黄茉莉
- 作品数：6 被引量：10H指数：2
- 供职机构：苏州大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学更多>>
- U12型内含子研究
- 2019年
- U12型内含子是一类罕见的内含子,主要存在于植物、脊索动物和一些无脊椎动物在内的多种高等真核生物。U12型内含子的剪接依赖于一种次要剪接体U12型剪接体。由于U12型剪接体的剪接效率明显低于主要剪接体U2型剪接体,从而对靶基因形成限速机制,影响靶基因的时空表达。近期的研究不断揭示U12型内含子在机体发育、分化和疾病的发生发展中发挥着重要作用。立足于最新的研究进展,对U12型内含子的特性、剪接机制、数据库资源及其对相关疾病的影响展开叙述。
- 李旖旎罗晓琦黄茉莉
- 关键词：剪接转录调控
- 大数据思维在教学中的有效运用
- 2020年
- 大数据时代的到来使人们的学习、工作及生活方式发生了改变.大数据信息种类丰富、信息规模庞大.大数据指的是通过云计算对数据进行分析处理,从庞大的数据中整理出具有高价值的信息,从而为用户的决策提供辅助功能.大数据技术在教育领域中的应用使教学质量得以提升.本文阐述大数据定义,对大数据对高校学生管理的重要性进行分析,并提出大数据应用在高校学生管理中的有效策略.
- 黄茉莉
- 关键词：大数据教育领域
- 家蚕核型多角体病毒水平转移基因分析被引量：6
- 2011年
- 为了探讨杆状病毒基因组的遗传进化模式,文章利用家蚕核型多角体病毒(BmNPV)和其宿主家蚕全基因组数据,进行了全基因组的同源性搜索和系统进化分析,结果显示,BmNPV的几丁质酶(Chi)基因、凋亡抑制蛋白3(IAP3)基因和尿苷二磷酸葡萄糖转移酶(UGT)基因为水平转移基因。这3个基因都来源于其宿主昆虫。通过核苷酸组成、密码子偏好性、选择压力等基因特征分析,发现BmNPV水平转移基因与其基因组序列存在明显差异,进一步验证水平转移基因的外源性。对3个水平转移基因的功能分析发现它们有利于杆状病毒在宿主昆虫中的侵染与繁殖,并提高杆状病毒在昆虫中的生存能力。
- 段海蓉丘德彬贡成良黄茉莉
- 关键词：家蚕核型多角体病毒家蚕杆状病毒
- 基于RNA-Seq技术检测分析家蚕卵巢发育高表达基因被引量：3
- 2013年
- 为了从分子水平解析家蚕卵巢发育和卵子发生的机制,对家蚕卵巢组织进行深度RNA测序,并对高表达基因进行KEGG通路富集分析。取5龄3 d、5龄6 d及化蛹2 d的家蚕卵巢分别抽提RNA,并合成cDNA,将3组样品混合后进行RNA-Seq测序,得到的总reads条带数为6 306 078,平均长度为100 bp,其中clean reads达到98.87%,测序饱和度良好,证明测序数据真实可靠。clean reads对应的基因数为9 609个。以家蚕Actin3基因为参照,计算所测基因的log2(Fold_change),将log2(Fold_change)>2的基因定义为高表达基因,共有66个基因为高表达基因。利用KEGG通路富集分析发现这些基因主要集中在能量代谢、蛋白质合成、信号转导等路径中。研究结果为理解家蚕卵巢发育及卵子的发生提供了新的线索。
- 宋作伟黄茉莉薛仁宇曹广力贡成良
- 关键词：家蚕卵巢
- 生物类专业生物信息学教学初探被引量：1
- 2014年
- 随着大数据时代的到来,面向生物类专业的生物信息学教学也随之发生变化。授课范围由传统"面面俱到"的灌输式教学向紧跟科研发展的数据挖掘和大数据处理倾斜;授课方式由单一的理论学习转为与上机操作相结合,并采用案例分析将教学内容系统、完整地衔接和串联。本文根据笔者的教学实践,以两个案例教学为中心,从教学手段、考核方式等方面展开阐述和讨论。
- 黄茉莉
- 关键词：生物信息学案例教学生物类专业
- 基于RNA-Seq分析幼虫5龄期至化蛹初期家蚕卵巢发育中的细胞进程相关基因
- 2013年
- 细胞进程(cellular processes)包括物质转运和分解代谢、细胞运动、细胞生长和死亡及细胞通讯。为了解细胞进程相关基因对家蚕卵巢发育的影响,对幼虫5龄期至化蛹初期的家蚕卵巢组织进行转录组测序(RNA-Seq)。将去除低值序列的clean reads定位到来自家蚕的参考mRNA序列后,经过京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现,5龄至化蛹初期的家蚕卵巢中约有405个与细胞进程相关的基因,并包含与果蝇卵巢发育相关基因高度同源的基因。在这些基因中,与细胞的物质运输和代谢过程相关的基因有198个,与细胞运动相关的基因有22个,与细胞的生长和死亡相关的基因有109个,与细胞通讯相关的基因有76个。推测家蚕卵巢中的这些基因的功能与果蝇中的同源基因功能类似。研究结果为解析家蚕的卵巢发育及卵子发生的分子机制提供了新线索。
- 殷亚娟曹广力黄茉莉薛仁宇贡成良
- 关键词：家蚕卵巢发育卵子发生
