刘霜
- 作品数：10 被引量：46H指数：4
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省应用基础研究计划项目国家级星火计划四川省科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 藏绵羊KAP3.2基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达的研究被引量：6
- 2014年
- 为研究藏绵羊角蛋白相关蛋白(KAP3.2)基因结构与功能,揭示该基因的组织特异性表达规律.以藏绵羊为研究对象,分别提取藏绵羊心、肝、脾、肾及皮肤组织中总RNA,并以此为模板,通过RT-PCR技术对藏绵羊KAP3.2基因的c DNA进行克隆、序列分析;利用Real-time PCR技术进行组织表达研究.结果表明:藏绵羊KAP3.2基因编码区全长297bp,编码98个氨基酸;藏绵羊与普通绵羊、山羊、藏羚羊、草原鼠、家鼠、人的相应核苷酸同源性分别为99%、97%、96%、79%、75%、73%;藏绵羊KAP3.2基因在皮肤中高表达,而在其它组织中相对表达量较低,说明该基因的表达具有组织特异性.
- 杨珂伟胡亮罗斌刘霜郑玉才字向东
- 关键词：藏绵羊克隆REAL-TIMEPCR
- 山羊B4GALNT2基因的cDNA克隆及组织表达研究被引量：3
- 2016年
- 根据绵羊β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(B4GALNT2)(登录号:KC175557)的mRNA序列设计引物,通过RT-PCR技术对高繁金堂黑山羊和单胎藏山羊卵巢组织B4GALNT2基因c DNA进行克隆、序列分析;采用Real-time PCR技术对发情前期山羊卵巢、子宫、输卵管、垂体、肝脏组织中的B4GALNT2基因的表达进行研究。结果表明:山羊B4GALNT2基因编码区全长为1 521 bp,共编码506个氨基酸,2个品种间有6处碱基差异,导致4处氨基酸差异。B4GALNT2基因mRNA在2个山羊品种卵巢、子宫、输卵管、垂体、肝脏中均有表达,在金堂黑山羊子宫和输卵管的表达量显著高于藏山羊(P<0.05)。说明B4GALNT2基因在动物进化中比较保守,与山羊多羔性状的相关性有待进一步研究。
- 刘霜卢建远马力夏威胡亮罗斌杨珂伟字向东
- 关键词：山羊克隆
- 山羊Apaf-1和Apaf-2基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达被引量：2
- 2015年
- 采集5只多胎金堂黑山羊和5只单胎藏山羊在发情期的卵巢、垂体等组织样,进行Apaf-1和Apaf-2基因的c DNA克隆、序列分析,以及定量PCR技术对其mRNA进行组织表达量研究。结果表明,克隆出Apaf-1基因长度为3 750 bp,编码1 249个氨基酸,Apaf-2基因编码区全长为318 bp,编码105个氨基酸。这两个基因在两种山羊中序列相同,没有突变,且在5种组织中的表达均无差异。表明凋亡基因Apaf-1和Apaf-2在动物的进化中比较保守,与山羊多羔性状的相关性需要进一步研究。
- 罗斌卢建远马力胡亮刘霜杨珂伟字向东
- 关键词：山羊APAF-1基因定量PCR
- 山羊MSH4和MSH5基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达
- 2016年
- 以低繁藏山羊和高繁金堂黑山羊为研究对象,分别提取处于发情期的5只藏山羊和5只金堂黑山羊的卵巢、子宫、输卵管、垂体的总RNA,并通过RT-PCR技术对MSH4、MSH5基因c DNA进行克隆、序列分析,以Real-time PCR技术对其进行组织表达研究。结果表明,藏山羊和金堂黑山羊MSH4基因编码区均长2 499 bp,编码832个氨基酸,两品种基因编码区有5处碱基不同,并导致3处氨基酸的差异;MSH5基因编码区均长2 496 bp,编码831个氨基酸,两品种基因编码区有9处碱基不同,并导致5处氨基酸的差异。藏山羊MSH4基因编码区核苷酸序列与金堂黑山羊、山羊、绵羊、牛、马、小鼠、褐家鼠、人的同源性分别为:99.8%、99.8%、99.4%、98.1%、94.4%、85.1%、84.7%和93.5%;藏山羊MSH5基因编码区核苷酸序列与金堂黑山羊、山羊、牛、家犬、小鼠、褐家鼠、人的同源性分别为:99.6%、99.6%、97.3%、88.0%、85.8%、85.3%和90.2%。MSH4和MSH5基因m RNA在两个山羊品种的卵巢、子宫、输卵管、垂体中均有表达,但两品种间无显著性差异(P>0.05)。说明MSH4和MSH5基因在动物进化中比较保守,与山羊多羔性状的相关性有待进一步研究。
