姚志强
- 作品数:4 被引量:1H指数:1
- 供职机构:华东理工大学生物工程学院生物反应器工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家重点实验室开放基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学生物学医药卫生化学工程更多>>
- 通过分析来自Pyrococcus abyssi的腈水解酶中带电基团位置变化探讨蛋白耐热机制被引量:1
- 2012年
- 蛋白含带电侧链基团的氨基酸的位置对蛋白质的热稳定性有很大的影响,目前,往往采用蛋白质结构模型"静态"分析这一影响。本文以1株耐热的腈水解酶作为研究对象,构建并异源表达了该酶,对其酶学性质进行初步分析。利用Discovery Studio对该酶进行同源建模,得到空间结构。将此空间结构利用Gromacs软件在不同温度下进行分子动力学(MD)模拟,使用Macrodox软件计算蛋白质所有带电氨基酸残基的包埋率与溶剂可接触性面积(SA),发现在不同温度下,部分氨基酸带电基团的SA值会发生显著变化。说明通过静态分析并不一定能够得到非常准确的结果,而应进行动态分析。
- 汤晓芒张鲁嘉崔东冰姚志强王学东魏东芝
- 关键词:同源建模分子动力学腈水解酶热稳定性
- 计算机辅助的酶的底物分子从头设计
- 酶学研究是生命科学研究领域的核心问题之一,对于酶的催化机制的解析是理解生命活动的基础,也是生物技术的产业化应用的根基。经过了不断的进步,现代生物技术手段已经能够实现酶结构功能的定向调控,设计和改造等,然而,在每次尝试的过...
- 姚志强
- 关键词:分子模拟分子设计脂肪酶腈水解酶醛酮还原酶
- 酶的底物谱预测新技术—计算机虚拟筛选与虚拟生长系统的研究
- <正>酶作为功能性生物大分子,在各个领域的作用正日益突出。而其最有价值、最重要的一个特性就是底物选择性。目前,不论是合成新的生物系统,还是寻找可以工业应用的酶制剂,最大的工作量就是研究酶的底物特异性:发现酶的最适
- 张鲁嘉姚志强魏东芝
- 关键词:分子模拟分子设计腈水解酶醛酮还原酶
- 文献传递
- 酶的底物谱预测新技术-计算机虚拟筛选与虚拟生长系统的研究
- 酶作为功能性生物大分子,在各个领域的作用正日益突出。而其最有价值、最重要的一个特性就是底物选择性。目前,不论是合成新的生物系统,还是寻找可以工业应用的酶制剂,最大的工作量就是研究酶的底物特异性:发现酶的最适底物或寻找最适...
- 张鲁嘉姚志强魏东芝
- 关键词:分子模拟分子设计腈水解酶醛酮还原酶