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动物毛囊发育分子调控研究进展被引量：5: 2014年; 毛囊是一个形态和结构较为复杂的皮肤附属器官。目前,有关毛囊研究的文献报道多见于人与小鼠。本文通过梳理已在人与小鼠毛囊生长发育及分子调控机理方面的相关报道,以期为家养动物毛发生长及皮肤毛发相关疾病的研究等提供借鉴。1毛囊的发育生物学研究毛囊是控制毛发周期性生长的重要结构,由上皮和真皮组成。毛囊形态发生的起始信号源于真皮。作为真皮的衍生物,毛囊的发生和维持涉及到来自不同胚层的不同种类的多个细胞,; 康晓龙李新海冯登侦; 关键词：家养动物 SMAD 毛乳头间充质细胞

绵羊皮肤不同发育时期miR-802-5p生物信息学分析: 2021年; 为了探索miR-802-5p在绵羊毛囊生长发育过程中的作用,试验采用高通量测序技术获得绵羊miR-802-5p序列,分析该序列的保守性,结合生物信息学分析方法对miRNA的靶基因进行预测,并对获得的靶基因集合进行GO及KEGG pathway富集分析。结果表明:miR-802-5p在脱毛与不脱毛两个群体中的表达量呈相反趋势,且在毛囊休止期时差异最大。miR-802-5p共靶向到994个靶基因,其中FGF5、APC、SMAD4、GSK3β等均为毛囊发育相关基因或毛囊发育相关通路Wnt中的重要影响因子。说明靶基因分别在毛囊发育等生物学过程中发挥作用,参与合成PcG蛋白复合物、线粒体膜等细胞组分,并涉及Wnt信号通路的负调控等分子功能;miR-802-5p可能是影响毛囊生长阶段的候选miRNA。; 刘罗兰张稳张天闻李新海; 关键词：毛囊发育生物信息学

杜泊羊毛囊发育lncRNA转录组以及lncRNA-MSTRG.13836.1功能的生物信息学分析被引量：1: 2023年; 为分析lncRNA-MSTRG.13836.1的功能,确定杜泊羊毛囊周期性生长发育相关的关键靶向关系对,选择8只2周岁杜泊羊母羊作为研究对象,其中5只脱毛羊为试验组,另3只不脱毛羊为对照组。在3个时间点收集它们的皮肤样本并进行RNA测序(RNA-seq),通过lncRNA差异表达分析筛选关键lncRNA,并通过顺式和反式作用预测其靶基因,对靶基因进行功能分析,构建关键lncRNA的共表达网络,分析并筛选毛囊周期性生长发育相关的关键靶向关系对。结果表明,lncRNA-MSTRG.13836.1表达量在脱毛组和不脱毛组具有显著差异,其顺式和反式靶基因与雌激素信号通路相关。构建了lncRNA-MSTRG.13836.1的共表达网络并筛选到靶向4个miRNAs及5个与毛囊周期性生长发育相关的基因,这些基因在Wnt、TGF-β、PI3K-Akt及MAPK等与毛囊周期性生长发育密切相关的信号通路中起调控作用。综上,lncRNA-MSTRG.13836.1对绵羊毛囊周期性生长发育具有调控作用,lncRNA以及靶向的4个miRNAs(miR-214-z、miR-214-y、miR-9298-x、miR-11977-z)和5个基因(PTCH2、CTNNB1、FZD3、Lpar6、Wnt10b)可作为绵羊毛囊发育相关的关键调控因子。; 孙昊然孟科李新海; 关键词：杜泊羊毛囊生物信息学分析

5个绵羊群体MTNR1A基因的多态性与产羔数的关联分析: 2021年; 为探究绵羊MTNR1A基因在5个绵羊群体之间的多态性与基因功能,本研究以杜泊羊、滩寒羊、杂一代、杂二代、横交一代5个绵羊群体为研究对象,利用飞行质谱检测技术对5个绵羊群体MTNR1A基因g.15118428T>C、g.15118664G>T、g.15119130C>T共3个错义突变位点进行检测,并利用相关生物信息学软件预测分析该基因编码蛋白的理化性质、结构和蛋白互作等。结果表明,MTNR1A基因g.15118428T>C和g.15118664G>T这2个位点在5个群体中均为低度多态(PIC<0.25),g.15119130C>T位点在5个群体中均表现为中度多态(0.25; 邵顺成闫背背张天闻梁鹏邹诗凡李新海冯登侦; 关键词：绵羊多态性产羔数生物信息

