李伟明 作品数:27 被引量:25 H指数:3 供职机构: 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 上海市科委国际合作基金 教育部留学回国人员科研启动基金 博士科研启动基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 金属学及工艺 更多>>
斑马鱼糖原贮积症gys1和gys2基因突变体的构建方法 本发明公开了斑马鱼糖原贮积症gys1和gys2基因突变体的构建方法,包括以下步骤:选择斑马鱼gys1基因序列的第四个外显子序列设计gys1基因敲除的靶点,gys2基因序列的第三个外显子序列设计gys2基因敲除的靶点,根据... 任建峰 黄姣 霍锦倩 刘姣 祖尧 李伟明文献传递 斑马鱼notch3基因突变体的制备方法 本发明公开了涉及一种斑马鱼notch3基因突变体的制备方法;包括如下步骤:确定notch3基因敲除的靶点位置;以pUC19‑gRNA scaffold质粒为模板,使用引物T7‑notch3‑sfd、tracr rev进行... 张庆华 岳倩文 季策 徐行 张秋月 李伟明斑马鱼报警反应产生发育阶段的研究 鱼类在遭受捕食后,受损的表皮会释放大量的化学信号物质,同种其它个体嗅到这些化学信号后会作出躲避反应,称为报警反应(alarm response)。研究表明,报警反应通常出现在一定的发育阶段。本研究中,采用斑马鱼(Dini... 曹小龙 祖尧 张庆华 贾亮 李伟明关键词:斑马鱼 发育 栖息地 文献传递 ddx27基因缺失斑马鱼突变体的制备方法 本发明公开了一种斑马鱼ddx27基因缺失突变体的制备方法;包括如下步骤:确定ddx27基因敲除的靶点在斑马鱼ddx27基因第6个外显子上,设计gRNA序列;以pUC19‑‑gRNA scaffold质粒为模板,使用引物T... 张庆华 时灿 岳倩文 祖尧 李伟明文献传递 金鱼ABC转运蛋白基因家族成员鉴定及分析 被引量:2 2020年 腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABC transporter)基因家族在原核生物和真核生物中广泛存在,该家族蛋白能够利用ATP裂解产生的能量将多种底物转运到膜上,参与多种生物过程,如营养摄入、细胞解毒、脂质稳态、信号转导、病毒防御以及抗原呈递等。目前,鱼类中,只在斑马鱼、斑点叉尾鮰和鲤鱼等少数鱼类中对该基因家族进行了系统的研究,关于金鱼ABC转运蛋白基因家族的详细分析,未见报道。本研究中,我们利用三代结合二代测序技术构建的金鱼转录组参考基因集数据,鉴定出55个ABC转运蛋白基因,通过系统进化分析将它们分为8个亚家族(A^H)。即金鱼ABC转运蛋白基因是由10个ABCA、14个ABCB、13个ABCC、5个ABCD、1个ABCE、4个ABCF、7个ABCG和1个ABCH组成。同时,我们将金鱼与斑马鱼、斑点叉尾鮰和鲤鱼等物种ABC转运蛋白基因家族成员的数目进行比较分析,推测硬骨鱼类特异的第3次全基因复制(3R-WGD)和谱系特异的第4次全基因组复制(4R-WGD)对金鱼该基因家族成员数目的影响。本研究结果为金鱼ABC转运蛋白基因功能的研究提供了理论依据。 刘含梅 崔文耀 宋诗颖 李伟明 任建峰关键词:金鱼 ABC转运蛋白 基因鉴定 进化 ddx19基因缺失斑马鱼突变体的制备方法 本发明公开了一种斑马鱼ddx19基因缺失突变体的制备方法;包括如下步骤:确定ddx19基因敲除的靶点在斑马鱼ddx19基因第1个外显子上,设计gRNA序列;以pUC19‑‑gRNA scaffold质粒为模板,使用引物T... 张庆华 时灿 岳倩文 李伟明文献传递 先天性心脏病致病基因斑马鱼直系同源基因的鉴定及表达分析 2020年 先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)较高的发病率(0.69%~0.93%)和致死率是儿童致残和致死的首要原因。