公共文化服务平台

共 3 条记录，以下是 1-3

全选清除导出

排序方式：

糜子叶绿体基因组密码子使用偏性的分析被引量：49: 2017年; 密码子使用偏性(CUB)是生物体重要的进化特征,对研究物种进化、基因功能以及外源基因表达等具有重要科学意义。本研究利用糜子(Panicum miliaceum L.)叶绿体基因组中筛选出的53条蛋白编码序列,对其密码子使用模式及偏性进行了分析。结果表明,糜子叶绿体基因的有效密码子数(ENC)在37.14~61之间,多数密码子的偏性较弱。相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现,RSCU>1的密码子有32个,其中28个以A、U结尾,表明第3位密码子偏好使用A和U碱基。中性分析发现,GC_3与GC_(12)的相关性不显著,回归曲线斜率为0.2129,表明密码子偏性主要受到自然选择的影响;而ENC-plot分析发现大部分基因落在曲线的上方及周围,表明突变也影响了密码子偏性的形成。进一步的对应性分析发现,第1轴为主要影响因素,解释了17.92%的差异,其与ENC、GC_3S值的相关性均达到显著水平,但与CBI、GCall不相关。最后,9个密码子被鉴定为糜子叶绿体基因组的最优密码子,糜子叶绿体基因组的密码子使用偏性可能受选择和突变共同作用。; 刘慧王梦醒岳文杰邢光伟葛玲巧聂小军宋卫宁; 关键词：糜子叶绿体密码子偏好性

小麦LBD基因家族的全基因组鉴定、表达特性及调控网络分析被引量：12: 2017年; 为深入发掘小麦LBD基因的功能,利用小麦最新基因组数据,通过生物信息学手段,对小麦LBD基因家族进行了鉴定,并对其表达特性及调控网络进行了分析。鉴定结果表明,本研究得到了75个小麦LBD基因,根据系统进化分析结果,可将它们划分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族。染色体定位结果表明,除了5D和7D外,其余染色体均含有LBD基因。共表达调控网络分析表明,15个LBD基因参与了小麦功能基因调控。利用RNA-seq数据对所有小麦LBD基因在不同组织以及不同逆境胁迫下的表达情况进行分析表明,小麦LBD基因在不同组织间和胁迫下存在着差异表达,多个组织特异和胁迫响应相关LBD基因被鉴定到,可作为后续功能研究的候选基因。; 邢光伟王梦醒马小飞赵贤张婷聂小军宋卫宁; 关键词：小麦逆境胁迫表达谱

小麦LBD基因家族的全基因组鉴定、表达特性及调控网络分析: 小麦是世界上最重要的粮食作物之一.从遗传上讲，其是由三个近缘祖先种经历两轮自然杂交而产生的异源六倍体.因此，小麦的基因组巨大且复杂(约17 Gb)，为开展小麦基因组研究带来了巨大挑战.2014年，基于单条染色体测序的小麦...; 邢光伟聂小军宋卫宁; 关键词：小麦逆境胁迫表达谱

全选清除导出

共1页<1>

邢光伟