朱亚玲
- 作品数:12 被引量:34H指数:3
- 供职机构:华侨大学更多>>
- 发文基金:福建省科技计划重点项目福建省自然科学基金福建省科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 肝细胞癌相关差异基因的生物信息学及预后分析被引量:1
- 2019年
- 肝细胞癌是全球癌症相关死亡的主要原因,目前对肝细胞癌的发病机制研究尚不完善,探索肝细胞癌发生、发展相关的分子标志物及其预后具有重要意义。从GEO数据库获得肝细胞癌组织和非癌组织的基因表达阵列数据GSE84402,利用GEO2R筛选差异表达基因;采用DAVID数据库对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建差异表达基因对应的蛋白质相互作用网络,并从网络中筛选出核心基因(hub genes);结合KM plotter数据库的临床信息对hub genes进行预后分析。结果显示:共得到1 307个差异表达基因,其中上调基因741个,下调基因566个,这些差异表达基因主要涉及细胞分裂、细胞周期、DNA复制及物质代谢等生物学过程及生物通路。通过GO、KEGG及蛋白质相互作用网络筛选出BUB1、BUB1B、CCNA2、CCNB1、CCNB2、CDC20、CDK1、MAD2L1、PLK1等9个hub genes,进一步分析发现hub genes均与细胞周期的调控相关,表明细胞周期的调控失常在肝细胞癌的发生、发展过程中具有重要作用。生存分析显示9个hub genes在肝细胞癌患者中均为表达上调的基因,且与患者预后不良相关,这为寻找肝细胞癌患者预后相关生物标志物的研究提供了线索。
- 朱亚玲赵洪波蒋保三王刚张越美刁勇
- 关键词:生物信息学预后
- 基于网络药理学探讨西黄丸治疗肝癌的作用机制
- 2024年
- 目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨西黄丸治疗肝癌的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库及SwissTargetPrediction数据库获取西黄丸的活性成分及靶点;从GeneCards、NCBI、DisGeNET及CTD数据库收集肝癌相关靶点,并与活性成分靶点取交集;采用STRING平台和Cytoscape软件构建靶点相互作用网络,并借助DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;利用CB-Dock分子对接工具将活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 共筛选出205个活性成分和324个与肝癌治疗相关的潜在靶点,其中包括AR、CYP19A1、ESR1等61个关键靶点;GO和KEGG富集分析发现关键靶点参与凋亡过程的负调控、蛋白质磷酸化、细胞增殖的正调控等生物过程,调控HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路等114条信号通路。分子对接结果显示没药甾醇I、洋椿苦素、白藜芦醇等活性成分与关键靶点之间均有较强的结合力。结论 西黄丸通过多成分、多靶点、多通路调控肝癌细胞的增殖、侵袭、迁移与凋亡,从而抑制肝癌的发生和发展。
- 吴铠悦张丽允冯文敏黄月萍刘亚茹朱亚玲
- 关键词:西黄丸肝癌网络药理学分子对接
- 鳄鱼甲提取物诱导肝星状细胞凋亡的研究
- 目的:肝纤维化(Hepatic fibrosis,HF)是指各种致病因子所致肝内结缔组织异常增生,导致肝内弥漫性细胞外基质(Extracellular Matrix, ECM)过度沉淀的病理过程,是慢性肝病发展到肝硬化甚...
