周颖
- 作品数：2 被引量：20H指数：2
- 供职机构：陕西师范大学计算机科学学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 非平衡基因数据的差异表达基因选择算法研究被引量：11
- 2019年
- 针对准确率不适于评价不平衡数据特征子集性能的缺陷,提出了 F2 -measure(简称 F2 )准则.为避免mRMR(minimal Redundancy-Maximal Relevance)的互信息方法倾向于选择多值特征,提出了归一化互信息 SU (Symmetrical Uncertainty).针对最大化 AUC (Area Under an ROC Curve)框架下,特征选择算法的特征与类标相关性、特征间相关性的取值范围(量纲)不一致问题,提出了归一化的特征权重.为加快特征选择过程,提出了结合 SU和AUC 的特征预选择,缩小特征搜索空间.提出动态加权顺序前向搜索DWSFS(Dynamic Weighted Sequential Forward Search)和动态加权顺序前向浮动搜索DWSFFS(Dynamic Weighted Sequential Forward Floating Search),以期得到分类性能更好的特征子集.基于最大化 AUC 和mRMR框架,结合上述创新点,设计出16种特征选择算法.7个经典二类不平衡基因数据集、3个多类不平衡(或近似平衡)基因数据集的50次重复实验表明:所提算法选择的基因子集具有非常好的分类识别能力;提出的 F2、SU、归一化基因权重、基因预选择,以及DWSFS和DWSFFS对选择非平衡基因数据集的差异表达基因非常有效.提出的 SU 在度量基因冗余性时优于斯皮尔曼等级相关系数 RCC (Rank Correlation Coefficient);基因选择过程中的权值度量采用基因与类标相关性减去基因间冗余性优于采用基因与类标相关性除以基因冗余性方案.与现有经典基因选择算法的实验比较表明:提出的基因选择算法的性能优于现有基因选择算法.
- 谢娟英王明钊王明钊高红超周颖
- 关键词：基因选择AUC互信息不平衡数据
- 一种新聚类评价指标被引量：13
- 2015年
- 用于发现数据集类簇数k的常用内部评价指标DB(Davies Bouldin)和BWP(Between-within Proportion)等需要先确定一个搜索范围kmax,使数据集的类簇数满足k≤kmax,但如何确定kmax尚无理论指导。针对这一问题,提出一个新F统计量Fr,将Fr作为新聚类有效性准则,以判断聚类算法收敛与否,自适应地确定数据集类簇数;将Fr应用于快速K-medoids算法的收敛性判断,并以基于最小生成树的测地距离,即样本对在最小生成树上的路径长度,代替其间的直接欧氏距离度量样本相似性,得到一种自适应的快速K-medoids聚类算法,解决了K-medoids算法需要人为给定类簇数和不能发现任意形状簇的问题。UCI机器学习数据库数据集和人工模拟数据集实验测试表明,本文提出的Fr指标是一种有效的聚类算法评价指标,基于该指标和测地距离的K-medoids算法不仅能发现任意形状的簇,还可以自适应地确定数据集的类簇数,且对噪音数据有很好的鲁棒性。
- 谢娟英周颖
- 关键词：最小生成树
