肖光辉 作品数:13 被引量:20 H指数:2 供职机构: 陕西师范大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点实验室开放基金 陕西省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 文化科学 医药卫生 更多>>
棉花叶片黄化基因GhYL1的筛选、鉴定及功能分析 棉花是世界上重要的经济作物之一,目前棉花研究主要集中在纤维生长发育和抗逆性方面,而对棉花叶片生长发育的研究很少.植物叶片是进行光合作用的重要器官,叶片的发育直接影响植物光合作用和产量.PPR(Pentatricopept... 何鹏 张丽华 牟亚楠 汤梅菊 肖光辉 俞嘉宁关键词:棉花 VIGS 叶片黄化 叶绿体 Sequencing of cultivated Upland cotton provides insights into genome evolution 肖光辉陆地棉OFP基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:1 2022年 OVATE Family Protein(OFP)是一类植物特异性转录因子,广泛参与植物的生长发育,其在棉花中的研究尚未见报道.本研究从陆地棉NDM8基因组中共鉴定到61个GhOFP基因,系统聚类将其分为6个亚组(CladeⅠ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ和Ⅵ).转录组和q RT-PCR分析表明,棉纤维发育的起始和伸长阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在CladeⅡ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有促进伸长生长的赤霉素和生长素响应的顺式元件;在棉纤维发育的次级细胞壁加厚阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在CladeⅥ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有参与细胞壁生长的脱落酸、茉莉酸和水杨酸响应的顺式元件.陆地棉GhOFP基因家族的全基因组鉴定和分析将为进一步研究棉花GhOFP基因在棉纤维发育过程中的生物学功能提供参考. 窦玲玲 田再垄 李婷婷 马雄风 肖光辉关键词:陆地棉 系统进化 陆地棉Nudix基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:2 2021年 【目的】Nudix是一类能够催化各种核苷二磷酸衍生物水解的酶,具有维持遗传物质稳定,响应逆境胁迫等生物学功能。本研究旨在对陆地棉Nudix基因进行全基因组分析,为深入研究Nudix基因家族参与棉纤维生长发育调控机制提供参考。【方法】通过生物信息学方法对陆地棉基因组(ZJU_v2.1)的Nudix基因进行全基因组鉴定,并系统分析Nudix基因家族成员的理化性质、序列特征、基因复制、系统进化和表达情况。【结果】从陆地棉基因组中共鉴定到76个GhNudix基因,经聚类分析将其分为7个亚组(CladeⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ)。基因复制分析表明,片段重复是陆地棉GhNudix基因家族成员扩增的主要原因。转录组数据表明GhNudix基因的表达不但有组织特异性而且有时间特异性。其中在纤维发育的起始和伸长阶段高调表达的GhNudix基因主要分布在CladeⅠ和Ⅱ;且大部分CladeⅠ和Ⅱ亚组的GhNudix基因启动子含有响应生长素和赤霉素的顺式作用元件,由此推测CladeⅠ和Ⅱ亚组的GhNudix基因在陆地棉纤维的起始和伸长阶段发挥作用。【结论】陆地棉GhNudix基因家族的全基因组鉴定和分析,为后续研究其在棉纤维发育中的作用机制提供参考。 窦玲玲 孙亚如 赵琴 田瑞洁 康洋洋 朱怡然 杨蕾蕾 王彩虹 冯宇 王文博 肖光辉关键词:陆地棉 系统进化 基于全长转录组测序的掌叶大黄R1-MYB基因家族鉴定分析 被引量:3 2023年 作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB家族基因,分析其编码蛋白的理化、结构域及分子进化等特性,利用RNA-seq进行基因组织表达分析,并检测RpMYB24响应激素、非生物胁迫的表达模式。结果表明,共鉴定到掌叶大黄49个R1-MYB家族基因,主要编码热稳定的亲水蛋白,大部分定位于细胞核。各蛋白无规卷曲和α螺旋所占比例较大,存在MYB家族标志性的W型保守氨基酸。掌叶大黄R1-MYB家族成员分布于CCA1(circadian clock associated 1)-like、I-box(GATAAG)-like、CPC(CAPRICE)-like、TRF(telomere repeat binding factor)-like和TBP(TATA binding protein)-like 5个亚组,且CCA1-like数量居多。RNA-seq揭示49个R1-MYBs基因在掌叶大黄根、根茎及叶中差异表达,根及根茎中分别有15、23个基因表达量高于叶中。发现RpMYB24基因受脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)的诱导,且能显著应答损伤、低温或高温胁迫,但对干旱胁迫响应不显著。本研究系统鉴定了掌叶大黄R1-MYB家族基因及其分子特征,为下一步开展基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。 赵霞 李元敏 李依民 肖光辉 张明英 程文萍 高静 高静 张岗关键词:掌叶大黄 转录因子 胁迫 陆地棉PPR-SMR基因家族的鉴定及GhPPR-SMR6c的功能研究 棉花是世界上重要的经济作物,品种改良是棉花育种的重要课题.近年来,随着二倍体棉花和四倍体棉花基因组测序的完成,利用生物信息学方法对棉花功能基因进行大规模筛选已成为可能.PPR-SMR(Pentatricopeptide ... 刘昊 韩璜 章莉 何鹏 肖光辉 俞嘉宁关键词:陆地棉 VIGS 基因家族 亚细胞定位 棉花叶片黄化基因GhYL1的筛选、鉴定及功能分析 棉花是世界上重要的经济作物之一,目前棉花研究主要集中在纤维生长发育和抗逆性方面,而对棉花叶片生长发育的研究很少。植物叶片是进行光合作用的重要器官,叶片的发育直接影响植物光合作用和产量。PPR(Pentatricopept... 何鹏 张丽华 牟亚楠 汤梅菊 肖光辉 俞嘉宁关键词:棉花 VIGS 叶片黄化 叶绿体 文献传递 新时期高校教学改革初探 被引量:1 2017年 在传统的学校教育中,接受性学习方式能够在短时间内把前人的成果转化为学习者自己的知识。长此以往,大学生逐渐缺乏自主学习的意识和挖掘学习兴趣的能力。然而目前,创新成为成功人士必不可少的一种能力。因此,本文从新时期的高校改革出发,讨论了如何激发大学生的学习兴趣,提高创新能力,从而培养出更多的创新型人才。 肖光辉关键词:教学改革 大学生 PBL教学法与案例分析法相结合在生物化学教学中的应用 被引量:11 2017年 生物化学是研究生物体中各种化学进程的一门基础性学科,具有很强的综合性,内容庞大,结构复杂。随着生命科学的飞速发展和国家教学改革的快速推进,在生物化学教学中引入新的教学方法,提高学生创新思维与综合素质势在必行。在生物化学教学中引入PBL教学法和案例分析法相结合的教学方法,能有效提高教学效果,并建立有效的教学评估体系。 肖光辉 王婵关键词:PBL教学法 生物化学 陆地棉PPR-SMR基因家族的鉴定及GhPPR-SMR6c的功能研究 棉花是世界上重要的经济作物,品种改良是棉花育种的重要课题。近年来,随着二倍体棉花和四倍体棉花基因组测序的完成,利用生物信息学方法对棉花功能基因进行大规模筛选已成为可能。PPR-SMR(Pentatricopeptide ... 刘昊 韩璜 章莉 何鹏 肖光辉 俞嘉宁关键词:陆地棉 VIGS 基因家族 亚细胞定位 文献传递