(r=0.836,P<0.01)、TGF-beta(r=0.868,P<0.01)、Wnt(r=0.790,P<0.01)、PI3K-Akt(r=0.630,P<0.05)等信号通路均呈极显著或显著正相�
- 贾纯琰孙燕勇孙燕勇包永红
- 关键词：绒山羊褪黑素基因簇信号通路
- 一种双激光限高式批量喷码装置
- 本申请公开一种双激光限高式批量喷码装置，包括输送带输送带的上方等间距设置有用于放置、固定鸡蛋的夹持组件，且夹持组件的数量为至少两个以上，输送带的一侧设置有至少两个以上用于对鸡蛋的高度进行限定的限高构件，且限高构件的数量和...
- 陈玉洁郭永清杜晨光沈向华赵宇飞郭志凯贾纯琰赵志浩赵琦
- 文献传递
- 《家畜育种原理与应用技术》融合课程思政的探索与实践
- 2023年
- 《家畜育种原理与应用技术》课程是动物科学专业、畜牧兽医技术专业的一门主干课。从教学目标、教学设计和教学评价三方面,探索并实践了《家畜育种原理与应用技术》融合课程思政的方法与路径,提升了教师开展课程思政建设的能力,培养了学农知农爱农强农兴农的人才。
- 贾纯琰丁国和王晓铄陈玉洁赵宇飞
- 关键词：家畜育种
