范聪聪
- 作品数:9 被引量:42H指数:4
- 供职机构:吉林大学更多>>
- 发文基金:吉林省科技发展计划基金更多>>
- 相关领域:医药卫生轻工技术与工程生物学更多>>
- 肠出血性大肠埃希菌O157:H7噬菌体分离鉴定及初步应用研究
- 大肠埃希菌O157:H7是一种重要的食源性致病菌,可引起严重的腹泻,出血性结肠炎和溶血性尿毒综合症。大肠埃希菌O157的污染已成为影响全球食品公共安全的重要因素。世界各地每年都会有因食用大肠埃希菌O157污染的蔬菜肉类而...
- 范聪聪
- 关键词:噬菌体生物学特性基因组学
- 文献传递
- 基于重叠延伸PCR构建幽门螺杆菌MreB重组载体
- 2016年
- [目的]基于重叠延伸PCR技术,构建串联亲和层析标签(TAP)标记的幽门螺杆菌骨架蛋白Mre B的重组质粒。[方法]将幽门螺杆菌Mre B基因终止密码子TAA前DNA序列(Mre Ba)、TAP和终止密码子TAA后的DNA序列(Mre Bb),通过重叠延伸PCR进行连接,形成大小约3.1 kb的融合片段Mre BCF;Mre BCF片段经XhoⅠ酶切、纯化后,克隆到经SmaⅠ和XhoⅠ双酶切的线性载体p K18mob Sac B上。[结果]PCR、酶切及DNA测序的结果表明,重组质粒p K18Mre BCF包含大小约为740 bp、1 400 bp和1 000 bp的三个片段(Mre Ba、TAP和Mre Bb),并且这三个片段的接头连接及核苷酸序列完全正确。[结论]利用重叠延伸PCR可对多个片段进行无缝连接,简便、高效地构建重组质粒;成功构建了重组质粒p K18Mre BCF,为将来幽门螺杆菌Mre B蛋白功能复合体的分离和鉴定奠定了基础。
- 李芳高婧马金成范聪聪付亚娟侯晓强
- 关键词:幽门螺杆菌骨架蛋白MREB重叠延伸PCR
- 长春地区幽门螺杆菌cagA基因及EPIYA基序多态性分析被引量:4
- 2017年
- 目的 研究长春地区就医人群中幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)毒力基因cagA携带率及其3′端编码CagA蛋白EPIYA基序多态性,并探讨其结构特征的差异与疾病的关系.方法PCR法扩增临床分离株Hp的cagA基因并测序,DNAMAN软件将测序后的核苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用软件MEGA6.0对测序Hp的cagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列进行多重对比分析和构建系统发育进化树.结果 收集298例胃黏膜标本,共分离60株Hp菌株.Hp检出率与性别和年龄无关(P〉0.05),消化性溃疡(PUD)组的Hp分离率高于非溃疡性消化不良(NUD)组(P〈0.05).cagA基因阳性率为90%(54/60).其中成功测序的26株中,23株为东亚型,占88.4%;3株为西方型,占11.6%.东亚型菌株中22株为EPIYA-ABD,1株为EPIYA-ABBD;西方型菌株中,2株为EPIYA-ABC,1株为EPIYA-BC.经构建进化树发现,序列聚类为东亚型群和西方型群两大类,在东亚型群中疾病分布并没有出现明显聚集,西方型群均来自PUD组.4株来自PUD组的Hp发生了氨基酸突变且均发生在EPIYA-B这个片段.结论 本地区分离的Hp cagA基因阳性率为90%,分布与胃肠疾病类型无关;EPIYA分型以毒力强的东亚型EPIYA-ABD 型为主(84.6%,22/26).EPIYA-B片段氨基酸突变与消化性溃疡密切相关;cagA 3′端DNA序列变化不大,没有明显的地区聚集性.
