慎佩晶
- 作品数:25 被引量:46H指数:4
- 供职机构:浙江省淡水水产研究所更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划浙江省重大科技专项基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 一种罗氏沼虾个体标记方法
- 一种罗氏沼虾个体标记方法,包括以下步骤:S1、标记前期准备:采购植入式玻璃管封装RFID芯片标签、配套注射器或注射设备、动物组织粘合剂以及薄塑料膜圆片;将待标记虾暂养至3cm长度以上,该长度从眼柄根部至尾节末端;S2、待...
- 孟纪伦慎佩晶高强李喜莲徐宾朋程海华徐洋
- 一种罗氏沼虾个体标记方法的配套组合消毒方法
- 一种罗氏沼虾个体标记方法的配套组合消毒方法,包括以下步骤:S1、注射器械的消毒:将RFID芯片装入注射器内并置于无菌袋后封装,使用中小型环氧乙烷灭菌器进行灭菌,环氧乙烷浓度为800‑1000mg/L,灭菌温度为55‑60...
- 慎佩晶孟纪伦高强李喜莲程海华徐宾朋徐洋黄振远
- 5个罗氏沼虾群体微卫星遗传多样性分析被引量:2
- 2020年
- 选用9对微卫星引物,利用毛细管电泳荧光检测技术对收集和引进的罗氏沼虾以色列群体、缅甸群体、孟加拉群体、核心群体和泰国群体共计127个个体的遗传多样性进行分析,进一步明确了4个地方群体与核心群体之间的遗传差异和亲缘关系,可为优良种质的创制和新品种选育提供参考。研究表明,9对引物在127个样品DNA中共扩增出70个等位位点,平均每对引物为7.7778个。5个群体遗传相似系数为0.3674~0.7965,平均遗传相似系数为0.5541;其中孟加拉群体和核心亲缘关系最近(相似系数为0.7965),孟加拉群体和以色列亲缘关系最远(相似系数为0.3674)。研究结果表明,这5个地理种群总体遗传多样性较高,各群体之间的亲缘关系为后续杂交育种提供理论依据。
- 慎佩晶张宇飞李喜莲徐洋程海华陈雪峰
- 关键词:罗氏沼虾微卫星标记
- 罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)幼体病原肠杆菌PCR检测技术的建立与应用被引量:4
- 2015年
- 根据罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)幼体培育期主要细菌性病原阴沟肠杆菌omp A基因序列、产气肠杆菌gry B基因序列设计特异性引物,通过对PCR扩增产物进行测序鉴定与特异性和敏感性试验,建立了两种病原菌的PCR快速检测方法,并对发病样品进行了检测。结果显示,设计的阴沟肠杆菌与产气肠杆菌检测引物能分别扩增出与预计大小一致的385 bp和201 bp的特异性片段,与其余供试菌株无交叉反应。两种检测方法的灵敏度分别为103 CFU/ml和102 CFU/ml。罗氏沼虾幼体样品的检测结果与实际发病情况一致,建立的检测方法也可直接对样品进行PCR检测,而无需细菌分离培养。本研究建立的阴沟肠杆菌与产气肠杆菌PCR检测方法具有较高的特异性与灵敏度,可缩短检测时间,该方法的建立对罗氏沼虾幼体病原的快速诊断、分子流行病学的调查及无特定病原(SPF)群体的建立具有重要意义。
- 陈雪峰杨国梁高强夏正龙濮剑威慎佩晶黄振远
- 关键词:罗氏沼虾阴沟肠杆菌产气肠杆菌PCR检测
- 一种适用于养殖场商品药物的药敏实验方法
- 本发明涉及药敏实验技术领域,具体是一种适用于养殖场商品药物的药敏实验方法,步骤如下:S1、材料准备;S2、实验物料制备;S3、待测菌株接种物制备;S4、接种平板;S5、打孔器打孔;S6、药液注射;S7、孵育;S8、观察结...
