魏凯
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 供职机构：石河子大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 高通量测序时代下持家基因定义的发展被引量：2
- 2017年
- 持家基因一般指在所有细胞中均稳定表达的一类组成型基因,其产物是维持细胞基本生命活动所必需的。持家基因的定义及其发展,反映了其本质和时代特征。本文从基因表达水平量化技术的角度,结合作者利用转录组数据对猪持家基因的分析,讨论了持家基因的定义及其发展,尤其是技术的进步及数据量的剧增对持家基因的定义所引发的问题。本文总结发现,应该在研究技术的进步中,动态地认识持家基因定义所具有的层次性,从而对持家基因的定义不断赋予新的时代特征。
- 魏凯马磊
- 关键词：转录组测序基因表达
- 猪基因共表达网络模块的构建及功能分析被引量：2
- 2017年
- 旨在构建猪(Sus scrofa)的基因共表达网络模块,挖掘功能基因。基于权重基因共表达网络分析技术(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),利用猪的多组织转录组测序数据,构建了24个猪的基因共表达模块,并对模块进行生物学过程、KEGG通路、疾病和组织特异性分析。结果显示,模块具有功能特异性,与器官的发育阶段、代谢通路有关,且同一模块中的信号通路间呈现调控关系;模块可富集与代谢、神经系统、癌症相关的疾病基因;模块可定位于特定组织。分析发现,钙调通路、PI3K-Akt通路、MAPK通路、泛素介导通路等在模块中呈现关键作用,催产素通路、昼夜节律通路内的相关基因对繁殖调控具有重要作用,SIX1、PRKAG3等基因的局部网络涉及肌肉发育。综上表明,在基因组水平上,构建和分析基因表达调控网络,可为探究中国地方猪品种特有的基因资源信息、丰富分子育种理论,提供新思路和新途径。
- 魏凯张婷婷马磊
- 关键词：组织特异性