- 郑杰刘霜罗斌胡亮杨珂伟字向东
- 关键词：藏山羊金堂黑山羊克隆定量PCR
- 山羊INHA和INHBA基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达研究被引量：4
- 2015年
- 分别提取处于同一发情周期的5只低繁藏山羊和5只高繁金堂黑山羊的卵巢、垂体的总RNA,并通过RT-PCR技术对INHA、INHBA基因cDNA进行克隆、序列分析,以Real-time PCR技术对其进行组织表达研究.结果表明:藏山羊和金堂黑山羊INHA基因编码区均长1083bp,编码360个氨基酸,两品种基因编码区有7处碱基不同,并导致3处氨基酸的差异;INHBA基因编码区均长1278bp,编码425个氨基酸,两品种基因编码区有4处碱基不同,并导致1处氨基酸的差异.藏山羊INHA基因编码区核苷酸序列与金堂黑山羊、绵羊、牛、野猪、小鼠、褐家鼠、人的同源性分别为:99.4%、98.9%、95.8%、88.6%、81.0%、79.5%和84.8%;藏山羊INHBA基因编码区核苷酸序列与金堂黑山羊、绵羊、牛、野猪、小鼠、褐家鼠、人的同源性分别为:99.7%、99.4%、98.1%、91.7%、88.0%、88.5%和91.2%.INHA和INHBA基因mRNA在两个山羊品种的卵巢、垂体中均有表达,但两品种间无显著性差异(P>0.05).说明INHA和INHBA基因在动物进化中比较保守,与山羊多羔性状的相关性有待进一步研究.
- 郑杰刘霜罗斌字向东
- 关键词：藏山羊金堂黑山羊INHA
- 犏牛体外受精胚胎的发育转录组分析被引量：2
- 2018年
- 本研究旨在探讨犏牛早期胚胎发育调控机制,为提高犏牛胚胎体外生产效率提供理论基础。以娟珊牛精子体外受精(IVF)牦牛卵母细胞获得的2-、4-、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个阶段的杂种胚胎分别提取总RNA,采用Smart-Seq2扩增、构建测序文库,应用RNA-Seq技术进行高通量测序分析。对HiSeqTM2500测序所得的Raw Reads进行数据过滤后,得到5个发育阶段的犏牛早期胚胎的Clean Reads为47 791 850~63 332 216条,有80.00%~91.13%比对上参考基因的序列。4-细胞期表达的基因数最多(15 400),而桑椹胚表达的基因数最少(9 604)。以log2ratio≥1,Q-value<0.05为阈值,获得2-~4-细胞、4-~8-细胞、8-细胞~桑椹胚及桑椹胚~囊胚4个发育阶段的差异表达基因(DEGs)分别为3 690、6 332、8 965和10 298个。GO分析表明,4个发育阶段的DEGs归类注释都涉及生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3大类67个二级条目。KEGG分析表明,牦牛早期胚胎发育过程中DEGs富集的主要通路有剪接体(Spliceosome)、神经活性配体-受体互作(Neuroactive ligand-receptor interaction)、细胞因子及其受体相互作用(Cytokine-cytokine receptor interactions)、泛素介导的蛋白水解(Ubiquitin mediated proteolysis)、RNA转运(RNA transport)等通路。本研究利用RNA-Seq技术对犏牛体外受精胚胎在发育不同阶段转录组进行了分析,获得了众多差异基因和有关通路的富集,为完善犏牛胚胎体外生产技术提供了理论基础。
- 字向东刘霜夏威熊显荣黄林张正帆李志雄李键钟金城王利朱江江
- 关键词：犏牛体外受精胚胎转录组RNA-SEQ
- 山羊ZP3基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达研究被引量：1
- 2015年
- 对高繁金堂黑山羊和低繁藏山羊ZP3基因c DNA进行克隆、序列分析,并采用Real-time PCR技术对其在发情前期母羊卵巢组织的表达进行研究.结果表明:山羊ZP3基因编码区全长为1269bp,共编码422个氨基酸,两品种间有2处碱基差异,但未导致氨基酸的差异.山羊的ZP3基因在卵巢表达量高,与其他组织差异极显著(P<0.01),但两个品种间差异不显著(P>0.05).说明ZP3基因主要在卵巢中表达,但可能不是影响山羊多羔性状的主基因.
