【目的】探讨fMRI指导下的重复经颅磁刺激(repetitive transcranial magnetic stimulation,rTMS)对脑梗死患者运动功能康复的作用。【方法】选取急性期右侧放射冠区脑梗死患者50例,男28例,女22例,随机分为5组,每组10例,所有患者均接受改善循环、营养神经等同样的基础治疗方案。治疗组rTMS治疗前、后及90 d时接受Fugl-Meyer scale(FMA)评定手运动功能,同时各组患者还分别进行NIHSS(national institute of health stroke scale)和B(Ibarthel index)评分来评价其整体神经功能缺损情况和日常生活能力情况。对照组在入院时、14 d时及90 d时也进行FMA、NIHSS、BI评分。【结果】各组于治疗14 d及90 d时FMA,BI评分与治疗前比较有显著性差异(P<0.05),NIHSS评分在90 d时与治疗前比较有显著性差异(P<0.05)。【结论】fMRI指导下的低频rTMS刺激健侧大脑半球的M1区对脑梗死患者的早期手运动功能恢复有促进作用,对患者的整体神经功能和日常生活能力有远期的治疗效果。