王博
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 供职机构：杭州师范大学生命与环境科学学院更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 三叶青扩展蛋白家族基因全长cDNA的克隆及其生物信息学和表达分析被引量：2
- 2016年
- 目的克隆三叶青Tetrastigma hemsleyanum的扩展蛋白家族基因,对其进行器官表达分析,并初步探讨其功能。方法根据Gen Bank中登录的扩展蛋白基因保守区域序列设计1对简并引物,以三叶青球形块根c DNA为模板进行RT-PCR扩增,再结合RACE技术,获得三叶青扩展蛋白基因全长c DNA序列,命名为Th-exp。采用半定量RT-PCR和荧光定量PCR分析Th-exp基因在不同器官中的表达情况。结果克隆获得扩展蛋白家族基因,共782 bp,其中包含630 bp开放阅读框,编码209个氨基酸(Gen Bank登陆号KP693606)。Th-exp编码的蛋白质具有典型的扩展蛋白结构特征,N端含有8个半胱氨酸的结构域,C端含有4个保守的色氨酸结构域,中间含有组氨酸功能域。Blast分析显示,Th-exp与葡萄、醉蝶花中扩展蛋白基因具有相似性。半定量RT-PCR和荧光定量PCR分析表明,Th-exp在三叶青叶、茎、普通细根和球形块根中均有表达,但球形块根中表达强于其他器官。结论克隆得到三叶青扩展蛋白家族基因Th-exp全长c DNA,初步预测其参与了三叶青块根的发育过程。
- 宋亚玲向太和武盼王博李姣姣张挺
- 关键词：克隆块根
- 三叶青两个肌动蛋白基因片段的克隆及其分析被引量：2
- 2015年
- 根据GenBank中登录的植物肌动蛋白保守序列设计1对引物,对三叶青的块根进行RT-PCR,在1次扩增中得到2个不同的肌动蛋白基因片段,分别命名为ThAct1和ThAct2.测序结果显示:ThAct1基因片段长度为867bp,编码252个氨基酸;ThAct2基因片段长度为1 079bp,编码152个氨基酸.经Blast分析,ThAct1和ThAct2基因均属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin superfamily家族,与其它物种Actin基因序列和编码的蛋白质均具有同源性.RT-PCR结果初步表明:在茎、普通根和块根中ThAct1和ThAct2基因的表达未见差异;但在叶中,ThAct1的表达稍强,而ThAct2的表达稍弱.另外,在茎、普通根和块根中,ThAct1表达比ThAct2强;但在叶中ThAct1表达比ThAct2弱.结果为分析肌动蛋白基因在三叶青块根发育中的功能奠定了基础;获得的肌动蛋白也可以作为内参基因,在三叶青功能基因组的研究中用于其它基因的定量表达分析.
- 黄连香宋亚玲向太和孙扬武盼王博
- 关键词：肌动蛋白基因克隆
