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冯晶

作品数：1 被引量：2H指数：1
供职机构：武汉大学更多>>
发文基金：创新研究群体科学基金长江学者和创新团队发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇全基因组
  • 1篇基因
  • 1篇基因预测
  • 1篇基因组
  • 1篇PPR
  • 1篇TPR
  • 1篇HMM
  • 1篇PERL

机构

  • 1篇武汉大学

作者

  • 1篇朱英国
  • 1篇李阳生
  • 1篇张菁晶
  • 1篇冯晶

传媒

  • 1篇遗传

年份

  • 1篇2006
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
全基因组预测目标基因的新方法及其应用被引量：2
2006年
运用隐马尔可夫模型,利用Perl编程,以几种模式生物的蛋白质数据库为基础,构建了目标基因的全基因组预测的新方法。该方法具有高通量,准确度高且操作简易等优点,特别在多结构域蛋白家族预测上更显优势。应用该方法对几种模式生物的全基因组PPR和TPR蛋白家族进行了预测,其中粳稻日本晴中含有536个PPR蛋白、199个TPR蛋白;籼稻9311中含有519个PPR蛋白、177个TPR蛋白;拟南芥中含有735个PPR蛋白、292个TPR蛋白;红藻中6个PPR蛋白、32个TPR蛋白;蓝细菌以及古细菌中没有PPR蛋白,但蓝细菌含有10个TPR蛋白,古细菌有4个TPR蛋白,并对所得结果进行了进一步生物信息学分析。
张菁晶冯晶朱英国李阳生
关键词：基因预测PERLHMM全基因组PPRTPR
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