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假单胞菌SJTD-1全蛋白质组学研究被引量：2: 2015年; 近年来,石油泄漏对海洋和土壤的污染事件频发,解决这一污染问题非常重要。本实验从原油污染的土壤中分离得到一株新的铜绿假单胞菌株SJTD-1,使用SDS-PAGE-1DLC-MS和offline-2DLC-MS两种方法研究其全蛋白质组。利用这两种技术平台分别鉴定获得1 453个和1 623个可信蛋白,共鉴定到1 912个可信蛋白。通过比较两种技术路线所鉴定到蛋白种类的差异,发现offline-2DLC-MS有利于SJTD-1菌株的膜蛋白、相对分子质量较大的蛋白和p I值不大于8的蛋白的鉴定。另外,对所有鉴定到的可信蛋白进行GO功能注释,亚细胞定位分析和代谢通路富集分析。通过对分离获得的SJTD-1菌株进行蛋白质组学分析,可为铜绿假单胞菌SJTD-1分解环烷烃以及SJTD-1在生物修复应用中的研究奠定基础。; 孙文兵侯敬丽; 关键词：铜绿假单胞菌蛋白质组学 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳

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孙文兵