- 朱亚玲冷小鹏许瑞安
- 关键词:肝星状细胞凋亡肝纤维化
- 血府逐瘀汤治疗冠心病的网络药理学研究被引量:7
- 2022年
- 目的利用网络药理学探讨血府逐瘀汤治疗冠心病的潜在作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选血府逐瘀汤活性成分,SwissTargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点,DigSee和DisGeNET等数据库中获取冠心病相关靶点,STRING数据库及Cytoscape软件构建靶点相互作用网络,DAVID数据库进行富集分析,Cytoscape软件构建“成分-靶点-KEGG信号通路”网络,CB-Dock分子对接工具进行分子对接验证。结果血府逐瘀汤中共筛选出152个活性成分和153个与冠心病治疗相关潜在靶点。靶点富集到249个生物过程,32个细胞组成,46个分子功能及55条信号通路。结论血府逐瘀汤可能通过调控缺氧反应、抑制炎症反应、促进血管生成及调节代谢等途径,发挥治疗冠心病的作用。
- 杨紫薇高佳慧陈建美黄雨馨黄月萍刁勇朱亚玲
- 关键词:血府逐瘀汤冠心病网络药理学活性成分
- 华侨大学泉州校区药用植物资源调查分析被引量:7
- 2014年
- 对华侨大学泉州校区药用植物进行系统的调查研究,根据校园自然分区,编制华侨大学泉州校区校园内药用植物名录和图册,并从药用植物的多样性、生长习性、生态稳定性和功能性等方面进行分析与评价.研究结果表明:华侨大学泉州校区校园内共有药用植物315种,隶属101科,其中被《中国药典》收载的有85种.
- 徐先祥倪云霞付艺冰朱秦郑文杰李琼黄应钦秦思朱亚玲张小鸿
- 关键词:药用植物资源调查
- 基于网络药理学和生物信息学探究西黄丸治疗肝癌作用机制被引量:3
- 2023年
- 目的 通过网络药理学和生物信息学方法探究西黄丸治疗肝癌的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库和SwissADME数据库筛选西黄丸活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测活性成分对应靶点,GEPIA数据库分析靶点基因在肝癌组织与正常组织的表达差异,通过DAVID数据库对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,借助STRING和Cytoscape3.9.0软件构建靶点蛋白相互作用网络,并筛选核心靶点;采用Kaplan-Meier Plotter数据库分析核心基因与肝癌患者预后的相关性,运用CB-Dock工具进行分子对接验证。结果 共筛选得到194个活性成分,147个差异表达靶点基因(上调靶点基因89个、下调靶点基因58个)。GO功能分析得到生物过程19个、细胞组分13个、分子功能16个。KEGG通路富集得到9条信号通路,主要涉及调控细胞周期、孕酮介导的卵母细胞成熟、细胞色素P450对外源性药物代谢、视黄醇代谢等。靶点蛋白相互作用网络及生存分析得到MAPK3、CDK1、PLK1等8个与肝癌患者预后密切相关的核心靶点基因。分子对接结果显示,洋椿苦素、桑色素、辛酸丁酯等活性成分与8个预后相关核心靶点具有较强的结合力。结论 西黄丸中的活性成分可通过作用于MAPK3、CDK1、PLK1等肝癌预后相关靶点调节多条信号通路,发挥治疗肝癌及延长肝癌患者生存期的作用。
- 冯文敏吴铠悦黄月萍刘亚茹赵洪波刁勇朱亚玲
- 关键词:西黄丸肝癌差异表达基因网络药理学生物信息学
- 泛素结合酶E2S在肝细胞肝癌中的表达及其与预后的关系被引量:2
- 2019年
- 目的探讨泛素结合酶E2S(UBE2S)在肝细胞肝癌(HCC)中的表达及预后意义。方法利用Oncomine、GEPIA分析UBE2S在HCC组织中的表达情况,利用GEPIA分析UBE2S与HCC患者生存期的相关性,通过STRING工具分析UBE2S的蛋白相互作用网络。结果UBE2S mRNA在HCC组织中高表达,且与HCC预后呈负相关(P<0.001),UBE2S蛋白在HCC组织中的表达高于正常肝组织。结论UBE2S在HCC组织中高表达,其表达水平与肝癌的预后有明显关联。
- 蒋保三赵洪波朱亚玲王刚张越美刁勇
- 关键词:肝细胞肝癌预后
- 三七-白及药对作用机制的网络药理学分析被引量:10
- 2020年
- 通过网络药理学的方法,研究三七-白及药对在疾病治疗过程中潜在的药理作用机制.采用TCMSP数据库筛选三七-白及药对的活性成分和作用靶点,并用Uniprot数据库校正靶点信息得到靶点基因,利用CTD数据库获得靶点基因相关的疾病类型,通过STRING数据库构建靶点蛋白相互作用网络,分析得到核心蛋白,运用DAVID数据库富集分析靶点基因参与的基因本体论(GO)生物学过程及京都基因与基因百科全书(KEGG)通路.共筛选得到17个活性成分,涉及193个作用靶点.结果表明:槲皮素、β-谷甾醇和豆甾醇的作用靶点数目最多;靶点基因与35类疾病相关,主要包括癌症、神经系统疾病、心血管疾病等;蛋白相互作用网络分析得到核心蛋白AKT1,MAPK1,c-Jun,P53,TNF等;靶点基因主要涉及药物反应,RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等91条GO生物学过程,KEGG通路显著富集到癌症通路、乙型肝炎等66条通路,与前述疾病分析结果相符.