- 刘霜卢建远马力夏威胡亮罗斌杨珂伟字向东
- 关键词：山羊ZP3克隆
- 山羊卵巢中BMP15、GDF9和BMPR1B基因的表达量研究被引量：17
- 2016年
- 山羊产羔数是影响山羊产业的重要性状,因此高产羔数是增加经济效益的有效方式。本文旨在筛选出影响高繁金堂黑山羊多胎主效基因,并探讨影响这两品种山羊多羔性状的分子调控机制。以发情前期的5只高繁金堂黑山羊和5只低繁藏山羊的卵巢组织为材料,提取总RNA,通过RT-PCR技术合成c DNA,采用实时荧光定量PCR技术,检测金堂黑山羊和藏山羊卵巢组织BMP15、GDF9和BMPR1B基因表达量。金堂黑山羊和藏山羊GDF9和BMPR1B基因mRNA在卵巢中的表达量差异不显著,而BMP15基因mRNA在卵巢中的表达量差异显著(P<0.05)。说明卵巢中BMP15基因的表达量与金堂黑山羊多羔性状相关。
- 刘霜郑杰卢建远马力夏威胡亮罗斌任陶任称罗尔日字向东
- 关键词：山羊卵巢BMP15
- 山羊Apaf-3基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达研究被引量：2
- 2015年
- 对单胎藏山羊和多胎金堂黑山羊Apaf-3基因cDNA克隆、序列分析及组织表达特性研究.采集5只多胎金堂黑山羊和5只单胎藏山羊在发情期的卵巢、垂体等组织样,进行Apaf-3基因的cDNA克隆、序列分析,并采用定量PCR技术对其mRNA进行组织表达量研究.结果,克隆出山羊Apaf-3基因长度为1731bp编码区全长为1245bp,编码414个氨基酸.Apaf-3基因在两种山羊中序列相同,且在5种组织中的表达均无差异.同源性分析表明凋亡基因Apaf-3在动物的进化中保守性低,与山羊多羔性状的相关性需要进一步研究.
- 罗斌卢建远马力胡亮刘霜杨珂伟字向东
- 关键词：山羊定量PCR
- 绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌双重PCR检测方法的建立及应用被引量：11
- 2013年
- 根据绵羊肺炎支原体hsp70基因和多杀性巴氏杆菌sp6基因分别设计引物,建立了绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的双重PCR检测方法,优化条件后进行特异性和敏感性评价,并对160份临床样本进行了检测。结果显示,绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌引物的最佳终浓度分别为30pmol/L和10pmol/L。该方法的特异性较好,对其他无关病原不检出。对绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的检测下限分别为4.4pg和22pg,与独立PCR的敏感性相同。临床样本的检测结果显示,该方法对绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌的检出率分别为50.6%和47.5%。结果表明,本研究建立的双重PCR方法具有特异性好、敏感性高等特点,为临床上绵羊肺炎支原体和多杀性巴氏杆菌混合感染的快速检测、鉴定以及流行病学调查提供了有用的工具。
- 冯旭飞刘霜张贤宇王成龙匡学谦杨发龙汤承王永
- 关键词：绵羊肺炎支原体多杀性巴氏杆菌双重PCR
