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一种基于LAMP技术的堪萨斯分枝杆菌可视化检测方法: 本发明通过设计LAMP反应体系的引物混合液并在LAMP反应之后利用横流生物传感条进行检测，获得了一种堪萨斯分枝杆菌可视化检测方法。本发明设计的引物混合液的引物序列为：F3：GGCAATGTCGATGACAACAG；B3：...; 张书; 文献传递

2016—2020年凉山州结核分枝杆菌耐药状况分析: 2023年; 目的分析凉山州结核分枝杆菌的耐药特征,为凉山州结核病防控提供科学依据。方法收集2016—2020年凉山州453株结核分枝杆菌,采用比例法对异烟肼(INH)、链霉素(SM)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、卡那霉素(KM)、氧氟沙星(OFLX)6种常用抗结核药进行药物敏感性试验,并结合患者性别、年龄和艾滋病感染情况进行统计分析,耐药率的比较采用χ2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果453株结核分枝杆菌总耐药率为32.23%,耐多药率为9.71%,准广泛耐药率为2.87%,耐INH、SM、RFP、EMB、KM和OFLX的耐药率分别为16.34%、10.60%、13.47%、6.18%、7.95%和7.28%,由高到低为INH>RFP>SM>KM>OFLX>EMB,耐INH率最高。从人群特征来看,男性患者数多于女性患者数,男性患者占69.53%,女性患者占30.47%,两类患者总耐药率和耐多药率差异均无统计学差异(P均>0.05);41~60岁年龄组的总耐药率和耐多药率高于其他年龄组;艾滋病感染者的总耐药率高于非感染者,差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论凉山州结核病耐药率远高于全省水平,可能与凉山州地区医疗水平较低和患者未规范化治疗管理有关,应继续加强该地区结核病的耐药筛查,及早发现耐药结核,加强患者的规范化治疗、管理,减少患者耐药形成和减少耐药结核的传播。; 陈晓茹肖琳毛木呷苏婷底莫阿鎏王石金王若冰冯晓英祁腾张书; 关键词：结核病结核分枝杆菌耐药

四川省鼠疫自然疫源地兽类多样性: 2023年; 目的明确四川省鼠疫自然疫源地兽类种类,为做好四川省鼠疫自然疫源地人兽共患病研究提供科学依据。方法收集1997年至2021年四川省鼠疫自然疫源地监测工作中鉴定的兽类资料,结合历史文献,按照《中国哺乳动物物种和亚种分类名录与分布大全》分类系统进行修订、整理、归类疫源地内兽类名录,并将兽类按照区系、分布型、保护级别、特有种、《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES附录)2019年版(CITES-2019)、《中国脊椎动物红色名录》予以报道。结果确认四川省鼠疫自然疫源地有兽类8目19科19亚科77种。其中东洋界有26种,古北界有46种,广布种有5种。国家级保护动物30种,其中国家Ⅰ级保护动物9种,国家Ⅱ级保护动物21种。我国特有或主要分布于我国的特有兽类34种,其中主要分布于我国有15种,中国特有19种。CITES-2019附录Ⅰ的有9种,附录Ⅱ有7种,附录Ⅲ有6种。《中国脊椎动物红色名录》中急危6种,濒危9种,易危9种,近危17种,无危34种。结论四川省鼠疫自然疫源地内兽类资源丰富、多样性高,携带潜在人兽共患疾病较多,掌握疫源地兽类种类、数量、动物行为及分布特征对今后四川省鼠疫自然疫源地人兽共患病的调查及传播动力学研究,有非常重要的意义。; 祁腾杨创明李文博廖虹瑜曾林子赵雯霞李帆张书; 关键词：鼠疫疫源地兽类多样性

