郝耀彤
- 作品数：7 被引量：34H指数：3
- 供职机构：中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生环境科学与工程更多>>
- 草鱼肠道微生物抗生素抗性基因研究被引量：12
- 2019年
- 水产养殖过程中抗生素的过度使用导致耐药菌株不断出现,细菌耐药性成了威胁公共安全的一个全球性问题。抗性基因是细菌产生耐药性的根本原因,动物肠道微生物是抗性基因的储存库,目前我国对水产养殖动物消化道微生物抗生素抗性基因的研究匮乏。为探究草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道微生物中抗性基因的类型和丰度,通过提取草鱼肠道内容物的基因组DNA,采用shotgun宏基因组技术进行测序和序列注释,分析草鱼肠道内容物微生物数据,对比抗性基因数据库ARDB筛选出微生物序列中的抗性基因。结果表明,草鱼肠道内容物共有61554个可注释微生物的基因序列,包括409个真核生物序列、88个古细菌序列和61057个真细菌序列;共得到1011个抗性基因,归为123种基因型,包括78种单抗性基因型(679个单抗性基因),45种多抗性基因型(304个多抗性基因),多抗性基因数量占抗性基因总数的30.1%,说明草鱼肠道中可能存在大量的多重耐药性微生物;检出草鱼肠道中数量最多的抗性基因是抗大环内酯类抗生素基因MacB,产生抗性基因数量最多的是大环内酯类抗生素。研究结果可为水产养殖中抗生素的使用监管提供基础数据,验证了宏基因组测序技术检测抗性基因的可行性。
- 赵帝徐在言吴山功熊凡熊凡
- 关键词：草鱼抗性基因微生物
- 草鱼肠道微生物对食物改变适应性变化的研究被引量：17
- 2015年
- 对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)先饲喂人工饲料再饲喂苏丹草,运用PCR-DGGE的方法,比较了食物改变引起的草鱼肠道微生物菌群结构的变化过程。结果显示,饲喂同种饲料的草鱼后肠与前、中肠样品间菌群结构存在显著差异(TH0-F0=-2.268,P<0.05;TH0-M0=-2.470,P<0.05),饲喂不同种食物的相同肠段样品间菌群结构也存在着显著差异(P<0.05)。微生物多样性指数显示,后肠样品Shannon指数H'一般不低于4.25,而前、中肠样品H'均未超过4.25。对后肠样品进一步研究发现,食物改变11 d之后,后肠微生物菌群基本达到稳定。结果表明,草鱼肠道不同部位内容物菌群结构不同,后肠样品具有更高的微生物多样性,并且食物的改变会对草鱼肠道微生物菌群产生快速而显著的影响。
- 郝耀彤吴山功王桂堂邹红李文祥
- 关键词：肠道微生物菌群苏丹草PCR-DGGE
- 草鱼肠道微生物菌群结构对不同食物适应性交化的研究
- 草鱼消化道内存在大量微生物，这些微生物广泛参与消化道内物质代谢与能量代谢.本实验以454焦磷酸测序与DGGE技术为主要手段，用苏丹草对摄食人工饲料的草鱼进行食物诱导，研究了草鱼肠道微生物菌群结构的动态变化过程，分析了与草...
- 郝耀彤吴山功李欢王微微杨宝娟李文祥邹红王桂堂
- 关键词：草鱼人工饲料苏丹草DGGE技术
- 三种不同食物对草鱼后肠微生物及代谢产物的影响
- 为研究不同食物对草鱼后肠微生物及代谢产物的影响，本研究分别使用鱼粉、人工饲料和苏丹草对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)进行长期饲喂.运用高通量测序的方法对草鱼后肠微生物进行了研究，并利用气相色谱法...
- 郝耀彤吴山功王桂堂
- 关键词：草鱼肠道微生物短链脂肪酸
- 草鱼肠道黏膜厌氧细菌的分离与鉴定
- 近年来，鱼类消化道微生物受到了越来越多的关注，但大多数研究都集中于微生物的分子鉴定，迄今，我们对鱼类消化道固有厌氧微生物的分离培养工作还很欠缺。本研究以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为实验对象，...
- 丰文雯吴山功郝耀彤李文祥李明邹红王桂堂
- 关键词：草鱼肠道黏膜厌氧细菌
- 不同食物对草鱼后肠微生物及代谢产物的影响
- 为研究不同食物(鱼粉、人工饲料和苏丹草)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道微生物及代谢产物的影响,本研究使用荧光定量PCR 对草鱼后肠微生物进行了定量分析并利用气相色谱分析的方法对肠道中短链脂...
- 郝耀彤吴山功王桂堂
- 关键词：草鱼鱼粉人工饲料苏丹草短链脂肪酸
- 草鱼肠道黏膜厌氧细菌的分离与鉴定被引量：5
- 2018年
- 研究以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为实验对象,运用厌氧培养的方法,研究了饥饿状态下草鱼肠道黏膜固有微生物的类群及其在不同肠段的分布。实验结果显示草鱼前肠、中肠与后肠中细菌的数量分别是3.17×10~3、1.63×10~4和1.79×10~7 cfu/g。研究共分离到274株单菌落,经16S r RNA鉴定,分别属于拟杆菌属(Bacteroides spp.)、鲸杆菌属(Cetobacterium spp.)、梭形杆菌属(Fusobacterium spp.)、气单胞菌属(Aeromonas spp.)、希瓦氏菌属(Shewanella spp.)、芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、泛菌属(Pantoea spp.)和柠檬酸杆菌属(Citrobacter spp.)8个种类,其中专性厌氧细菌的数量占9.1%,兼性厌氧细菌的数量占90.9%。进一步分析发现,前肠中只分离到兼性厌氧细菌,中肠与后肠专性厌氧细菌和兼性厌氧细菌都有分布。专性厌氧细菌Bacteroides paurosaccharolyticus和Bacteroides luti在中肠与后肠都有分布,而Cetobacterium somerae和Fusobacterium ulcerans只在后肠有发现。兼性厌氧细菌是草鱼肠道黏膜的优势菌群,其中嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila占73.7%。草鱼肠道不同部位固有厌氧微生物组成存在差异,细菌数量也明显不同,后肠中具有更高的细菌丰度和多样性。
- 丰文雯吴山功郝耀彤郝耀彤李明李文祥王桂堂
- 关键词：草鱼肠道黏膜厌氧细菌
