马朋飞
- 作品数:2 被引量:14H指数:2
- 供职机构:中国科学院昆明植物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金NSFC—云南联合基金国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- MIR166基因家族在陆生植物中的进化模式分析(英文)被引量:6
- 2014年
- MicroRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中的具有转录后水平调控功能的内源非编码小分子RNA。在植物中,miRNA通过对靶基因的剪切或沉默来实现对植物生命活动的调控,它是基因表达调控网络的重要组成部分。miR165/166(miR166)是陆生植物中最为古老的MIRNA家族之一,它通过对3型同源异域型-亮氨酸拉链(HD-ZIP III)等靶标的调控,在植物的众多发育时期起着关键的调控作用。本文分析了MIR166基因在陆生植物中的进化关系,并对MIR166在基部陆生植物小立碗藓(Physcomitrella patens)中的复制及进化进行了研究。此外,HD-ZIP III蛋白是植物中重要的一类转录因子,miR166对HD-ZIP III基因的调控作用在陆地植物保守的存在,本文对HD-ZIP III基因和miR166在进化中的相互作用进行了初步的探讨。
- 赵旭耀陈斯云赵磊张雪梅马朋飞郭振华
- 关键词:基因重复
- 竹亚科叶绿体DNA条形码筛选被引量:8
- 2013年
- 竹亚科是一个形态上鉴定困难且易于混淆的类群。DNA条形码技术为这一类群的鉴定提供了一个辅助手段。核心条形码(rbcL+matK)在竹亚科中的鉴别率很低,因此,有必要针对竹亚科筛选有效的DNA条形码片段。本研究根据已发表的竹亚科叶绿体基因组序列,筛选出16个片段,包括1个基因片段和15个基因间隔区,选取青篱竹族和箣竹族的10属22种30个个体,进行引物通用性、测序成功率和变异位点分析。研究结果表明:(1)引物具有较高的扩增成功率,但部分片段中由于存在poly结构造成测序失败;(2)片段中的插入/缺失可以编码,作为信息位点;(3)trnG-trnT(t)具有最多变异位点,建议可作为竹亚科优先选择的DNA条形码;(4)在开展不同类群的DNA条形码和分子系统学研究时,可以按照"trnG-trnT(t)+X"的方式选择合适的叶绿体DNA片段。
- 张玉霄许宇星马朋飞张丽娜李德铢
- 关键词:竹亚科DNA条形码分子系统学