龙晓飞
- 作品数:11 被引量:12H指数:2
- 供职机构:南京林业大学更多>>
- 发文基金:江苏省“青蓝工程”基金江苏高校优势学科建设工程资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法
- 本发明公开了一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法,以北美鹅掌楸‘NK’和鹅掌楸‘LS’杂交获得的F1代个体为材料,以测序得到的鹅掌楸参考基因组为基础,运用Primer5.0软件设计PCR扩增引物并检验引物的扩增效率和特...
- 施季森陆叶陈金慧龙晓飞杨立明肖保荣刘阳陈新颖张稼霁
- 文献传递
- 一种利用双向电泳体系获取北美鹅掌楸花蜜蛋白质二维电泳图谱的方法
- 本发明公开了一种利用双向电泳体系获取北美鹅掌楸花蜜蛋白质电泳图谱的方法,将花蜜样品采用超微滤膜过滤后,并利用蛋白质超滤浓缩纯化柱浓缩纯化花蜜蛋白质,然后利用Bradford法检测纯化浓缩后花蜜蛋白浓度,然后一维十二烷基硫...
- 陈金慧周艳威施季森杨立明查红光郑晨龙晓飞盛宇
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- 杂交鹅掌楸LhWOX1基因的用途
- 本发明公开了杂交鹅掌楸<I>LhWOX1</I>基因的用途,属于植物基因工程技术领域。本发明提供的杂交鹅掌楸<I>LhWOX1</I>基因的用途具体应用步骤包括:构建杂交鹅掌楸<I>LhWOX1</I>基因的载体;将所构...
- 陈金慧李美平龙晓飞施季森胡向阳郝兆东张稼霁成铁龙
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- 鹅掌楸Genomic-SSR反应体系优化被引量:5
- 2013年
- 鹅掌楸属(Liriodendron L),是木兰科(Magnoliaceae)植物,属古老属种之一。由于第三纪晚期气候剧变和更新世冰川作用,到目前为止仅剩中国马褂木(L.chinense(Hemsl.)Sarg.)和北美鹅掌楸(L.tulipifera L.)两个残遗种[1]。鹅掌楸属植物在植物系统学中有特殊地位,以及具有原始的花结构等,这使得它们成为研究植物进化、开花植物历史进程、群体结构以及交配系统等的理想材料[2-4]。此外,鹅掌楸植物具有重要的经济价值和生态价值[5]。除为生产提供优质木材外,还具较强抗性[6-7],内含丰富的医用化合物[8-9]以及生物质燃料的生[10-12]
- 贾波徐海滨徐阳龙晓飞陈金慧施季森
- 关键词:GENOMIC-SSR鹅掌楸正交试验
- 一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法
- 本发明公开了一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法,以北美鹅掌楸‘NK’和鹅掌楸‘LS’杂交获得的F1代个体为材料,以测序得到的鹅掌楸参考基因组为基础,运用Primer5.0软件设计PCR扩增引物并检验引物的扩增效率和特...
- 施季森陆叶陈金慧龙晓飞杨立明肖保荣刘阳陈新颖张稼霁
- 一种鹅掌楸林分后代树种类型的鉴定方法
- 本发明公开了一种鹅掌楸林分后代树种类型的鉴定方法及其专用试剂盒,该方法包括:1)提取后代树种的叶片DNA;2)进行SSR‑PCR检测;3)后代树种判定,电泳能特异性扩增出112bp的产物为中国鹅掌楸,能特异性扩增出124...
- 陈金慧龙晓飞肖保荣章文鑫王宇浩王鹏凯施季森胡凌峰杨立明
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- 一种杂交鹅掌楸亲缘关系的鉴定方法
- 本发明公开了一种杂交鹅掌楸亲缘关系的鉴定方法及其专用试剂盒,该方法包括:1)提取杂交鹅掌楸叶片DNA;2)进行PCR检测;3)用引物18.2能特异性扩增出400bp的产物的母本为中国鹅掌楸,能特异性扩增出382bp的产物...
- 陈金慧龙晓飞施季森成铁龙肖保荣刘思芹翁禹豪胡凌峰刘阳
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- 基于RAD-seq技术的鹅掌楸基因组SNP标记开发被引量:7
- 2019年
- 【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶EcoR I对包括2个亲本和198个子代在内的200个单株的基因组DNA进行酶切,构建RAD(restriction-site associated DNA)文库并进行RAD-seq测序。采用读长为91 bp的双末端测序。2个亲本的平均测序深度为2×,198个子代的平均测序深度为0.8×,平均产量为1.94 Gb,共获得约387.21 Gb数据。用Stacks软件将每个样品的RAD-reads作生物信息学分析,对候选位点进行卡方检验和缺失率检验,再将符合孟德尔遗传的标记及与之相对应的RAD-tag序列和鹅掌楸参考基因组序列进行比对。最后,从本研究开发的SNP标记中选取27个候选SNP位点,设计引物,对随机挑选的16个F1代进行PCR扩增并将结果进行测序,同时验证SNP的有效性。【结果】从候选群体中共鉴定到22 019个SNP位点,符合孟德尔遗传规律的标记为4 233个,最终获得3 501个候选SNP标记。SNP验证中,共有293个SNP标记完成测序并能判读结果,所有位点都为SNP位点,共有194(66.2%)个SNP变异类型得到了验证。【结论】基于RAD-seq技术和鹅掌楸参考基因组序列为基础的策略,能够作为一种快速有效的手段,实现大规模的分子标记开发,可用于鹅掌楸等林木的高密度遗传图谱的构建。
- 陆叶龙晓飞王鹏凯陈金慧施季森
- 关键词:北美鹅掌楸鹅掌楸遗传连锁图谱
- 杂交鹅掌楸LhWOX1基因的新用途
- 本发明公开了杂交鹅掌楸LhWOX1基因的新用途,属于植物基因工程技术领域。本发明提供的杂交鹅掌楸LhWOX1基因的新用途具体应用步骤包括:构建杂交鹅掌楸LhWOX1基因的载体;将所构建的杂交鹅掌楸LhWOX1基因的载体转...
- 陈金慧李美平龙晓飞施季森胡向阳郝兆东张稼霁成铁龙
- 文献传递
- 一种鹅掌楸林分后代树种类型的鉴定方法
- 本发明公开了一种鹅掌楸林分后代树种类型的鉴定方法及其专用试剂盒,该方法包括:1)提取后代树种的叶片DNA;2)进行SSR‑PCR检测;3)后代树种判定,电泳能特异性扩增出112bp的产物为中国鹅掌楸,能特异性扩增出124...
- 陈金慧龙晓飞肖保荣章文鑫王宇浩王鹏凯施季森胡凌峰杨立明
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