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丰琳琅

作品数:3 被引量:2H指数:1
供职机构:青海大学农牧学院更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学

主题

  • 1篇蛋白结构
  • 1篇多杀性
  • 1篇多杀性巴氏杆...
  • 1篇遗传密码
  • 1篇遗传密码子
  • 1篇密码子
  • 1篇杆菌
  • 1篇巴氏杆菌
  • 1篇PREDIC...
  • 1篇STRUCT...
  • 1篇O
  • 1篇STRAIN

机构

  • 3篇青海大学

作者

  • 3篇张瑞强
  • 3篇繁萍
  • 3篇丰琳琅
  • 3篇陈忍霞
  • 3篇张卫
  • 2篇赵静

传媒

  • 1篇黑龙江畜牧兽...
  • 1篇安徽农业科学
  • 1篇Agricu...

年份

  • 3篇2012
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
多杀性巴氏杆菌的遗传密码子偏好性初步分析
2012年
为了研究多杀性巴氏杆菌的遗传密码子偏好性,试验以GenBank中登录的27条多杀性巴氏杆菌功能基因的CDS序列为材料,利用CodonW软件初步分析了多杀性巴氏杆菌密码子的偏好性。结果表明:UUU、UUA、CUU、AUU、GUU、GUA、UCU、UCA、AGU、AGC等28个密码子为多杀性巴氏杆菌的偏好性密码子。
张瑞强繁萍丰琳琅张卫陈忍霞
关键词:多杀性巴氏杆菌遗传密码子
PmC47-8株OmpH蛋白结构的初步预测被引量:2
2012年
[目的]初步预测牦牛源多杀性巴氏杆菌C47-8株(PmC47-8)OmpH蛋白结构特点。[方法]对PmC47-8型菌株OmpH基因的测序结果进行在线BLAST比对、信号肽预测、二级结构预测及蛋白特性等方面的分析。[结果]PmC47-8株OmpH基因与已公布的81条OmpH基因相似性在84%~99%间;OmpH蛋白序列中存在信号肽,切割位点在第20号和21号氨基酸残基之间;OmpH蛋白二级结构预测中,折叠结构占49.8%,环状结构占50.2%;推测OmpH蛋白有7个O型糖基化位点,分别是位于第2、45、48、330、716、721、723号位的氨基酸残基,2个N型糖基化位点,即第15和35号位的氨基酸残基。[结论]该蛋白可能存在于细胞菌膜的外侧,而非跨膜蛋白。
繁萍张瑞强张卫丰琳琅陈忍霞赵静
Prediction of Protein OmpH in Structure of C47-8 Pasteurella multocida
2012年
[Objective] This study aimed to predict the structure of protein OmpH from Pasteurella multocida C47-8 (PmC47-8) strain of yak. [Method] Online BLAST, signal peptide prediction, secondary structure prediction and protein characteristics of sequencing result of gene OmpH from PmC47-8 strain were analyzed. [Result] The similarities of gene OmpH from PmC47-8 with the published 81 OmpH genes were between 84% and 99%; a signal peptide was found with the cleavage sites between 20 and 21 in the polypeptide; secondary structure prediction showed that folding structure accounted for 49.8% and loop structure for 50.2%; it predicted that there were 7 O-glycosylation sites in OmpH protein with the amino acid residual sites of 2, 45, 48, 330, 716, 721, 723, respectively, and 2 N-glycosylation sites with the amino acid residual sites of 15 and 35. [Conclusion] This study lays the foundation for the study on the immunity of OmpH gene from yak.
繁萍张瑞强张卫丰琳琅陈忍霞赵静
关键词:PREDICTION
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