陈艺娟
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
- 供职机构：福建中医药大学药学院更多>>
- 发文基金：福建省科技重大专项福建省教育厅A类人文社科/科技研究项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 不同居群草珊瑚的ITS序列分析及模式识别研究被引量：3
- 2014年
- 目的通过分析不同居群草珊瑚Sarcandra glabra和金粟兰属5种近缘植物的核糖体基因内部转录间隔区（rDNA-ITS）序列,为草珊瑚鉴定和品种鉴别提供模式识别与思路。方法采集不同产地的草珊瑚18份、金粟兰6份,所有样品提取总DNA,并对其ITS片段进行扩增、测序,并搜索GenBank数据库中收录的其他4种金粟兰属植物的ITS序列,运用ClustalX 2.1软件比较不同产地草珊瑚与其他金粟兰属植物的ITS序列差异,并对其进行聚类分析。结果草珊瑚样品不同居群间的ITS序列相似度达99%,其中位点总突变率ITS1（2.7%）〉ITS2（1.4%）,而与金粟兰属其他植物相比,位点总突变率ITS2（20.3%-22.7%）〉ITS1（15.9%-18.3%）。聚类分析表明18个不同种群的草珊瑚居群间变异极小,且与金粟兰属5种近缘植物具有显著差异的聚类识别。结论草珊瑚ITS1与ITS2分别为不同居群间及与不同属近缘植物间比较有效的鉴别序列,具有较多个特异性信息位点的草珊瑚ITS序列用于鉴别金粟兰属5种近缘植物,具显著差异的聚类识别,是草珊瑚和金粟兰属近缘植物鉴定和品种鉴别的有效分子标记。
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- 关键词：草珊瑚ITS序列聚类分析
- 采用ISSR标记分析草珊瑚的DNA指纹图谱与其品质相关性被引量：5
- 2014年
- 目的分析不同质量级别的草珊瑚样品的DNA指纹图谱与其品质相关性,为进一步利用这些资源进行分子辅助育种奠定一定基础。方法采用ISSR-PCR方法对UBC801-UBC900共100个ISSR引物进行筛选,筛选出多态性好的ISSR引物23个。利用这23个ISSR引物扩增18份草珊瑚样品,以18份草珊瑚样品的ISSR扩增谱带为基础,利用Excel文件建立供试材料扩增条带指纹数据库。结果共获得198条谱带,平均每个引物扩增出8条谱带,其中多态性谱带184条,多态性条带比率为92.9%。从23个多态性好的ISSR引物中遴选出UBC811、UBC825 2个引物中7个位点为一个组合,UBC827、UBC834、UBC842共3个引物中7个位点为另一个组合,分别建立了18份受试草珊瑚样品的基因组的DNA指纹图谱,并从184条多态性谱带中筛选了出u844-6条带与样品质量有一定相关性。结论 ISSR分子标记可以有效辨别18份受试草珊瑚样品的DNA指纹图谱,并筛选获得一条与其品质有一定相关性的特征条带。
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- 关键词：草珊瑚ISSRDNA指纹图谱
- 草珊瑚与金粟兰叶片双位点特异性PCR鉴别方法研究被引量：1
- 2014年
- 筛选获得草珊瑚与金粟兰鉴别的特异位点并建立双位点特异性PCR方法,用于鉴别草珊瑚与金粟兰叶片以及两者的混杂品。采集不同产地的草珊瑚18份、金粟兰6份,所有样品提取总DNA,并对草珊瑚与金粟兰干燥叶片进行DNA提取。通过对其ITS片段进行扩增、测序,并搜索GenBank数据库中收录的草珊瑚与金粟兰的ITS序列,进行同源比对后根据其变异位点设计特异性鉴别引物,构建多重PCR体系,并优化PCR条件,对草珊瑚与金粟兰叶片进行快速分子鉴定。构建了多重PCR鉴别体系,只经一个PCR反应,能扩增出草珊瑚580 bp的特异性鉴别条带及金粟兰470 bp的特异性片段,可快速鉴别草珊瑚与金粟兰叶片,并可判断相互是否混杂。使用双位点特异性PCR技术可以有效快速鉴别草珊瑚与金粟兰叶片,并可判断相互是否混杂。
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- 关键词：草珊瑚叶片分子鉴定
- 18份草珊瑚种质的ISSR标记遗传相关性与亲本选配分析被引量：2
- 2014年
- 通过ISSR分子标记技术分析18份来源于不同产地并经质量评价的草珊瑚种质的遗传多样性及亲缘关系,并进行亲本选配优化分析,为进一步利用这些种质进行育种奠定一定基础。应用ISSR-PCR分子标记技术研究18个份来自于不同居群的草珊瑚种质的DNA指纹图谱,应用Popgen32软件计算遗传多样性和遗传距离,并以UPCMA法进行聚类分析。经筛选获得23条多态性引物,ISSR-PCR扩增共获得198条谱带,其中多态性谱带184条,Nei’s基因多样性指数（h）为0.32,Shannon多样性指数（I）为0.485 4。供试的草珊瑚种质的遗传相似系数为0.383 8~0.878 8,平均为0.661 2。遗传距离分析揭示了各受试种质相互间的遗传一致性与遗传距离,其中种质S2与种质S18之间的遗传距离最远,为0.957 5,而种质S4与种质S5之间的遗传距离最近,仅为0.129 2。而聚类分析表明种质S1,S2,S3,S7,S10等5个种质在不同程度上有别于其余受试13个种质,并优化了S2与S3,S2与S6,S2与S18等3组较佳亲本选配组合。研究表明受试种质具有较好的遗传多样性,遗传距离分析与聚类分析所揭示的18个种质之间的亲缘关系,并为优化杂交育种的亲本选配提供遗传背景方面可靠的信息。
- 魏艺聪陈莹罗林泉杨群雄陈艺娟梁一池
- 关键词：草珊瑚ISSR