基于RNA测序技术鉴定和分析绵羊毛囊发育相关的可变剪接事件: 2023年; 可变剪接是调控动植物体内蛋白质多样性和遗传多样性的重要分子机制。为鉴定和分析杜泊羊毛囊发育过程中的可变剪接,分别于2019年9月(生长旺期,S1)、2020年1月(休止期,羊毛停止生长,S2)、2020年3月(生长初期,新羊毛生长导致旧羊毛脱落,S3)对杜泊成年母羊体侧中部皮肤组织取样,利用Illumina HiSeqTM 4000测序平台对样品进行转录组测序。利用rMATS软件鉴定样品中的可变剪接事件和差异剪接基因,在3组样品中共鉴定出128033个可变剪接事件,其中外显子跳跃的比例最高,约占75.69%,内含子保留比例最少,约占2.03%。在S1vs S2、S1vs S3和S2vs S3中共筛选到3448个显著(P<0.05)的差异剪接基因。GO(gene ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析显示,差异剪接基因显著富集在血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路、Rap1(RAS-related protein 1)信号通路、Hippo信号通路、神经营养因子信号通路等与毛囊发育密切相关的通路上,表明筛选到的差异剪接基因在杜泊羊毛囊发育过程中发挥重要作用。并进一步筛选出可能参与绵羊毛囊发育相关的关键基因(SMAD 2、FGFR 2、BMP 4、BCL 2等)。本研究通过分析杜泊羊毛囊发育过程中的AS事件,揭示绵羊毛囊发育和羊毛呈周期性循环过程中相关遗传调控机制,研究结果可以为后续开展绵羊毛囊发育与羊毛生长呈周期性变化中发育相关基因功能分析与挖掘提供理论基础。; 袁晓春王翊帆王雅艳孙昊然孟科李新海; 关键词：绵羊可变剪接毛囊发育

miR-214在绵羊毛囊周期性发育中的调控作用研究: 2022年; 为了探讨miR-214在绵羊毛囊生长发育过程中的调控作用,试验分析了来源于前期转录组测序技术获得的差异性表达的miR-214序列,并采用生物信息学方法预测靶基因,结合GO功能注释和KEGG富集分析对预测的靶基因进行研究。结果表明:miR-214在各物种中高度保守,经在线软件YM500V2预测miR-214主要在皮肤组织高表达,且miR-214在毛囊发育的生长期低表达,休止期高表达。miR-214共靶向到1045个靶基因,其中26个位于3条毛囊发育相关信号通路WNT、P53、FOXO中。PCK2、CCNB3、SKP2、RRM2、SFN和CCNE2基因的相关系数低于-0.75,且各有3个位于P53和FOXO3信号通路。上述6个靶基因随着毛囊生长阶段的发展呈现规律变化,在生长期高表达,休止期低表达,生长早期再次高表达。说明miR-214可能通过在休止期的高表达导致FOXO、P53、WNT信号通路上靶基因的低表达,以起到重要的调控作用。; 王雅艳王翊帆荣轩李新海; 关键词：MIRNA 毛囊生物信息学

5个绵羊群体ESR2基因多态性与产羔数的关联分析被引量：2: 2021年; 为探究绵羊ESR2基因多态性与产羔性状的相关性,本研究以杜泊羊、滩寒羊、杂一代、杂二代和横交一代5个绵羊群体为研究对象,利用Sequenom Mass ARRAY?SNP技术对5个绵羊群体ESR2基因3个错义突变位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析。结果显示,ESR2基因g.73323973C>T和g.73326795G>A位点在5个群体中均表现为中度多态(0.25A位点在滩寒羊群体中表现为低度多态(PIC<0.25),在杜泊羊、杂一代、杂二代和横交一代4个群体中表现为中度多态。产羔数关联分析表明,g.73323973C>T位点在滩寒羊群体中TT型产羔数极显著高于TC、CC型(P<0.01),说明g.73323973C>T位点适用于滩寒羊群体多羔性状的选育。通过生物信息学分析表明,3个位点突变前后ESR2蛋白的二级结构类型均发生了变化;蛋白互作网络分析表明ESR2蛋白与调控动物繁殖的相关蛋白质互作。本研究为开展提高绵羊繁殖力的分子标记辅助选育提供依据。; 邵顺成闫背背张天闻梁鹏邹诗凡李新海冯登侦; 关键词：绵羊多态性产羔数生物信息学分析

