邹勇 作品数:11 被引量:14 H指数:3 供职机构: 华东师范大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 上海市自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 更多>> 相关领域: 理学 文化科学 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
复杂运动情境下AMPK的多位点修饰及其活性调节——基于蛋白质结构生物学的解析 2023年 腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)以异源三聚体的形式广泛存在于真核生物体内,被认为是细胞的能量感受器和机体的核心代谢调节因子。运动与AMPK的相关研究已持续数十年,研究发现:1)急性运动迅速激活AMPK;2)长期训练提升安静状态AMPK的活性;3)长期训练减弱AMPK对运动的应激反应。这表明AMPK对研究中设置的运动情境很敏感。AMPK的蛋白结构包含多个磷酸化位点,以及泛素化、SUMO化、乙酰化、甲基化和氧化位点,这些位点的共价修饰大部分是可逆和可组合的。通过结构生物学的解析可以预测,AMPK蛋白复合物并非只有简单的激活态与失活态,α-Thr172磷酸化不一定是AMPK酶活性的生物标记。多个位点的翻译后修饰以及变构调节,让AMPK亚基可能组合成不同中间状态,蛋白结构的柔性让AMPK能够以不同活性形态应对复杂的生理情境(包括复杂的运动情境)。未来的研究可以探讨多位点修饰与AMPK活性之间的对应关系,从而进一步解析AMPK对运动的响应机制。 王静艺 邹勇 漆正堂关键词:AMPK 结构生物学 非线性时间序列的复杂网络分析 被引量:6 2020年 近十多年,运用复杂网络的方法进行时间序列分析,是非线性动力学发展的最新方向,为传统的以混沌理论为基础的非线性时间序列分析注入了新生力量,在刻画动力系统非线性特征方面,提供了很多崭新的见解,在很多不同领域内都取得了广泛应用.本文回顾三种主要的方法:递归网络、可视图以及转换网络.着重介绍三种网络方法的理论基础和各自的最新进展.本文将指明今后时间序列网络方法的发展方向,并为实际数据分析提供指导作用. 邹勇 DONNER Reik V MARWAN Norbert DONGES Jonathan F KURTHS Jürgen关键词:复杂网络 非线性动力学 回归性 运动改善ASMT基因敲除小鼠抑郁行为的海马蛋白质组学机制 2024年 目的利用定量蛋白质组学技术探究N-乙酰基-5-羟色胺-甲基转移酶(N-acetyl-5-hydroxytryptamine-methyltransferase,ASMT)基因敲除及运动干预对小鼠抑郁行为及海马蛋白质组的影响。方法将雄性ASMT基因敲除小鼠及野生型小鼠随机分为安静组和运动组。5周的游泳运动干预结束后全部进行抑郁行为学检测。行为学结束后进行麻醉处死取海马组织。采用TMT标记定量蛋白质组学技术检测海马组织中的蛋白表达情况,并运用生物信息学方法分析。结果ASMT基因敲除后小鼠具有显著的抑郁行为表型,游泳运动干预后可以显著改善。筛选出的差异蛋白功能集中在突触信号通路、突触化学传递的调控、突触囊泡循环、神经发生、神经系统发育的调控、长时程突触增强、SNARE复合体聚集等。结论ASMT基因敲除可能会通过海马突触前膜的SNARE家族蛋白过度表达诱导谷氨酸的过度释放并产生神经毒性,进而产生抑郁行为;游泳运动可能通过调节突触转运相关蛋白SNAP25维持神经递质稳态,促进神经发生水平和突触可塑性,进而使ASMT基因敲除小鼠抑郁行为得到改善。 章森 刘文彬 夏杰 夏杰 夏杰 邹勇 漆正堂 邹勇关键词:游泳运动 抑郁行为 海马 蛋白质组学 连续混沌系统时间序列的可视图分析 2016年 以连续混沌系统时间序列为例,通过可视图方法分析其可行性,研究结果表明网络的度分布并不是幂率分布;并且发现同一个混沌系统的两个变量所对应的度序列之间存在很大的关联性,且序列中大数值点基本上都没有成为网络中的大度点。通过详细的对比分析得出时间序列的二阶导数和网络度大的节点间存在一定关系。可视图的全局统计量可以很好刻画系统的分岔过程,因此,可视图方法完全可以用来分析连续混沌系统的时间序列。 张蓉 邹勇关键词:复杂网络 非线性时间序列 混沌 可视图复杂网络度分布拟合比较研究 被引量:3 2017年 可视图(Visibility Graph,VG)算法为研究时间序列的动力学特性提供了复杂网络的思想.网络的度分布反映了时间序列的动力学特征.通过自回归随机过程和分数布朗运动两种不同数据,分别构建可视图.对比结果表明,在自回归随机过程中,度分布可以用指数函数刻画;而在分数布朗运动中,度分布用幂律函数刻画更为合适.这一结论不但适用于VG算法,同时也适用于水平可视图(Horizontal Visibility Graph,HVG)算法. 张蓉 邹勇关键词:分数布朗运动 基于机器学习方法的混沌相位同步预测 机器学习方法最近成为研究混沌系统无模型预测的重要工具。