吴春琳
- 作品数:1 被引量:3H指数:1
- 供职机构:上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室更多>>
- 发文基金:教育部“新世纪优秀人才支持计划”公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异被引量:3
- 2012年
- 应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及选育群体与天然群体间的遗传差异。主成分分析显示,人工选育群体与天然群体存在一定程度的遗传分化,荷包红鲤与天然群体的遗传差异最大,其主成分1(PC1)和主成分2(PC2)解释了总遗传变异的48.23%;在贝叶斯遗传聚类分析中,6个群体的最佳聚类数值为4,即兴国红鲤与2个天然群体聚为一类,玻璃红鲤、荷包红鲤和建鲤3个群体分别单独聚为一类;贝叶斯遗传重排分析显示,6个群体的遗传自排率较高,为81%~100%,玻璃红鲤和荷包红鲤的遗传自排率最高,均为100%。研究结果综合表明:4个人工选育群体与天然群体间存在较明显的遗传差异,而且天然群体已受到人工选育群体的遗传影响;这3种方法能很好地检测鲤人工选育群体间、以及选育群体与天然群体间的遗传差异。
- 许丽花李巍吴春琳董在杰王成辉
- 关键词:微卫星标记主成分分析