- 范聪聪王丽波江海洋赵亚楠武晓琳赵春燕
- 关键词:幽门螺杆菌
- 长春地区幽门螺杆菌分离株对常用抗菌药物耐药性的分析被引量:3
- 2019年
- 背景:由于临床上抗菌药物的不合理使用,幽门螺杆菌(Hp)的耐药率呈逐年上升的趋势。不同地区的Hp耐药率存在巨大差异。目的:分析长春地区Hp对七种常用抗菌药物的耐药情况,为临床上选择抗菌药物根除Hp感染提供一定的理论指导。方法:收集2014年9月—2017年10月吉林大学白求恩第一医院的298例行胃镜检查患者的黏膜标本,分离并鉴定Hp,并用琼脂稀释法对Hp进行药敏试验。结果:从298例胃黏膜标本中成功分离出69株Hp菌株,阳性率为23. 1%。69株菌株中,克拉霉素的耐药率最高(52. 2%),阿莫西林的耐药率最低(5. 8%)。17株(24. 6%)菌株对七种抗菌药物均敏感,16株(23. 2%)菌株对一种抗菌药物耐药,36株(52. 2%)菌株对两种及以上抗菌药物耐药。结论:本地区Hp对克拉霉素、硝唑类药物均有较高的耐药性,推荐阿莫西林作为根除Hp感染的药物。
- 范聪聪赵春燕江海洋铁丹丹赵亚楠王丽波
- 关键词:幽门螺杆菌抗菌药耐药性微生物敏感性试验
- 长春地区幽门螺杆菌耐药性和克拉霉素耐药基因突变位点分析被引量:14
- 2019年
- 目的探讨幽门螺杆菌对常用抗生素的耐药性及对克拉霉素耐药菌株进行耐药基因突变位点分析,为临床根除幽门螺杆菌选择敏感抗生素以及为患者提供个体化治疗提供参考。方法利用琼脂稀释法检测幽门螺杆菌对常见抗生素的耐药情况,PCR法扩增克拉霉素耐药菌株的23S rRNA基因,测序并对其基因突变位点进行分析。结果本研究成功分离出幽门螺杆菌69株,阳性率为23.1%。对7种常用抗生素的耐药性分析结果显示,幽门螺杆菌对克拉霉素耐药率最高为52.2%,对替硝唑、左氧氟沙星、盐酸四环素、呋喃唑酮和甲硝唑的耐药率依次为47.8%、37.7%、33.3%、30.4%和30.4%,对阿莫西林的耐药率最低为5.8%,可继续作为一线抗菌药物继续使用。在克拉霉素耐药菌株中发现23S rRNA基因有7个突变位点:A1821G、G1826A、T1830C、G1940A、A2143G、T2182C、A2223G。其中A2143G位点突变占54.2%,是本地区幽门螺杆菌分离株对克拉霉素耐药的主要突变位点。结论本地区分离的幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药率最高,耐药机制多以23S rRNA基因A2143G位点突变为主。
- 铁丹丹赵春燕范聪聪江海洋王丽波
- 关键词:幽门螺杆菌RRNA基因突变
- 实验性结肠炎大鼠结肠上皮claudin-1、-2、-4表达改变被引量:4
- 2017年
- 背景:溃疡性结肠炎(UC)是一种慢性非特异性肠道炎症病变,大量研究表明,UC肠黏膜损伤与紧密连接蛋白改变有关。目的:探讨实验性结肠炎大鼠结肠中claudin-1、-2、-4的表达。方法:将40只雌性Wistar大鼠随机分为正常对照组和模型组,给予大鼠7.5 mg/m L恶唑酮灌肠制备实验性结肠炎模型,以等量0.9%NaCl溶液灌肠作为正常对照。造模7 d后,行大体评分和结肠组织学评分,以ELISA法检测血清和结肠中细胞因子TNF-α、IL-4、IL-5、IL-10含量,免疫组化和蛋白质印迹法检测紧密连接蛋白claudin-1、-2、-4蛋白表达,实时PCR法检测claudin-1、-2、-4 mRNA表达。结果:与正常对照组相比,模型组结肠大体评分和组织学评分均显著升高(P<0.05);血清和结肠组织IL-4和IL-5含量均显著增高(P<0.05),而两组TNF-α和IL-10含量无明显差异(P>0.05);claudin-1、-4mRNA和蛋白表达显著降低(P<0.05),claudin-2 mRNA和蛋白表达显著增高(P<0.05)。结论:实验性结肠炎大鼠中紧密连接蛋白claudin-1、-2、-4的分布和表达发生改变,导致肠黏膜屏障功能受损,有望作为UC治疗的潜在靶点。
- 武晓琳赵春燕江海洋范聪聪王丽波
- 关键词:细胞因子类
- 肠出血性大肠埃希菌O157:H7噬菌体FEC14和FEC19特性及污染牛肉杀菌潜在应用探究被引量:2
- 2022年
- 【背景】肠出血性大肠埃希菌O157:H7是重要的食源性致病菌之一,并且其耐药性越来越严重,寻找裂解性强噬菌体用于防治大肠埃希菌感染具有广阔的应用前景。【目的】从环境中分离鉴定能特异裂解大肠埃希菌O157:H7的噬菌体,通过对生物学特性及裂解细菌功效的探究,为其在食品安全防控中提供理论依据和研究基础。【方法】通过双层平板法分离并纯化噬菌体,透射电镜观察噬菌体形态,测定最佳感染复数、一步生长曲线、pH稳定性、温度稳定性,对噬菌体进行全基因组测序及噬菌体裂解细菌功效。