许瑶
- 作品数：8 被引量：25H指数：3
- 供职机构：贵州大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划贵州省农业攻关项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 香猪ADAMTS-1基因克隆及遗传效应分析
- 2018年
- 为了研究繁殖候选基因ADAMTS-1对香猪繁殖性状的调控机理，本研究以高产、低产两个香猪群体为实验材料，克隆ADAMTS-1基因全长，分析其存在的多态性位点，并对第七外显子5996位进行产仔数的遗传效应分析，同时检测两个香猪群体中该基因的拷贝数变异。结果表明，ADAMTS-1基因包含8个内含子和9个外显子区域。该基因第七外显子5996位存在多态性，香猪品种中以B等位基因为主，基因型频率BB〉AB，未检测到纯合AA基因型的个体，而西方猪种中以AA或AB型为主。高产和低产两个香猪群体中的ADAMTS-1基因的拷贝数都是复制型为主，但存在拷贝数的差异，高产香猪群体中的拷贝数增加较多，多为3个或3个以上拷贝，而低产群体中多为双拷贝，低产群体中的拷贝数明显低于高产群体。结果提示，ADAMTS-1基因的拷贝数变异以及第7外显子5996位的多态性可能是影响香猪繁殖力的重要因素之一。
- 赵永霞许瑶喻昌燕谢健
- 关键词：香猪ADAMTS-1繁殖拷贝数
- 从江香猪FSHR和PDIA4基因候选SNP分析及其功能研究
- 促卵泡激素（Follicle-stimulating hormone，FSH）是垂体前叶分泌的一种糖蛋白，可通过卵泡刺激素受体（Follicle-stimulating hormone receptor，FSHR）调节卵...
- 许瑶
- 关键词：促卵泡激素FSHR基因SNP分析
- 香猪及柯乐猪全基因组拷贝数变异研究
- 香猪和柯乐猪都是我国珍贵的地方猪种,有着丰富的遗传资源信息,此外还有着巨大的经济和科研价值。由于环境、人工选择、饲养模式等的差异,种内或种间无论在基因还是表型上都存在较大的差异。为了了解香猪和柯乐猪种内及种间的拷贝数变异...
- 谢健喻昌燕许瑶牛熙冉雪琴王嘉福
- 关键词：香猪拷贝数变异
- 可乐猪乳头数性状全基因组关联分析被引量：8
- 2016年
- 乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后,共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个(P<2.06E-5);染色体水平显著关联位点3个,潜在关联位点18个;在关联SNP位点可能连锁的上、下游1cM区间内检索到304个基因,其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因,将为可乐猪的选育保种奠定基础。
- 谢健喻昌燕许瑶牛熙冉雪琴王嘉福
- 关键词：全基因组关联分析乳头数
- 香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数间的关联分析被引量：8
- 2017年
- 促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)是垂体前叶分泌的一种糖蛋白,可通过卵泡刺激素受体(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)调节卵巢的功能。为了研究香猪FSHR基因外显子10的多态性及其与产仔数的关系,试验以从江香猪为研究对象,采用PCR产物直接测序方法检测基因的多态性,分析基因型与香猪产仔数间的关系。对8个候选位点进行群体检测证实其中2个为SNPs位点,分别是rs322800083(C276T)和rs332115220(T601C),且新发现1个SNP位点novel 1(G-92A);rs322800083和rs332115220位点构成4种单倍型,其中C-T为香猪群体的主要单倍型(45.0%),且在香猪群体中紧密连锁(r2=0.334)。分析4种单倍型与香猪产仔数间的关系,在香猪的二胎产仔数中,单倍型C-T的总产仔数(total number born,TNB)最高,单倍型C-C的TNB最低,两者之间的TNB相差0.99头(P<0.05);在香猪的三胎产仔数中,单倍型C-T的TNB最高,与单倍型T-C、C-C间的TNB分别相差1.61和2.33头(P<0.01)。rs332115220位点的基因型与香猪的三胎产仔数呈弱的正相关关系(ρ=0.429)。本研究结果提示,单倍型C-T可以作为分子标记应用于香猪产仔数性状的辅助选育。
- 许瑶刘畅牛熙冉雪琴王嘉福
- 关键词：FSHR基因多态性香猪分子标记
- 猪蛋白质二硫化物异构酶A4基因克隆及密码子偏好性分析被引量：3
- 2019年
- 试验旨在研究猪蛋白质二硫化物异构酶(protein disulfide isomerase A4,PDIA4)基因的密码子使用特性及其与其他物种密码子使用的差异。试验以香猪子宫组织为试验材料,采用RT-PCR方法扩增获得猪PDIA4基因,参考从NCBI数据库中下载的18个不同物种PDIA4基因序列,对猪PDIA4基因的密码子使用特性及其与其他物种密码子的使用差异和进化关系进行分析,同时对猪PDIA4基因与4个模式生物密码子使用偏性进行比较。结果表明,猪PDIA4基因编码区长1 941 bp,共编码646个氨基酸。与NCBI数据库公布的野猪PDIA4基因(GenBank登录号:NM_001267834.1)的相似性达99%。猪PDIA4基因偏好使用G/C结尾的密码子,27种密码子为猪PDIA4基因的偏好密码子(RSCU>1),其中使用频率最高的前3个密码子分别为CTG(RSCU=3.69)、GCC(RSCU=2.31)和CGC(RSCU=2.29)。比较19个物种PDIA4基因发现,不同物种间PDIA4基因的有效密码子数(ENc)、密码子适应指数(CAI)、GC含量以及T、C、A、G、G+C在密码子第3位含量(T3s、C3s、A3s、G3s、GC3s)均存在差异,且密码子偏好以G/C结尾;聚类分析发现,基于CDS序列的系统进化树更符合19个物种的真实分类系统。在密码子使用频率上,猪PDIA4基因与小鼠基因组间密码子使用偏好程度更为接近,故小鼠更适合作为猪PDIA4基因的遗传转化和异源表达的受体系统。
- 张小丹牛熙许瑶许瑶李大鹏李大鹏冉雪琴王嘉福杨镜吴娟龙艳霞
- 关键词：克隆密码子偏好性
- 耐锰细菌鉴定与锰胁迫下的生理响应被引量：5
- 2017年
- 为了探究细菌对锰的适应机制,从松桃的锰冶炼区寨英镇采集的土样中分离得到7株耐锰能力达到1 800mg/L的细菌,其中S7和S16两株菌对锰的耐受能力高达2 200 mg/L。形态学、生理生化和16S rDNA基因测序等分析结果表明,这些菌分属于根癌土壤杆菌、沙福芽孢杆菌、根瘤菌属和氧化节杆菌。在锰胁迫条件下,测定菌株S7的生长曲线、超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)、过氧化氢酶(Catalase,CAT)活性和电导率。结果表明:在无锰条件下,细菌的生长速度很快,14~18小时后就进入稳定期,在锰胁迫条件下,菌株的生长速度明显减慢,S7菌株的SOD、CAT酶活性在10~18小时时升高,但电导率变化不大。推测耐锰细菌可能通过上调氧化还原酶的活性适应锰胁迫。这对揭示细菌耐受锰的生理机制和锰污染的微生物修复技术奠定理论基础。
- 田群许瑶喻昌燕王嘉福冉雪琴
- 关键词：超氧化物歧化酶过氧化氢酶
