张巧霞
- 作品数:8 被引量:5H指数:2
- 供职机构:华中农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家生猪现代产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 猪ESR1基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用
- 本发明属于猪分子标记制备技术领域,具体涉及猪ESR1基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用。本发明的分子标记克隆自ESR1基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第33碱基位发生一个等位基因突...
- 朱猛进张玲妮张巧霞刘飞郭敬颖栾宇赵书红
- 猪CD4/CD8互斥分化机制的单类细胞转录组分析
- 一直以来抗病育种都是养猪业的重要工作之一,提高猪自身免疫能力是从根源上提高猪的抗病能力。T淋巴细胞是淋巴细胞的重要组成部分,在免疫调节功能上扮演重要角色,但与其相关的研究多涉及单基因或重要的信号通路,而近年来高通量测序技...
- 张巧霞
- 关键词:抗病育种高通量测序
- 文献传递
- 猪ESR1基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用
- 本发明属于猪分子标记制备技术领域,具体涉及猪ESR1基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用。本发明的分子标记克隆自ESR1基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第33碱基位发生一个等位基因突...
- 朱猛进张玲妮张巧霞刘飞郭敬颖栾宇赵书红
- 文献传递
- 猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用
- 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及应用。本发明的分子标记克隆自CLIC4基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第116位碱基处发生一个等位...
- 朱猛进周光亮张玲妮张巧霞陶加栋赵书红
- 文献传递
- 猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及其应用
- 本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及猪CLIC4基因作为免疫性状相关的分子标记及应用。本发明的分子标记克隆自CLIC4基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第116位碱基处发生一个等位...
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- 猪血液免疫性状的复合基因组选择研究被引量:1
- 2016年
- 该研究在提出"复合基因组选择(composite genomic selection)"概念的基础上,利用华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室构建的免疫资源群体数据,通过交叉验证(cross-validation)策略,与标准GBLUP法对照,利用白细胞(WBC)、噬中性粒细胞(NE)等13项血液免疫性状对复合基因组选择的预测效果开展验证。研究结果表明,除血小板(PLT)等3个性状外,所有性状复合基因组选择的准确性均高于标准GBLUP法,分析结果支持复合基因组选择优于基于单一加性遗传组分的GBLUP的结论。同时,还探讨了不同交叉验证参数组合对复合基因组选择准确性的影响,发现最宜交叉验证倍数是性状特异性的,跟性状特性有关。总之,该研究提出了基于全部遗传组分的复合基因组选择法,并得到猪血液免疫性状数据分析结果的初步支持,特别是针对较小规模群体,复合基因组选择可能是提高基因组预测准确性的有效方法。
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- 关键词:免疫性状
- 基于GBLUP与惩罚类回归方法的猪血液性状基因组选择研究被引量:2
- 2017年
- 旨在探讨GBLUP与惩罚类回归方法用于猪血液性状基因组选择的相关问题。以本实验室收集的免疫资源猪群体13个血液性状为分析对象,结合Illumina公司猪SNP60K基因芯片分型数据,以加性模型和加性-显性模型为基础,利用GBLUP和3种惩罚类回归方法(ridge、lasso与elastic-net)开展基因组选择分析。研究发现,基因组选择的准确性与性状芯片遗传力估计值呈正相关。交叉验证分析结果表明,4种方法对13个血液性状预测准确性最高的性状均是MCV(平均红细胞体积),而加性模型和加性-显性模型的预测准确性在不同性状中的表现不同。在多数性状中,lasso和elastic-net回归的预测准确性低于ridge回归和GBLUP法,但在NE%(嗜中性细胞百分比)等少数性状中则刚好相反。综上说明,没有适用于所有性状的最佳基因组预测方法,基因组预测方法的选择应考虑目标性状的遗传特性。本研究为猪免疫性状基因组选择的实际应用提供了重要参考信息。
- 张巧霞张玲妮刘飞刘向东刘小磊赵书红朱猛进
- 关键词:血液性状