于晓飞
- 作品数：1 被引量：8H指数：1
- 供职机构：鲁东大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 香菇EST资源的SSR信息分析被引量：8
- 2010年
- 对来源于NCBI公共数据库的12144条香菇(Lentinus edodes)EST序列进行简单重复序列SSR搜索。结果表明:在这些香菇EST序列中共有359个SSR位点,46种SSR的重复单元,其中2碱基重复243条(67.69%),3碱基重复114条(31.76%),5碱基重复1条(0.28%),6碱基重复1条(0.28%)。平均33.8条EST序列中有1个SSR。SSR的碱基总数达7727kb,约占整个EST序列碱基数的2.94%。本实验还根据搜索结果设计了100条香菇EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以4个野外采集的香菇DNA为模板,对引物进行了筛选与评价,有16对引物有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中11对引物的产物存在遗传多态性。结果表明本实验设计开发的香菇的EST-SSR标记是可行且有效的。
- 王艳芳赵彦宏王爱云王芹芹刘林德周瑞莲于晓飞
- 关键词：香菇SSREST引物