- 慎佩晶高强孟纪伦李喜莲徐洋程海华彭菲
- 罗氏沼虾Rab11基因cDNA克隆及其组织表达分析被引量:2
- 2016年
- 为了发掘罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)免疫相关基因,研究Rab蛋白(Ras-related proteins in brain)在罗氏沼虾免疫应答中发挥的作用,研究采用RACE-PCR技术克隆了罗氏沼虾Rab11基因全长c DNA序列,记为Mr Rab11。全长1381 bp,包括226 bp的5′UTR,511 bp的3′UTR和645 bp的开放阅读框,编码214个氨基酸,含有一个Rab结构域。氨基酸序列比对显示,罗氏沼虾与冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)、蚤状溞(Daphnia pulex)、叶蝉(Homalodisca vitripennis)Rab11一致性分别为82%、83%和82%。软件预测,Mr Rab11编码的蛋白分子量约为23.75 k D,等电点约为5.34。实时荧光定量表达分析表明,Mr Rab11基因在罗氏沼虾各组织中都有表达,肝胰腺中的表达量最高,其次是肌肉和肠道。在阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)感染12h后,罗氏沼虾肝胰腺中Mr Rab11的表达量上升,显著高于对照组(P<0.05),推测这是Mr Rab11对阴沟肠杆菌的应激表达,Mr Rab11在肝胰腺中参与了罗氏沼虾免疫应答过程。
- 夏正龙黄雪娜黄振远陈雪峰高强濮剑威慎佩晶彭菲杨国梁
- 关键词:罗氏沼虾免疫应答
- 基于RNA-seq技术的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)不同组织转录组比较分析被引量:1
- 2021年
- 罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)是我国重要的淡水虾养殖品种,为探讨罗氏沼虾不同组织基因表达差异,本研究使用Illumina Hiseq平台分析了罗氏沼虾的7个组织(眼柄、肝脏、卵巢、鳃、心脏、肌肉、精巢)转录组,质控后获得高质量的clean reads 36325476、56796932、36328098、51370140、45010606、43240160、42404294条,共计46.2 Gb的clean reads数据。测序结果经denovo组装共获得95220个Unigenes,每个Unigenes的平均长度为1064.9bp。经过生物信息学方法与五个数据库(NR,GO,COG,KEGG,SWSS-PRO)比对,共注释到20368个Unigenes。其中GO功能注释将Unigenes分为生物过程、细胞组分和分子功能3个大类50个分支;在与COG数据库比对中,共有15798条比对到了同源序列,且一共被分为25类;KEGG代谢通路包括6大类33个小类,可将Unigenes映射到330条代谢通路中。分子标记筛选后获得37751个潜在SSR位点,共发现3228575个SNP位点。本研究通过对罗氏沼虾7个不同组织进行转录组测序,数据组装及功能注释,为进一步深入挖掘和开发利用罗氏沼虾功能基因提供参考。
- 李喜莲顾志敏慎佩晶徐洋张宇飞高强程海华陈雪峰
- 关键词:罗氏沼虾转录组功能基因
- 一种基于罗氏沼虾转录组序列开发的引物组及其应用
- 本发明公开一种基于罗氏沼虾转录组序列开发的引物组及其应用,属于分子标记技术领域。本发明提供了用于罗氏沼虾遗传多样性分析的SSR分子标记引物组,包括8对引物;本发明还提供了所述SSR分子标记引物组的获取方法;本发明还提供了...
- 李喜莲陈雪峰顾志敏高强张宇飞慎佩晶徐洋蒋文枰徐宾朋程海华彭菲黄振远
- 文献传递
- 一种罗氏沼虾精子活性评价方法
- 本发明公开了一种罗氏沼虾精子活性评价方法,涉及生物活性评价领域。该评估方法高效快捷,可以大大加快罗氏沼虾精子以及卵子的研究;在配子的基本生物学研究,配子人工授精研究,冷冻保存配子等方面有重要应用价值;特别是卵子的活性评估...
- 黄振远张海琪慎佩晶高强郭建林原居林徐洋
- 罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)幼体新暴发病病原阴沟肠杆菌的分离鉴定被引量:11
- 2015年
- 2010年,浙江湖州部分罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)育苗场在幼体培育阶段,暴发了幼体大规模发病死亡的新病害。从2个育苗场6个发病育苗池的发病幼体匀浆液中分离得到6株优势生长菌株(编号为NTH01、NTH02、NTH03、316D、316X、316C),菌落形态较为一致。取代表菌株NTH01,以浸泡方式进行人工回感,结果菌株NTH01能够导致幼体发病死亡,且症状与生产表现一致。经形态学观察、生理生化鉴定、16S r RNA与gyr B基因序列系统发育关系构建,鉴定菌株NTH01为阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)。以阴沟肠杆菌omp A基因片段为靶序列,建立了PCR检测方法,对另外5株优势菌进行检测,结果该5株菌都是阴沟肠杆菌。2011年,对4个发病育苗场幼体与亲虾进行检测,结果发病幼体中分离的优势菌检测呈阳性,亲虾肝胰腺与肠道组织检测到该菌存在,但亲虾不表现病症。对30种抗生素的药敏试验结果表明,菌株NTH01对恩诺沙星、氧氟沙星、庆大霉素等6种抗生素敏感,对发病幼体进行针对性用药,效果明显。本试验结果表明,阴沟肠杆菌是导致罗氏沼虾育苗期间幼体大规模发病死亡的致病菌。
- 陈雪峰杨国梁高强夏正龙濮剑威慎佩晶黄振远
- 关键词:罗氏沼虾幼体阴沟肠杆菌药敏试验