王建蒙
- 作品数:5 被引量:13H指数:2
- 供职机构:内蒙古农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 褪黑激素对内蒙古绒山羊皮肤中let-7家族及其靶基因的影响被引量:5
- 2019年
- 旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材料,利用qRT-PCR技术检测皮肤组织中11个let-7家族成员的表达变化,结合RNA-Seq技术分析let-7家族靶基因的表达变化。结果表明:1)在整个皮肤毛囊周期内,MT上调let-7b、let-7e、let-7a-3p的表达,下调let-7f、let-7g、let-7c、let-7a-5p、let-7d、miR-98的表达。2)在4月份,MT上调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,下调PTGS2、PLCG1等靶基因的表达;下调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,上调TGIF2、RBL1等靶基因的表达。3)在6月份,MT下调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,上调PTGS2、PLCG1、SRC等靶基因的表达;上调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,下调GDF5、TGIF2、RBL1等靶基因的表达。4)let-7家族成员的靶基因主要参与VEGF、TGF-β、Oxytocin和NF-kappa B信号通路,在细胞过程、激素调节和转录因子调控方面发挥重要作用。综上表明,MT可能通过改变let-7家族重要成员的表达水平,影响相应靶基因的表达,进而在皮肤毛囊的周期性生长过程中发挥重要作用,研究结果为进一步揭示MT介导miRNAs影响羊绒生长的分子机理提供了理论依据。
- 王建蒙付绍印丽春付绍印丽春白雪刘永斌张文广
- 关键词:内蒙古绒山羊皮肤褪黑激素靶基因
- 长链非编码RNA的调控机制及其在家畜中的预测方法被引量:4
- 2017年
- 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200个核苷酸,不参与蛋白编码的功能性RNA分子,直接以RNA形式在表观遗传水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平调控基因的表达,在家畜体内的各种生物学过程中起重要作用。作者对长链非编码RNA的来源、分类和结构特征、实现生物学功能的4种分子调控机制(信号分子、诱饵分子、引导分子、支架分子)、调控基因表达的5个层面及采用高通量RNA测序技术分析测序数据和预测家畜lncRNA的方法进行了综述,为合理地研究家畜的lncRNA提供基础。家畜lncRNA预测方法主要包括深度测序、转录组重建、新转录本预测、lncRNA识别4个部分,在lncRNA识别阶段,作者所在研究团队前期采用将蛋白质编码潜能评估工具CPAT(coding potential assessment tool)和在线的序列编码能力预测工具CPC(coding potential calculator)结合取交集的方法,较好地从预测得到的大量的候选转录本中快速排除具蛋白编码能力的转录本,预测获得68 604条内蒙古绒山羊的皮肤组织lncRNA,丰富了NONCODE数据库中羊lncRNA转录本的基础数据。
- 贾纯琰季小阳白雪戴豪扬王建蒙张文广
- 关键词:长链非编码RNA
- 基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响被引量:2
- 2018年
- 为了研究褪黑激素(melatonin,MT)对绒山羊皮肤毛囊基因表达的影响,筛选与皮肤毛囊发育相关的重要基因,选取处于皮肤毛囊发育生长起始点(5月)的内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分别作为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),以绒山羊个体皮肤组织为试验材料,对其进行RNA-Seq测序,利用生物信息学方法对转录组数据进行分析,在测序数据质量控制的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。结果表明,共筛选获得了462个在埋植组与对照组中差异表达的基因,其中,上调表达208个,下调表达254个;KEGG富集性分析表明差异表达基因主要参与:代谢途径、不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢、癌症信号通路、鳞状细胞癌信号通路、黑色素合成、Wnt信号通路以及补体和凝血级联反应等,Wnt信号可能在褪黑激素调控皮肤毛囊发育中发挥重要作用。研究结果为进一步阐明褪黑激素影响毛囊生长的分子机理提供了依据。
- 丽春付绍印付绍印王建蒙
- 关键词:褪黑激素绒山羊转录组差异表达基因
- 等位基因特异性表达形成机制及其应用的研究进展
- 2019年
- 基因作为遗传信息的介质,决定了生物的性状表现。基因序列变异的发生是生物体适应环境变化的必然趋势。在二倍体生物中等位基因是一对控制着相对性状的基因,因此,等位基因特异性表达效应根据细胞类型和发育阶段的不同而变化,表现出不同个体之间的差异。等位基因差异表达对基因的表达起到重要的调控作用,并最终可能与生物的表型多态性联系起来。等位基因特异性表达分析已经在动物研究中得到广泛应用,有助于提高鉴定调控遗传变异的能力。对等位基因特异性表达的形成机制及其应用研究进展进行了综述,以期为进一步揭示等位基因特异性表达的遗传学机制,以及加快其在动物生产中的应用提供理论依据。
- 戴豪杨白雪王建蒙王建蒙付绍印刘永斌张文广
- 杂种优势的应用及基因表达的特点被引量:2
- 2018年
- 杂种优势在动植物育种中得到广泛应用,然而对杂种优势分子遗传机理的研究还处在初级阶段。随着生物信息学的不断发展,对其基因表达数量和表达模式的研究也就越来越多,因为父母本的不同,杂交子代的基因在数量和功能上都存在明显差异;杂交子代融合基因的表达会发生父母本的偏向性,继而影响其表型;杂交子代中因为父母本印记的差异,导致其性状和功能有所不同。总结了杂交子代中差异基因、融合基因和印记基因的表达情况,为深入理解杂种优势的分子遗传机理提供新的切入点。
- 王艳欣王月星王月星王建蒙王位戴豪杨王建蒙
- 关键词:杂种优势父母本基因表达