陈颖
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：北京理工大学生命学院更多>>
- 相关领域：文化科学农业科学医药卫生建筑科学更多>>
- 膀胱癌ceRNA网络的构建和相关lncRNAs的筛选
- 2024年
- 目的:探讨膀胱癌差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)、微小RNA(microRNAs,miRNAs)和竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)之间的相互作用机制,筛选潜在的lncRNA生物标志物。方法:使用生物信息学方法对多种数据库进行数据挖掘,得到膀胱癌差异表达的lncRNAs、miRNAs和mRNAs,并构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络。为了分析ceRNA网络行使的生物学功能,对ceRNA网络中的mRNAs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析并构建蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络。对ceRNA网络中的lncRNAs进行Kaplan-Meier生存曲线分析,筛选出与膀胱癌患者预后存在显著相关性的lncRNAs。结果:ceRNA网络中包括了17个lncRNAs、32个miRNAs和78个mRNAs。GO功能分析发现相关失调基因主要集中在蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶途径、酪氨酸激酶途径等方面。KEGG通路富集分析结果显示这些基因集中在MAPK信号途径、脂质和动脉粥样硬化通路等方面。PPI网络中可以看出核心蛋白质主要围绕在MAPK1、HSPA8和HNRNPD等方面。通过Kaplan-Meier生存曲线分析发现共有6个lncRNAs与膀胱癌患者预后存在显著相关性,分别为C3orf35、ZBTB20-AS1、LINC00112、ARHGAP5-AS1、ARAP1-AS2和CYB561D2。结论:不同的lncRNAs参与了膀胱癌的发病机制;构建的ceRNA调控网络有助于增加对膀胱癌发病分子机制的认识;筛选的lncRNAs为后续的实验研究提供了基础。
- 田虹陈颖唐力顾昊
- 关键词：肿瘤学膀胱癌生物标志物
- 基于网络平台的虚拟化团队教学模式应用研究被引量：2
- 2016年
- 该文阐述了团队教学的概念和优越性,基于网络平台,利用网络通讯工具,以植物生物学和生物信息学课程为例,探讨了虚拟化团队教学的必要性和实施效果。教学实践表明,虚拟化团队教学模式可以培养学生实践创新能力,提升高校教学软实力。
- 高志华杨虹陈颖蒋建伟杨亮
- 关键词：网络平台虚拟化团队教学模式
- 模拟微重力下RhoA活性对小鼠骨髓间充质干细胞的影响
- 研究模拟微重力(SMG)对骨髓间充质干细胞(BMSCs)形态、细胞骨架、粘附性的影响,探讨RhoA 活性与模拟微重力效应之间的关系.在模拟微重力下培养C75BL/6 小鼠BMSCs,通过GST-CNFγ特异性维持RhoA...
- 陈颖胡东赵勤杜静静谭信
- 关键词：模拟微重力间充质干细胞RHOA细胞骨架