2018年四川省4865例涂阳结核患者耐药分析被引量：9: 2020年; 目的了解2018年四川省结核分枝杆菌耐药状况,为评价、完善四川省结核病防治规划提供基础科学依据。方法对四川省各地区2018-01/12期间纳入监测的涂阳痰标本进行分离培养,并采用比例法对分离培养得到的分枝杆菌进行鉴定,对结核分枝杆菌进行RFP、INH、EMB、SM、KM和OFX的药物敏感性试验。耐药率的比较采用χ2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果4967例纳入分析的患者中,非结核分枝杆菌NTM占总体患者的2.05%(102/4967)。最终纳入耐药分析的例数为4865例,其中初治患者4244例,复治患者621例。总耐药率为18.62%(906/4865),初治15.95%(677/4244),复治36.88%(229/621);单耐药率为9.09%(442/4865),多耐药率为3.10%(151/4865),耐多药率为6.43%(313/4865),广泛耐药率为0.47%(23/4865)。耐药谱有44种类型,其中单耐药6种,多耐药23种,耐多药15种(含广泛耐药3种)。6种检测药物耐药率顺位从高到低依次为INH>RFP>SM>OFX>EMB>KM。结论四川省结核病尤其是耐药结核病的防控有了一定的成效,但仍然面临较大的挑战,面对复治患者的耐药挑战,耐药谱呈现多态性和复杂性,应采取强有力的干预措施,遏制耐药结核病的流行。; 高媛张书龙波杨筠王为娜高文凤陈闯; 关键词：结核耐药率

2016-2017年四川省10个耐药监测点结核病耐药情况分析被引量：13: 2019年; 目的了解四川省耐药结核病的流行状况,为四川省耐药结核病的防控提供科学依据。方法选取苍溪县、大竹县、峨眉山市、涪城区、富顺县、合江县、江油市、绵竹市、通江县及武胜县10个区县为耐药监测点,纳入2016-2017年所有登记的涂阳肺结核患者,采集痰标本,进行痰培养,对培养所得菌株进行抗结核药物敏感性实验。所检测药物及浓度为异烟肼(INH)0.2μg/ml、利福平(RFP)40μg/ml、乙胺丁醇(EMB)2μg/ml、链霉素(SM)4μg/ml、卡那霉素(KA)30μg/ml和氧氟沙星(OF)4μg/ml。构成比的比较采用χ^2检验。结果 909例结核分枝杆菌中总耐药率为23.98%(218/909)、单耐药率为10.78%(98/909)、多耐药率为5.06%(46/909)、耐多药(MDR-TB)率为8.14%(74/909)、总广泛耐药(XDR-TB)率为0.55%(5/909),其中MDR-TB中初治和复治患者分别为42和32例。耐药谱中,任一种耐药谱、单一耐药谱、多耐药谱和耐多药谱的前3位分别为IHN、SM和RFP, INH、SM和OF,耐HS、耐HE和耐HSE,耐HRS、耐HRSOF和耐HR/HRSEOF。结论四川省的结核病耐药疫情仍十分严重,出现了耐药结核病传播加重和氟喹诺酮使用不规范的情况,应调整耐药结核病防控方向,继续做好耐药监测研究,为耐药结核病的防控提供科学的依据。; 高文凤杨筠王为娜张书张玲琳陈闯饶正远王丹霞龙波; 关键词：结核病耐药

2020年南充市一中学结核病疫情临床分离菌株情况分析: 2023年; 目的通过对一中学校结核病疫情中得到的临床分离菌株进行全基因组测序和分析,确定其耐药、分型特征及传播特点,探讨全基因组测序技术在学校结核病疫情处置中的应用价值。方法对2020年南充市一中学结核病疫情中得到的17株菌株进行全基因组测序,并使用结核分枝杆菌全基因组数据库分析平台SAM-TB对其菌型、耐药、分型特征进行分析,并结合患者信息分析其传播特点。结果该学校结核病疫情得到的17株临床菌株,13株为结核分枝杆菌(Mycobacterium Tuberculosis,MTB),2株为脓肿分枝杆菌(Mycobacteroides abscessus),2株为支气管戈登氏菌(Gordonia bronchialis),13株MTB中12株属于L2.2.1,1株属于L4.5。L2.2.1谱系的12株菌株中10株为同一株菌,且来自于发生聚集性疫情的班级,由此确定该次疫情由此株菌传播引起。结论该次学校结核病疫情是由谱系为L2.2.1的结核分枝杆菌引起的聚集性传播事件,全基因组测序技术在学校结核病疫情处置中具有确定传播链的重要作用。; 张书陈闯逯嘉肖月卿敏甘赟婧陈真罗湘周扬; 关键词：结核病结核分枝杆菌全基因组测序进化树