【结果】2株大肠埃希菌O157:H7噬菌体FEC14和FEC19的头部皆呈二十面体立体对称,FEC14头部直径约80nm,尾丝呈星形,FEC19头部直径约58 nm,尾丝呈针形;噬菌体FEC14的最佳感染复数为0.001,潜伏期为15 min,裂解期为65 min,平均暴发量为156 PFU/cell,FEC19的最佳感染复数为0.1,潜伏期为10 min,裂解期为80 min,平均暴发量为800 PFU/cell;噬菌体FEC14能在60℃、pH 4.0-11.0条件下存活,噬菌体FEC19在70℃、pH5.0-9.0条件下存活;FEC14归类于有尾目(Caudovirales)Ackermannviridae科Kuttervirus属,FEC19归类于有尾目(Caudovirales)肌尾科(Myoviridae)Wifcevirus属;单一噬菌体或混合鸡尾酒法均能降低染菌牛肉中的细菌数量,并且未发现已知毒力基因和耐药基因,能控制大肠埃希菌O157:H7的污染。【结论】2株大肠杆菌O157:H7噬菌体FEC14和FEC19特异性高、稳定性强、裂解效率高,在控制食品中大肠埃希菌O157:H7污染的应用中具有很大潜力,将来可以开发为食品防控制剂用于食品加工各个领域。
- 李兆雪兰冠达范聪聪许翠婷龚云伟崔薇赵春燕
- 关键词:噬菌体
- 幽门螺杆菌毒力基因vacA多态性与胃肠道疾病的关系被引量:4
- 2018年
- 目的研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)毒力基因vac A的分布,分析H.pylori主要毒力基因vac A的多态性与胃十二指肠疾病关系。方法将胃黏膜标本培养分离H.pylori菌株提取DNA,并运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对毒力基因vac A及其亚型进行检测分析,并对实验数据进行统计学处理,分析H.pylori的毒力基因型vac A与胃肠疾病之间是否存在相关性。结果分离H.pylori 69株,标本依据病理诊断结果分为3组:消化性溃疡组(peptic ulcer disease,PUD)29株、非溃疡性消化不良组(non-ulcer dyspepsia,NUD)29株和胃癌组(gastric cancer,GC)11株。vac A基因s1的检出率为78.3%,s2为21.7%,mixs1为14.5%。m区m1和m2检出率分别为46.4%和53.6%。i区i1和i2的检出率分别为71.0%和29.0%。vac A基因亚型组合以s1m1i1(40.6%)和s1m2i1(34.8%)为主。结论本地区分离的H.pylori vac A s1m1i1基因型引起的疾病比例较高,是胃肠疾病的优势基因型,且vac A基因亚型组合s1cm2i2在各组疾病中的差异有统计学意义。而未发现其他基因型或基因组合与胃肠道疾病的关系。
- 江海洋赵春燕范聪聪铁丹丹赵亚楠武晓琳王丽波
- 关键词:幽门螺杆菌毒力基因VACA胃十二指肠疾病
- 幽门螺杆菌毒力基因cagA、vacA和iceA与胃十二指肠疾病的关系被引量:11
- 2017年
- 目的了解长春地区就医人群中幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,H.pylori)毒力基因分布,分析本地区H.pylori主要毒力基因型与胃十二指肠疾病关系。方法将胃黏膜标本培养分离H.pylori并运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对H.pylori的三种毒力基因cagA、vacA(s1a、s1b、s1c、s2、m1a、m1b、m2、i1和i2)、iceA(iceA1和iceA2)及其亚型进行检测,分析H.pylori的毒力基因型与疾病之间的关系。结果分离H.pylori 60株,标本依据病理诊断结果分为4组:消化性溃疡组(peptic ulcer disease,PUD)25株、非溃疡性消化不良组(non-ulcer dyspepsia,NUD)9株、糜烂性胃炎组(gastritis erode,GE)15株和胃癌组(gastric cancer,GC)11株。cagA基因的阳性率为90.0%,与阴性相比在疾病中的分布差异有统计学意义(x^2=8.4440,P=0.0270)。vacA基因的s1和s2亚型的阳性率分别为86.7%和13.3%。在s1阳性菌株中,s1c等位基因检出率最高为33.3%,其次s1a检出率为23.3%,而s1b在NUD和GC中检出率为0.0%。vacA基因m区m1检出率为43.3%(m1a和m1b检出率均为21.7%)和m2检出率为56.7%。vacA基因i区等位基因i1和i2的检出率分别为78.3%和21.7%,i1明显高于i2,可能是胃肠道疾病的主要毒力因子,但与疾病的类型无明显相关性。iceA1和iceA2的阳性率分别为80.0%和16.7%,iceA1/iceA2混合型的阳性率为3.3%。三种毒力基因混合型以cagA^+/vacAs1m1i1/iceA1的菌株最多,占总数的31.7%,其次为cagA^+/vacAs1m2i1/iceA1,占总数的28.3%。结论本地区H.pylori毒力因子cagA、vacA和iceA都与胃十二肠疾病的发生密切相关,但与疾病的类型无关。H.pylori毒力基因混合型cagA+/vacAs1m1i1/iceA1和cagA^+/vacAs1m2i1/iceA1是胃十二肠疾病疾病中最主要的优势基因型,其分布也与疾病的类型无密切相关性。
- 江海洋王丽波范聪聪赵亚楠武晓琳赵春燕
- 关键词:幽门螺杆菌毒力基因胃十二指肠疾病