其中,储层计算(Reservoir Computing,RC)由于其结构简单、快速学习的特性,在众多机器学习算法种脱颖而出,被广泛应用于信号处理、时间序列预测、混沌系... 邹勇关键词:混沌同步 基于相位同步动力学重构网络单纯复形的相互作用 2024年 复杂网络的高阶相互作用,如单纯复形和超边等,已经成为了研究的热点.本文提出一种基于节点同步动力学的特性来重构网络的单纯复形结构的新方法.通过分析Kuramoto-Sakaguchi模型中节点相位的时间序列同步性,建立了网络拓扑结构的解析描述,实现了对网络结构的精确辨识.该方法的核心在于,运用理论手段推导得到了拉普拉斯矩阵与线性化Kuramoto-Sakaguchi系统相位之间的解析联系.这一联系不仅具有强大的普适性,而且能够有效地应用于识别包含任意阶单纯复形相互作用的网络结构.本文的研究进一步表明,这种解析关系能够用于鉴别网络中的对称节点,并且通过数值模拟证实了间接相互作用节点之间发生遥同步的现象与网络结构的对称性有着密切的联系.这些发现为深入理解网络的结构特性和动力学行为提供了新的理论工具和视角. 罗恺明 管曙光 邹勇关键词:复杂网络 单纯复形 相位同步 鸢尾素介导运动干预神经精神疾病的潜在机制 被引量:1 2023年 围绕鸢尾素介导运动干预神经精神疾病的最新研究进展,系统梳理鸢尾素通过作用于中枢神经系统促进产生神经营养因子、改善神经元功能、促进神经元增殖和神经发生、改善脑内能量代谢和氧化应激水平、降低神经毒性作用等功能,从外周途径阐述鸢尾素信号通路在运动改善抑郁症、阿尔茨海默病、帕金森综合征等神经精神疾病中的作用机制。发现鸢尾素在运动改善神经精神疾病中起着积极的调控作用,运动诱导的鸢尾素水平会随运动强度的不同而发生改变。肌肉与脑存在着一种以内分泌为主导的通路,骨骼肌作为一种内分泌器官可调控大脑健康和稳态,鸢尾素信号通路可介导运动对神经精神疾病的干预。运动引起的骨骼肌收缩产生的鸢尾素通过外周途径调控大脑的脑源性神经营养因子(BDNF)水平,进而对情绪、认知及神经功能发挥调控作用。 章森 邹勇 漆正堂 漆正堂关键词:神经精神疾病 神经保护 线粒体异质性比“多少”更重要——运动促进线粒体生物发生的起因、风险与科学范式的思考 被引量:1 2021年 运动促进许多器官和组织的线粒体生物发生,所以“运动通过XXX促进线粒体生物发生预防或改善XXX疾病”已成为一种科学范式。该范式引导着我们对现有数据的解释以及对未来的科学假设。然而,随着单细胞基因测序的实现,越来越多证据显示,只强调“线粒体生物发生”可能抹杀了线粒体个体间的异质性。把“运动促进线粒体生物发生”定义为积极的生理适应,会与复杂病理经常发生解释上的矛盾,因为线粒体增多也有“副作用”,运动激活的信号通路也参与疾病进程。综合实验依据和进化证据认为:运动促进线粒体生物发生是细胞对摄氧量增加的唯一选择,不一定有利于改善疾病。在基因缺陷或特定病理模型中,运动促进异质性或不完全的线粒体生物发生以应对氧压力增大。总之,线粒体类型、分布与ATP去路要匹配,这比线粒体数量增多更重要,运动对线粒体异质性的调控以及线粒体内部之间的关系更值得关注。 漆正堂 邹勇 丁树哲关键词:线粒体 多样性 活性氧 不同运动能力小鼠在定制负荷运动适应中骨骼肌的基因转录响应——以细胞自噬与线粒体有关基因为例 被引量:3 2022年 运动能力的差异是生物个体间客观存在的。本研究以细胞自噬与线粒体有关基因为例,探讨不同年龄不同运动能力小鼠在运动适应中骨骼肌进行基因选择性表达的转录调控机制,以及骨骼肌基因响应的个性化特征。将清洁级ICR小鼠分为青年对照组(YC)、青年运动组(YR)、成年对照组(AC)、成年运动组(AR),每组10只。采用递增负荷的运动能力测试确定青年、成年小鼠可以承受的最大跑速,YR、AR组小鼠按各自最大跑速的65%~75%进行耐力训练,每天训练1 h,持续4周。取腓肠肌测试mtDNA、ATP含量以及Caspases酶活性,实时荧光定量PCR检测mRNA表达,Western blot检测蛋白表达,用染色质免疫沉淀+PCR(ChIP-PCR)检测p53、ERRα与靶基因启动子结合的DNA片段。结果表明(1)骨骼肌mtDNA含量在成年小鼠运动后显著提高,ATP含量在成年、青年小鼠运动后均显著提高。(2)运动显著提高成年小鼠Caspase 3,8,9的酶活性,但是对青年小鼠无显著影响。(3)成年、青年小鼠自噬基因对运动响应显著,但线粒体生物发生、COX复合物、代谢调控有关基因只在成年小鼠对运动响应显著。(4)运动促进p53、ERRα与靶基因Tfam、SCO2、PUMA、Bax启动子的结合,但在成年、青年小鼠中靶基因转录水平不一致。结论即使保持相对一致的运动负荷,青年小鼠骨骼肌自噬与线粒体有关基因对运动的响应也比成年小鼠低。尽管运动促进p53、ERRα与靶基因启动子的结合,但靶基因在mRNA水平并不一定表达上调。 漆正堂 刘静霞 钱帅伟 钱帅伟 邹勇 王贵平关键词:骨骼肌 染色质免疫沉淀 自噬 线粒体