张亚琦
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
- 供职机构：青海大学农林科学院更多>>
- 发文基金：国家科技部农业科技成果转化资金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 青海高原西伯利亚白刺天然居群表型多样性研究被引量：3
- 2013年
- 以青海高原5个西伯利亚白刺天然居群为研究对象,对其8个表型性状进行了方差分析、相关分析、主成分分析与聚类分析,探讨了居群间与居群内表型多样性的变异特点,以揭示其天然居群的表型变异程度及变异规律。结果表明:各性状在居群间存在显著差异,居群间的变异是青海高原西伯利亚白刺表型总变异的主要部分。相关性分析表明,各环境因子中,年均降水量对性状的影响最大,其次为日照时数和年均温度。主成分分析表明,果形系数、核形系数、果序重、鲜果百粒重等性状是主要影响因素。聚类分析显示,西伯利亚白刺的5个天然居群可以初步分为2类,第1类为宗加居群、夏日哈居群、诺木洪居群,第2类为可鲁克湖居群与戈壁车站居群。
- 张亚琦王宁赵越孙奎邹林有李孝繁
- 关键词：天然居群表型多样性
- 菊芋果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析被引量：2
- 2020年
- 果聚糖是菊芋的主要贮藏物质,其代谢与产量形成和逆境适应性密切相关。为了解菊芋果聚糖合成代谢的机制,本研究以‘青芋1号’为研究对象,利用同源克隆方法,对果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析。结果表明,1-SST基因全长为3 925 bp,CDS大小为1 890 bp,由5个内含子和6个外显子组成。经生物信息学分析,预测1-SST蛋白分子量70 934.40 Da,等电点5.10,有两个属于糖基水解酶32家族的保守区,属于亲水性蛋白,以延伸结构(24.48%)和无规则卷曲(56.76%)为主要二级结构,在质膜外行使功能。系统进化分析表明,菊芋1-SST基因与向日葵遗传距离最近,与龙舌兰等不同科不同属的植物进化距离较远。本研究基于对菊芋中调控果聚糖合成代谢1-SST基因的克隆与生物信息学分析,为高等植物果聚糖代谢途径研究奠定一定的理论基础。
- 高洁铭杨世鹏王丽慧张亚琦王艳萍孙雪梅
- 关键词：生物信息学分析