2020年凉山州彝族地区结核分枝杆菌全基因组序列情况分析: 2023年; 目的分析凉山州彝族地区获得的30株结核分枝杆菌全基因组序列情况,为凉山州结核病防控工作开展提供科学参考。方法将凉山州彝族地区昭觉县、越西县、美姑县3县2020年的30株结核分枝杆菌进行全基因组测序,使用结核分枝杆菌全基因组序列分析平台分析其菌型、耐药情况、分型特征等,并使用MEGAX完成菌株的进化树构建。结果30株结核分枝杆菌,18株属于Lineage2(东亚系),12株属于Lineage4(欧美系);25株未检测到已知耐药突变,为敏感菌株,5株检测到已知耐药突变,主要为利福平耐药。30菌株的进化树形成2个大簇,分属于L2和L4,L2谱系中有3株菌株全基因组序列具有一致性,L4谱系菌株中有2株菌株的全基因组序列具有一致性,此5例菌株都来自于学生人群。结论该地区流行的结核分枝杆菌为L2和L4谱系菌株,以L2为主,L4为辅,且近期存在学校结核病聚集性事件,该地应加强学校结核病防控工作,控制结核病近期传播。; 张书逯嘉王为娜陈晓茹王石金王若冰冯晓英陈闯; 关键词：结核分枝杆菌全基因组测序进化树

一种基于LAMP技术的堪萨斯分枝杆菌可视化检测方法: 本发明通过设计LAMP反应体系的引物混合液并在LAMP反应之后利用横流生物传感条进行检测，获得了一种堪萨斯分枝杆菌可视化检测方法。本发明设计的引物混合液的引物序列为：F3：GGCAATGTCGATGACAACAG；B3：...; 张书

基于全基因组测序的四川省22例复发肺结核患者感染模式及耐药情况分析: 2024年; 目的:分析复发肺结核患者感染模式和耐药信息,为结核病患者治疗及防控提供科学依据。方法:采用前瞻性研究方法,参照入组标准从四川省峨眉山市、绵阳市涪城区和江油市3个耐药监测点收集2012—2021年肺结核患者分枝杆菌培养阳性菌株2207株,剔除286株重复菌株后与中国疾病预防控制中心结核病信息管理系统进行比对,排除18例发病间隔<12个月的患者后,对34例有2次及以上就诊情况患者菌株进行复苏、DNA提取、全基因组测序,分析复发患者结核感染模式和耐药情况。结果:排除11例某一配对菌株传代培养失败及1例全基因组测序结果为非结核分枝杆菌的患者后,最终纳入22例复发肺结核患者进行分析。其中,14例(63.6%)患者为内源性复燃,本地患者、发病间隔、初始感染菌株为Lineage 2谱系、耐药、耐多药、异烟肼耐药患者分别为13例(92.9%)、18.00(13.50,24.50)个月、10例(71.4%)、6例(42.9%)、2例(14.3%)、5例(35.7%),2例获得性耐药,1例乙硫异烟胺耐药性消失;8例(36.4%)患者为外源性再感染,其相应数据分别为4例(4/8)、14.50(13.25,16.75)个月、4例(4/8)、5例(5/8)、3例(3/8)、5例(5/8),且两次感染耐药类型均不同。结论:四川省作为结核病高负担地区,复发仍以内源性复燃为主,但耐药严重的外源性再感染也应引起重视,应积极关注这类患者的治疗情况,制定个体化用药方案,减少结核病复发。; 雷卉张书李婷高媛刘双陈闯夏岚王为娜高文凤何金戈; 关键词：复发全基因组测序流行病学研究

基于web of science的牛结核病研究态势分析: 2016年; 基于ISI Web of Science数据库，利用其提供的统计分析功能，用文献计量学方法，分别从牛结核病研究的年代、国家/地区、文献类型、研究方向、发文机构、作者、来源出版物等方面对检索出的1986-2015年30年间的牛结核病方面的文献进行统计分析。结果表明，1986-2015年间共有相关文献3308篇，文献类型以期刊论文为主，论文产出量呈逐年上升趋势，其中，美国、英国、新西兰发文量最高，中国仅居18位。牛结核病研究方向主要集中在兽医学、免疫学、微生物学、传染病学、生态环境科学和农学等领域。这对中国对牛结核病的研究有一定参考作用。; 张书逯嘉饶正远龙波杨筠何金戈张佩如; 关键词：牛结核病文献计量学 H-指数

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