张盈盈
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 供职机构：渤海大学数理学院更多>>
- 发文基金：辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划辽宁省“百千万人才工程”资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用被引量：2
- 2014年
- 随着人类和其它一些模式生物基因组计划的实施与完成,DNA序列的数量呈指数方式增长,这使得序列分析成为生物信息学的核心问题之一。众所周知,序列之所以称为"序列",自然而然地包含了2个重要因素:元素及其之间的序关系。本文介绍一种全新的考虑元素之间序关系的方法,首先将传统集合上的排列的逆序数推广到多重集上,从而提出带有重复元素的排列的逆序数的概念;在此基础上通过将数字1、2、3、4分别赋值给4个碱基,将DNA原始序列转化为多重集上的数字排列,进而借助逆序数构造出DNA序列的24维向量表示;基于3个数据集的系统发生分析,证实了该方法的有效性。
- 张盈盈李春杨闫贾美多
- 关键词：逆序数系统发生分析
- 蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用被引量：2
- 2014年
- 基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
- 贾美多杨闫张盈盈李春
- 关键词：系统发生分析
