苏国茂
- 作品数:4 被引量:5H指数:1
- 供职机构:仲恺农业工程学院更多>>
- 发文基金:广东省大学生创新实验项目广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 基于COI及RAG2基因序列15种金线鱼科鱼类分子系统进化关系被引量:5
- 2017年
- 本研究基于线粒体DNACOI及核DNARAG2基因部分序列分析了印度-太平洋金线鱼科4属15种鱼类分子系统进化关系,综合2基因序列采用最大似然法构建了系统进化树。研究获得15种金线鱼科鱼类COI基因序列651bp及RAG2基因序列726bp,2基因片段均不存在插入与缺失。构建的进化树上,(1)15种金线鱼科鱼类种内不同个体间均聚为一支,形成物种内的单系,节点支持率为100%。(2)金线鱼科4个属主要分成2个分支,金线鱼属与锥齿鲷属聚为一支,眶棘鲈属与副眶棘鲈属聚为另一支,与形态分类一致。(3)对于金线鱼属物种间的聚类情况,六齿金线鱼与深水金线鱼,印度洋金线鱼与金线鱼,苏门答腊金线鱼与日本金线鱼均紧密聚成姐妹分支,红金线鱼与姬金线鱼分类地位较为原始,位于上述金线鱼大分支的基部。而该物种间聚类结果与Mohd在形态上根据尾鳍上下叶的长度性状把金线鱼分成2大组群的结果不同。对于该分歧是由于分子进化速率与表型进化速率不一致导致,还是体色斑纹、鳍条数等性状不能作为区分金线鱼属鱼类分类关系的有效指标,还需今后进一步的研究。
- 梁日深陈冬青苏国茂周萌吴灶和邹记兴
- 关键词:系统发育COI基因
- 印度-太平洋石鲈亚科鱼类DNA条形码及分子系统进化研究
- 为探讨DNA条形码基因COⅠ序列在石鲈亚科鱼类物种鉴定的有效性,本研究分析了印度-太平洋区域的石鲈亚科7个属29种鱼类91个个体长度为651bp的COⅠ基因序列,利用MEGA5.0计算石鲈亚科种内与种间的遗传距离,并基于...
- 梁日深吴丽钰苏国茂程硕周萌吴灶和
- 关键词:物种鉴定系统进化
- 罗非鱼湖病毒核蛋白的克隆表达、抗体制备及其组织分布研究
- 罗非鱼是重要养殖鱼类。近年来罗非鱼湖病毒(Tilapia Lake Virus,TiLV)在多个国家流行,造成罗非鱼大量死亡,目前尚无有效防控措施,对罗非鱼养殖业造成严重威胁。中国是罗非鱼第一养殖大国,2017年产量高达...
- 苏国茂
- 关键词:NP蛋白免疫因子
- 文献传递
- 印度-太平洋石鲈亚科鱼类DNA条形码及分子系统进化研究
- 2016年
- 为探讨DNA条形码基因COⅠ序列在石鲈亚科鱼类物种鉴定的有效性,本研究分析了印度-太平洋区域的石鲈亚科7个属29种鱼类9个个体长度为651 bp的COⅠ基因序列,利用MEGA 5.0计算石鲈亚科种内与种间的遗传距离,并基于最大简约法与最大似然法构建了其分子系统进化关系。结果显示:石鲈亚科鱼类种间遗传距离在0.021—0.240之间,平均遗传距离0.184;种内遗传距离在0.000—0.009之间,平均0.004。其中种间平均遗传距离(0.184)显著大于种内平均遗传距离(0.004),种间遗传距离是种内的46倍。同时,各物种间遗传距离均大于Hebert推荐区分物种的最小种间遗传距离0.02(2%)。基于COⅠ序列构建的系统进化树,同一物种不同个体间均能聚成独立的单系,表明COⅠ基因可作为石鲈亚科物种准确鉴定的有效条形码基因。同时,系统进化树上,石鲈属是非单系类群,主要形成5个分支,而不同分支的种类与其地理分布存在一定的相关性,与近年部分分子系统地理学的研究观点一致。
- 梁日深吴丽钰苏国茂程硕周萌吴灶和
- 关键词:DNA条形码