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郑芳芳
作品数:
1
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供职机构:
苏州大学电子信息学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
姜敏
苏州大学电子信息学院
何涛
军事医学科学院生物工程研究所
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何涛
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姜敏
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郑芳芳
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军事医学
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1篇
2015
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急性和慢性髓性白血病细胞中可变剪接事件的识别
2015年
目的为揭示异常的可变剪接在肿瘤中发挥的作用,着重研究急性髓性白血病(AML)与慢性髓性白血病(CML)内显著差异的可变剪接事件以及剪接异构体。方法基于CML(K562)和AML(THP1、HL-60)细胞系的全转录组测序数据,在全基因组范围内采用Top Hat、MATS和Cufflinks计算识别可变剪接事件、重构剪接异构体和分析其差异表达。结果在AML和CML细胞间识别的130个基因在CML细胞系中特异性高表达,80个基因在AML两株细胞系内均表达上调。在CML与AML之间识别了337个差异表达的剪接异构体以及35个差异可变剪接事件。结论 AML与CML细胞系间存在显著差异的可变剪接事件和剪接异构体。白血病相关的可变剪接事件可作为其潜在的标志物或药物靶标。
郑芳芳
何涛
姜敏
关键词:
可变剪接
高通量测序
白血病
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