刘莉
- 作品数:3 被引量:8H指数:2
- 供职机构:聊城市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:山东省医药卫生科技发展计划项目山东省科技发展计划项目山东省自然科学基金更多>>
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- 2010年-2013年聊城地区肠道病毒71型VP1基因特征分析及手足口病流行特点
- 2016年
- 目的研究聊城地区肠道病毒EV71的基因特征,为HFMD的预防控制提供病原学资料。方法检测标本肠道病毒EV71,用人横纹肌瘤(RD)细胞对阳性标本进行病毒分离,对分离到的EV71病毒分离株进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar 5.01和Mega 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树。结果 2010年-2013年聊城市累计报告手足口病30 947例,每年3月-7月发病较多,≤3岁患儿阳性率最高,占全部阳性患儿的90.92%。2010年-2013年聊城辖区内共送检手足口标本862份,分离到EV71阳性毒株160株,对毒株进行基因序列分析显示,2010年-2013年聊城市流行的EV71病毒株为C4a亚型群,16株EV71毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为92.8%-99.9%和97.8%-100.0%,与近缘的C4a型代表株相比,聊城优势株的氨基酸变异一般发生在VP1第98位(E→K)、145位(E→G)。结论聊城市分离株EV71是我国的优势基因型C4a,存在不同的传播链,流行的EV71相对保守,但已出现一定程度的变异。
- 杜银菊丁淑军刘莉徐可心王飞赵宪敬
- 关键词:VP1基因
- 2009年-2012年聊城市国家级流感网络实验室病原学检测结果分析被引量:4
- 2013年
- 目的对聊城市2009年-2012年流感检测结果进行分析,了解聊城市流感病毒病原学特征以及流行规律,为控制流感的发生和流行提供科学依据。方法:应用Real-timeRT-PCR技术检测疑似流感标本中的A、B、H1HA、H3HA、SWH1基因。结果:共检测流感样病例标本1221份,其中流感病毒核酸阳性率为27.6%。阳性者中,甲型H1N1、季节性H3N2、季节性H1N1及乙型的阳性率分别为13.27%、3.11%、0.082%及5.65%。结论:聊城市2009年流感流行优势毒株是甲型H1N1,2010年、2011年疫情平稳,2012年流行优势毒株是乙型,且甲型H1N1流感的发病年龄以青壮年为主,乙型则出现在小年龄组,但也存在着季节性流感病毒。
- 杜银菊刘莉徐可心赵宪敬
- 关键词:流感病毒病毒核酸检测实时荧光定量PCR
- 2010~2013年聊城地区肠道病毒A组CVA16型VP1基因特征及手足口病流行特点分析被引量:4
- 2015年
- 目的对引起聊城地区手足口病(HFMD)流行的肠道病毒CVA16进行生物学分析,掌握其基因特征,为聊城地区手足口病的防控提供病原学资料。方法对2010~2013年聊城市各辖区采集手足口病患儿标本采用Real-time PCR法检测肠道病毒CVA16,用人横纹肌瘤(RD)细胞对核酸检测阳性标本进行病毒分离,对分离到的CVA16病毒分离株采用RT-PCR方法进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar和MEGA 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树。结果 2010~2013年聊城市各辖区共送检手足口病标本862份,639份标本检测为通用肠道病毒核酸阳性,其中CVA16阳性标本181份,分离到109株毒株;对毒株进行基因序列分析显示,2010~2013年聊城市流行的CVA16病毒株为B1基因型,2010和2011年为B1a和B1b两种基因亚型共循环,2012和2013年为B1b型,不同毒株VP1区基因序列在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为91.0%~97.0%和98.3%~100%,与近源的亚型代表株相比,聊城市优势毒株的氨基酸变异一般发生在VP1第23位(L→M)。结论聊城市2010~2013年手足口病CVA16流行毒株为B1基因型,存在B1a、B1b两个基因亚型,同源性分析表明辖区部分CVA16分离株B1a亚型与我国台湾及周边国家的分离株关系较近,B1b亚型与来自国内北方分离株形成进化树上关系较近的一群。聊城市存在不同的传播链,流行的CVA16相对保守,但已出现一定程度的变异。
- 杜银菊张芙蓉刘莉徐可心赵宪敬王飞王建醒裴耀文丁淑军
- 关键词:手足口病VP1基因