周艳艳
- 作品数：3 被引量：5H指数：1
- 供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金黑龙江省研究生创新科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于人类信号网络和表达谱数据研究静脉血栓复发机制
- 2015年
- 目的:静脉血栓是一种高复发风险和高致死率的疾病,其形成和复发的分子机制尚不明确。基于人类信号网络和基因表达谱数据可针对静脉血栓经华法令抗凝治疗后的复发机制进行研究。方法:结合表达谱数据和人类信号网络,设计差异模块筛选策略,通过功能分析、差异表达分析和已知血栓相关基因及药物靶基因的互作关联研究,获得与静脉血栓复发相关的显著差异模块。结果:最终获得8个与静脉血栓复发密切相关的显著差异模块,评估了华法令治疗静脉血栓的效能,提出了联合用药的3种可能途径。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与静脉血栓复发相关的模块,探究静脉血栓复发的分子机制和评估华法令的治疗效能。还提供了潜在的联合用药途径,这对治愈血栓、防治血栓复发及复发机制的研究具有重要意义。
- 张思雅周艳艳谢瑞强曲晓莉史宇晨吕亚娜贾婿冯陈晨李琬何月涵黄昊侯敏陈丽娜
- 关键词：静脉血栓华法令
- 整合冠心病风险SNPs功能及分子网络特征筛选疾病易感基因
- 2016年
- 目的:冠心病(Coronary Heart Disease,CHD)是一种由多因素(遗传因素、环境因素以及它们之间的相互作用)引起的复杂疾病。本文从遗传因素和分子互作模式识别新的冠心病易感基因。方法:结合冠心病群体遗传SNPs数据和PPI数据,通过群体遗传数据的风险评估、功能SNPs的判定和PPI网络基因的分类,以功能SNPs属性、网络拓扑属性和基因功能属性为特征,利用两步分类的方法筛选新的冠心病易感基因。结果:获得了69个新的冠心病易感基因,其中43个被文献证实与冠心病的发生发展密切相关,且识别的新的易感基因注释的KEGG通路中有很多是已知的易感基因所没有注释到的,如MAPK signaling pathway,Calcium signaling pathway,Focal adhesion和Chemokine signaling pathway等,其中Chemokine signaling pathway被证实是CHD发展的关键通路。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与冠心病相关的新的易感基因,可为冠心病的预防、诊断和治疗提供新的研究方向。
- 周艳艳朱莉娜谢瑞强姜晶陈彬彬史宇晨李琬何月涵黄昊李怡然陈丽娜
- 关键词：PPI网络易感基因
- 基于SNP互作识别类风湿性关节炎的潜在致病基因被引量：5
- 2015年
- 目的探讨单核苷酸多态性(SNP)间的上位作用对类风湿性关节炎产生的影响。方法依据人类基因,复杂疾病相关信号通路,以及人类蛋白质互作网络识别3个不同层面互作的SNP对。采用Logistic回归模型来检测互作SNP与疾病的显著相关性。结果分析疾病相关SNP对,获得34个潜在的类风湿性关节炎疾病风险基因,其中5个为类风湿性关节炎已知疾病基因,16个已有文献证实为疾病风险基因。结论通过对SNP间上位效应的研究可获得类风湿性关节炎新的潜在疾病基因。
- 李怡然周艳艳黄昊侯敏朱莉娜李琬陈丽娜
- 关键词：类风湿性关节炎单核苷酸多态性全基因组关联研究