虽然环境危险因素涉及,但流行病学研究证明遗传因素是CHD的主要病因。临床上,将CHD分为综合征先心病(Syndromic CHD)和单纯性先心脏(Isolated CHD)。尽管不同脊椎动物心脏腔室数目不同,但是心脏发育的过程和调控的机制具有保守性。斑马鱼胚胎体外发育且透明,内部器官清晰可见,非常适合用于心脏早期发育机制和CHD致病机理的研究。本研究总结了97个人类CHD致病基因,鉴定了其在小鼠和斑马鱼中的直系同源基因,并比较了基因在蛋白水平上的序列相似性。利用Tg(myl7:EGFP)标记斑马鱼心脏的鱼系,收集24 hpf(Hour post fertilization)、30 hpf、36 hpf和48 hpf胚胎期心脏和24 hpf身体(除心脏外的整个鱼体)作为对照,样品利用Illumina平台进行转录组基因表达分析。在93个CHD致病基因斑马鱼直系同源基因中,相对于身体,约50%的基因在心脏早期发育过程中显著上调表达。本研究对CHD疾病遗传诊断和利用斑马鱼疾病模型研究CHD发病机制研究具有重要的理论意义和实践价值。 刘姣 黄姣 朱哲 祖尧 贾亮 张庆华 李伟明 任建峰关键词:先天性心脏病 斑马鱼 基因表达 利用CRISPR/Cas9构建斑马鱼tbx20基因突变体及其功能分析 被引量:3 2019年 转录因子TBX20在脊椎动物心脏的腔室发育和维护中起至关重要的作用。利用CRISPR/Cas9系统成功制备了斑马鱼tbx20突变鱼系,T7E1检测结果显示F_0敲除效率平均为42. 1%,测序分析F_1中突变种质遗传效率为36. 7%。F_2突变体中观察到心脏突变表型:48 hpf,心包腔肿大,静脉窦瘀血,环化异常,心脏结构变形; 3 dpf,心脏畸形拉伸成线状结构。原位杂交和qRT-PCR结果显示,突变体中vmhc表达上调,amhc和myl7表达下调。成功制备了斑马鱼tbx20突变体,结果表明tbx20纯合突变体心脏畸形,环化受到影响,为深入探究tbx20在早期心脏腔室分化过程中的作用奠定了基础。 朱哲 胡沛男 李伟明 祖尧关键词:斑马鱼 心脏发育 斑马鱼notch2基因突变体的制备方法 本发明公开了涉及一种斑马鱼notch2基因突变体的制备方法;包括如下步骤:确定notch2基因敲除的靶点位置;以pUC19‑gRNA scaffold质粒为模板,使用引物T7‑notch2‑sfd、tracr rev进行... 张庆华 岳倩文 徐行 季策 李伟明文献传递 一株凡纳滨对虾源维氏气单胞菌的分离鉴定及药敏特性 被引量:9 2017年 【目的】凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)是世界范围内最主要的对虾养殖品种之一,2017年5-6月上海某凡纳滨对虾养殖场出现不明原因的死亡病例,发病急,死亡率高。从患病凡纳滨对虾体内分离到一株优势菌AVZ01,旨在确定病因并筛选出敏感药物,为今后凡纳滨对虾维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)的防治提供参考。【方法】从患病凡纳滨对虾肝胰腺和肠道中分离致病菌,通过理化特性及16S r RNA基因序列分析进行鉴定,通过人工感染试验确定病原,使用Bliss法计算出半数致死剂量(LD50),并通过纸片扩散法进行药敏试验。【结果】从患病凡纳滨对虾体内分离到一株优势菌AVZ01,进行人工回归感染试验后,对虾发病症状与自然发病症状相似,凡纳滨对虾的LD50为8.7×105 CFU/m L。根据该菌株的形态特征、理化特性、16S r RNA基因序列分析,综合判断该病原菌为维氏气单胞菌。药敏试验结果显示,该菌株对米诺环素、诺氟沙星、庆大霉素等16种抗生素高度敏感,对青霉素、苯唑西林、头孢氨苄等9种抗生素耐药。【结论】分离菌株AVZ01对凡纳滨对虾有较强的致病性,养殖过程中可选用庆大霉素及新霉素等药物进行防控。 张小明 崔文耀 丁少青 李伟明 张庆华关键词:凡纳滨对虾 维氏气单胞菌 药敏试验