朱颖
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
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- 田螺科4种代表性贝类基因组调研及SSR特征分析
- 2023年
- 田螺科贝类是淡水软体动物的重要物种,在生态方面具有重要作用,并具有较高的经济价值,但目前田螺科物种参考基因组缺乏。本研究选取田螺科中华园田螺、铜锈环棱螺、多棱角螺、湄公螺等代表性贝类,基于Illumina测序数据,对4个贝类基因组大小、重复序列和杂合度等基因组特征,采用K-mer法进行预测。使用SOAPdenove软件对4种贝类进行初步组装,用MISA进行SSR分子标记鉴定和特征分析。结果表明,4种田螺科贝类基因组大小分别为1 353、896、991、1 196 Mb,杂合度分别为0.77%、1.37%、2.41%、0.91%,重复序列比例分别为26.2%、26.7%、27.8%、28.8%,基因组的GC含量分别约为33.4%、33.7%、33.1%、33.8%。说明这4个田螺科贝类杂合较高、重复序列较低。基因组初步组装结果显示,4种贝类基因组相对K-mer评估结果偏大,但GC含量及测序深度与K-mer结果较为一致。根据SSR特征分析,在田螺科4个贝类基因组序列中分别鉴定到928 562、824 342、739 299、739 407个SSR,其中,在单核苷酸至六核苷酸重复序列类型中A/T、AC/GT、AAT/ATT、AGAT/ATCT、ATAAT/ATTAT、CTAACC/GGTTAG占比最高,其中长度为10~24 bp的SSR分别占69.7%、64.9%、68.4%、70.2%。本研究为田螺科4个代表性物种基因组精细图谱构建提供了参考,同时为SSR分子标记开发和田螺科物种资源保护和利用提供了分子依据。
- 朱颖陈瑜唐俊季秋婷王俊杰唐伯平王刚
- 关键词：田螺科贝类SSR基因组大小
- 基于转录组探讨中国圆田螺在干旱胁迫下休眠特征
- 2023年
- 中国圆田螺(Cipangopaludina chinensis)属于淡水大型螺类,适应性强,分布广泛,在极端环境下能够迅速进入休眠状态,以抵御不良环境对自身造成的影响。为研究其在干旱胁迫下的休眠特征,应用高通量测序技术对中国圆田螺在干旱胁迫下肝与肾组织进行转录组测序及分析。结果显示,中国圆田螺在干旱休眠时与正常有水养殖相比,其肾组织中110个基因上调,389个基因下调;在肝组织中有84个基因上调,86个基因下调。肝组织差异基因主要与细胞黏附的调节、细胞外基质组织生长、神经元投射和轴突再生等功能相关;肾组织差异基因与碳水化合物代谢过程、去磷酸化、上皮细胞增殖调节、羟酸有机酸跨膜转移、组织重塑等功能相关;KEGG富集分析发现,差异基因主要定位在PI3K-Akt信号通路、蛋白聚糖、乳糖、鞘脂的合成代谢通路等与干旱胁迫相关的主要代谢通路上。研究表明,热激蛋白基因Hsp70、SRCR、FASN、APMAP、MSTN、Poc1b、S1P、Na^(+)-K^(+)-ATP酶β1亚基及SLC28A3基因在中国圆田螺干旱休眠时开启自身调节,田螺通过调控不同基因,启动阻隔自身对外界光线的感知,停止脂肪积累、抑制肌肉生长、吞噬自身凋亡细胞获取营养、调节细胞渗透压保水等使自身快速适应干旱休眠状态。
- 唐胜卢想朱颖董学颖唐俊刘秋宁王刚唐伯平
- 关键词：转录组休眠差异表达基因干旱胁迫
- 催眠治疗结合脑电生物反馈促进注意缺陷多动障碍儿童康复的实验研究被引量：2
- 2016年
- 目的:研究催眠治疗结合脑电生物反馈在促进儿童注意缺陷多动障碍(ADHD)儿童康复的疗效。方法:利用催眠治疗结合生物反馈系统治疗儿童注意缺陷多动障碍,治疗方法为每次25分钟,每周2次,时长6个月,并采用IVA-CPT测试作为训练疗效的评定方法。结果:催眠治疗结合脑电生物反馈治疗对康复ADHD儿童有积极的作用,能够提高反应控制力和注意力,提高机体协调能力和意志控制力,提高注意保持时间,减少反应时间,缓解其不良情绪,改善ADHD儿童的身心问题。
- 郑思齐王倩殳雯雯何鑫晨朱颖杨小晶
- 关键词：催眠治疗脑电生物反馈注意缺陷多动障碍