杜泊羊LEF1生物信息学及表达分析: 2022年; 旨在对杜泊羊LEF1基因进行生物信息学分析和编码蛋白功能特征预测,探究其对毛囊发育的调控机制,及其在毛囊不同发育时期中的表达量。从试验羊场选择2周岁体重相近的5只杜泊母羊,利用生物信息学方法比对绵羊LEF1氨基酸序列与其他物种的亲缘性,分析LEF1蛋白质的理化性质和结构特征;利用实时荧光定量PCR检测其在杜泊羊体测腹部皮肤的表达量。结果表明,杜泊羊LEF1蛋白的氨基酸序列与牛的亲缘关系最近,与小鼠的亲缘关系最远。LEF1基因编码的氨基酸331个;LEF1基因编码的蛋白质分子式C_(1636)H_(2534)N_(478)O_(481)S_(15),相对分子质量37075.95 ku,理论等电点数值9.52,亲水性平均值-0.906;编码蛋白的二、三级结构主要由无规卷曲(57.7%)和α-螺旋(28.1%)组成,同时包含1个糖基化位点。LEF1基因在杜泊羊毛囊不同发育时期均有表达,在9月和3月高表达,在1月低表达。综上,LEF1基因在杜泊羊毛囊的生长期高表达。; 王翊帆王雅艳李新海; 关键词：杜泊羊生物信息学

5个绵羊群体LHR基因多态性与产羔数的关联分析: 2021年; 实验旨在探究绵羊LHR基因rs410734874、rs401906902、rs398733991、rs4243283244个位点的多态性与5个绵羊群体产羔数之间的关系,以期为绵羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用Sequenom Mass ARRAY®SNP技术对5个绵羊群体(杜泊、滩寒羊、杂交一代、杂交二代、横交一代)共768只绵羊LHR基因的4个位点进行检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明:LHR基因rs401906902位点在杜泊、滩寒羊、杂交一代、杂交二代、横交一代5个群体中均表现为低度多态;rs398733991位点在滩寒羊群体中表现为中度多态,在杜泊、杂交一代、杂交二代、横交一代群体中表现低度多态;rs424328324、rs4107348742个位点在5个群体中均表现为中度多态。经Hardy-Weinberg平衡检验分析,rs401906902、rs398733991、rs4107348743个位点在5个群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态,表明这3个位点在5个群体中已趋于稳定;rs424328324位点除横交一代羊群体外,在其他群体处于Hardy-Weinberg平衡状态;rs410734874位点在横交一代群体中与产羔数有一定的关联性,其中TT型产羔数显著高于TA型,说明rs410734874位点适用于横交一代绵羊群体多羔性状的选育;rs401906902、rs398733991、rs4243283243个位点各基因型之间产羔数差异均不显著,不适用于绵羊多羔性状的选育。本研究将为开展提高绵羊繁殖力的标记辅助选育提供参考。; 邵顺成闫背背张天闻梁鹏邹诗凡李新海冯登侦; 关键词：绵羊多态性产羔数

miRNA调控毛囊组织生长发育的研究进展被引量：1: 2020年; miRNA是影响动物毛囊生长发育过程的重要因素之一。miRNA参与毛囊生长期、退行期和休止期的整个周期性生长过程,当miRNA的表达发生变化后,会导致毛囊相关通路(BMP、Wnt等)的相关基因表达发生变化,从而间接影响毛囊形态和生长发育。文章对近年miRNA在动物毛囊生长发育中的调控研究进展进行了总结,旨在为今后研究miRNA在动物毛囊生长发育中的调控机制提供借鉴和研究方向。; 刘罗兰张稳李新海; 关键词：毛囊发育 MIRNA 信号通路

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李新海

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