- 朱亚玲杨紫薇高佳慧陈建美陈璐孔雅珍刁勇
- 关键词:白及网络药理学活性成分
- 基于数据挖掘分析KIF2C在肝细胞癌的表达及临床意义被引量:3
- 2019年
- 目的:通过数据挖掘分析肝细胞癌中KIF2C基因的表达并探讨其临床意义。方法:使用Oncomine和GEPIA数据库分析KIF2C在肝细胞癌组织中的表达情况;通过GEPIA数据库进行KIF2C的表达程度与病理分级及肝细胞癌生存期的相关性分析;最后利用STRING数据库分析与KIF2C相互作用的蛋白。结果:通过Oncomine和GEPIA数据库分析显示,在mRNA水平上,KIF2C在肝细胞癌中显著高表达(P=0.000),表达水平与其预后为负相关(P=0.000),且肝癌病理分级越高,KIF2C表达水平越高。通过STRING数据库分析显示与KIF2C相关的蛋白有PLK1、AURKB、CENPA等。结论:通过对肿瘤基因数据库进行挖掘发现,KIF2C在肝细胞癌组织中明显高表达且与患者预后相关,为肝细胞癌的致病机制研究和抗肿瘤靶向治疗提供了理论支持。
- 张越美赵洪波朱亚玲蒋保三王刚何春艳
- 关键词:肝细胞癌数据库分析
- 基于数据库分析肝细胞癌细胞XPO5基因水平变化及其临床意义被引量:1
- 2019年
- 目的利用数据库分析肝细胞癌(HCC)组织核转运蛋白XPO5基因水平及其与患者预后的关系。方法在Oncomine数据库,分析HCC组织XPO5基因水平,并在GEPIA数据库中选择TCGA数据进行验证。在MethHC数据库分析HCC组织XPO5基因甲基化水平。在GEPIA的TCGA数据库,分析XPO5基因水平对HCC患者生存期的影响以及不同病理学分级的HCC组织XPO5基因水平差异。在STRING数据库分析与XPO5相互作用的蛋白种类。结果与正常肝组织比,HCC组织XPO5基因呈高水平(P<0.01),且在病理学分级为III级组织XPO5基因水平最高;HCC组织XPO5基因高水平患者总体生存期和无病生存期较低水平患者显著缩短,差异具有统计学意义(P<0.01);HCC组织XPO5基因较正常肝组织甲基化水平显著降低,差异具有统计学意义(P<0.005),甲基化降低区域主要位于基因体区域;蛋白相互作用网络分析显示,XPO5与DICER1和RAN等蛋白相互作用,并参与了miRNA的调控。结论XPO5基因在HCC组织中呈高水平状态,这种高水平状态可能与癌组织不同病理学分级有关,并影响患者的生存期。采用数据库进一步挖掘分析研究结果可能为临床采用生物学方法HCC患者提供参考依据。
- 王刚赵洪波朱亚玲蒋保三张越美刁勇
- 关键词:病理学分级生存期数据库